Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_010468 | 261,688 | C→A | D273E (GAC→GAA) | ECOLC_RS01210 → | DUF4049 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_010468 | 261,688 | 0 | C | A | 99.8% | 2090.2 / NA | 543 | D273E (GAC→GAA) | ECOLC_RS01210 | DUF4049 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (265/277); total (266/277) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 543 total aligned reads displayed.
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gAACAGAAGAGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTAt > 1:5055812/1‑298 (MQ=255) agaagaGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTAGTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGAcc > 2:7412813/1‑298 (MQ=255) gaagaGACATTGTTTTAGAAAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGAccc < 1:4367957/298‑1 (MQ=255) 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AAAACCCCAGTTCGCTGACAGAACCTATTTCTCCAATTGTTCACCTGTTGATCCCACAAGTACCAGGCCGACCTATTTTGGCGATACCGATGGCTCAGTCGGTGCAGTTTTGTACGCGCTTTTTGCAACGGGACATTTGGGAATCATGGCTGAAGGAGAAAATTTCCTTAGCCAGTTGCTTAATATAGAAGATGAAGTTCTCAACGTATTGCTAAGGGAGAACTTTAATGAGCAACTTGACACTAATGTTAATATAATAATCAGTATCCTGAACAGAAGAGACATTGTTTTAGACAGTCTTCAGCCTTATTTGGTTATTAATAAAGACGCAGTCACGCCATGTACGTTTCTGGGCGACCAGACTGGCGATCGATTTAGTAATATCTGTGGCGATAAATTTATCATCGATTTATTAAAACGCATAATGAGTATCAATGAAAACGTTCATGTATTAGCTGGAAATCATGAAACGAATTGCAATGGTAACTATATGCAGAACTTCACGCGCATGAAACCACTTGATGAGGATACCTACTCTGGGATAAAAGATTATCCTGTATGTTTCTATGACCCCAAATACAAAATAATG > NC_010468/261394‑261982 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |