New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3949333 | 229 (1.190) | 219 (1.140) | 105/426 | NT | 48.9% | coding (1526/2340 nt) | bcsB | cellulose biosynthesis cyclic di‑GMP‑binding regulatory protein BcsB |
? | NC_007779 | 4056220 = | NA (NA) | intergenic (‑209/+15) | Y75_RS25055/Y75_RS20055 | hypothetical protein/IS1‑like element IS1A family transposase |
Only 100 of 461 total aligned reads displayed.
GATATCAGCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCATGTGGTGATTGGTGACGACTCCACCATCGACTTCTCGAAGTATTACCACTTCATCCCGATGCCGGATCTACGCGCCTTTGCTAACGCGGGCTTCCCATTCAGCCGGATGGCGGATCTGTCGCAAACCATCACCGTGATGCCGAAAGCGCCTAACGAAGCACAGATGGAAACGTTGCTGAATACTGTTGGTTTTATCGGCGCACAGACGGGCTTCCCGGCGATTAATCTGACGGTGA > NC_007779/3949095‑3949569 | tatCAGCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAt < 1:1253718/238‑1 (MQ=255) atCAGCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggt > 2:1138828‑M1/1‑236 (MQ=255) tCATCCTGAATAACCAGTGCCTGCAATCCTTCACCCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggta < 2:659884‑M1/239‑5 (MQ=255) aGCTTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCGGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaat < 2:1673880‑M1/239‑7 (MQ=255) gCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaatg > 1:1567214‑M1/1‑232 (MQ=255) gCCTGAATAACCAGTTCCTGCAATCATTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGAGCACCGCCTGCTGCTGCGAATTCCGGTATAACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACCGATGTCTCTATTCGGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGCGTATGTGAACCCGACGCCCGGCGGTTCGGTGGATAACTGTACGCCCTTCCAGCAGCTGCAGGATCAggtaatg > 2:452334‑M1/1‑232 (MQ=255) tGAATAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaatgact < 1:672902‑M1/239‑11 (MQ=255) aaTAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaatgactcc > 1:409572‑M1/1‑227 (MQ=255) aaTAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCATGTGGTGATTgg > 2:765891/1‑239 (MQ=255) aTAACCAGTTCCTGCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCATGTGGTGATTGGt < 2:2155861/239‑1 (MQ=255) 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gCAATCCTTCAACCTGAGCAGCAAACA‑GGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCGGTATTACAAGGTTTGCTGGATGGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCCGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCATGTGGTGATTGGTGACGACTccacca > 2:923542/1‑239 (MQ=255) ccTTCCACCGAAGCAGCAGACA‑TGTGTCGAACCGCCTGCTGCGGCGGAGTTCGGGATTACAAGGTTTGCTGGATTGCAAAACATATGTCTCGATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGCCCAACCAGCTGCGCTGCGACTTTGAGTATATGAACCCGATGCGGGGCGGTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 2:1181261‑M1/238‑31 (MQ=255) aaCCTGAGCAG‑AGACACGGAGGCGAACCGCCTGCTGCTGCGGATTCCCGTATTACAAGGTTTGCTGGATCGCAAAACAGATGTCTCTATTCCGGCGCTGAAACTGGGCGCGACCAACCAGCTGCGCTTCGACTTTGAGTATATGAACCCGGTGCCGGGCGTTTCGGTGGATAACTGTATTACCTTCCAGCCGGTGCAGAATCAggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:690067‑M1/239‑37 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |