| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4315466 | 219 (1.140) | 4 (0.020) | 3/414 | NT | 1.8% | coding (193/1533 nt) | Y75_RS21330 | D‑allose ABC transporter ATP‑binding protein AlsA |
| ? | NC_007779 | = 4315659 | 227 (1.210) | intergenic (‑1/+126) | Y75_RS21330/Y75_RS21335 | D‑allose ABC transporter ATP‑binding protein AlsA/D‑allose transporter substrate‑binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
TGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCTTCAGACCCGTTGCGCC > NC_007779/4315425‑4315895 | gCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCGGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCataaataa < 1:337033/239‑1 (MQ=255) ccGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCataaataa > 2:764410/1‑238 (MQ=255) ccGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCataaataa > 2:852576/1‑238 (MQ=255) tATGACCCTGCTTGTGATGCTTATTGTTATTAATGTTAATGGTGCCTTTGGTCGGTTCA‑TGTTTTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTCCCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCGGCa < 2:131851/239‑1 (MQ=255) cAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAata < 1:1822836/239‑1 (MQ=255) cAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAata > 2:874692/1‑239 (MQ=255) gCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCa < 2:1094225/230‑1 (MQ=255) ttATAGCGAATAGTATTAATGGTAATGGTGCCTTTTGGCGGCTCA‑TGTCTTCCGGATAAAAATTTCATAAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACAAGGATAAACCTTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATTGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGaaa < 2:1636701/230‑1 (MQ=255) cTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTg > 2:1478132/1‑237 (MQ=255) tAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCt < 1:1413625/239‑1 (MQ=255) tAATGTTATTAAGGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGTTAAGTGT‑TTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCt < 2:1663091/239‑1 (MQ=255) aaTGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTg < 1:1317609/239‑1 (MQ=255) tGTTCTTAATGGTAATGGTGCCTTTGGCCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTAACCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGtatta > 1:1636701/1‑230 (MQ=255) tGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGAt > 2:605122/1‑239 (MQ=255) ttattaATGGTAATGGTGCCTTTTGTCGGCTAA‑TTTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTACCCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 2:932513/239‑1 (MQ=255) ttattaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 1:1028729/239‑1 (MQ=255) tattaATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 1:852576/238‑1 (MQ=255) attaATGGTAATGGCGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCataaa > 1:375821/1‑198 (MQ=255) ggtaatggtGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACAttt > 2:157231/1‑239 (MQ=255) aatggtGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTAt < 1:812879/238‑1 (MQ=255) aatggtGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTATGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATc > 2:1503678/1‑239 (MQ=255) tggtGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTTTTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAg > 2:1389384/1‑239 (MQ=255) tGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGt < 1:838555/238‑1 (MQ=255) gCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATc > 1:1725806/1‑233 (MQ=255) tttGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATgg < 2:809224/219‑1 (MQ=255) tCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAg > 2:2032871/1‑239 (MQ=255) 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2:1979112/4‑239 (MQ=255) tGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACg > 2:1948694/1‑74 (MQ=255) tGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCgg > 2:768153/1‑239 (MQ=255) gACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTAt > 1:988309/1‑101 (MQ=255) aCCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGcatca > 1:317849/1‑167 (MQ=255) aGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCg > 1:1198015/1‑239 (MQ=255) 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TGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCA‑TGTATTCCGGATAAAACTTTCATTAGCGTGGATTTACCCGCGCCATTTTCTCCTAGTAATGCATGTATTTCACCAGGATAAACCGTTAAATTAACCGACTTTAATGCGTGAACCGGACCAAAGGACTTGCCGATCCCCGCCATCGATATATATGGCGTGGCCATAAATAACCTCTCTGCACGAAATATCGTATTATTGCCTGATGGCTACATTTATCAGGTCTACGTTCAGGTTATTTTGTTGGCCGGATAAGACACTTCATTAGCATCATCATCCGGCATCATTCAGTTTTATTGAGTGACCAGGATTGAATCGACCAGTTTAAATTCCGGTGCTTTATCCAGCGGGATAACCTTGCCGGATTTCTCAGCGTCAACCATCAGCTTCAGACCCGTTGCGCC > NC_007779/4315425‑4315895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |