| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 2,829,094 | T→C | 14.3% | I209T (ATC→ACC) | gutQ → | arabinose‑5‑phosphate isomerase GutQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 2,829,094 | 0 | T | C | 14.3% | 349.0 / 8.8 | 129 | I209T (ATC→ACC) | gutQ | arabinose‑5‑phosphate isomerase GutQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (85/22); new base C (2/19); total (87/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GGCCTGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGCCAAAGAGA > NC_007779/2828859‑2829330 | ggCCTGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATccc > 1:933941/1‑239 (MQ=255) gCCTGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATccc < 1:2141172/238‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCca < 2:1993757/238‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAg < 2:1975881/239‑1 (MQ=255) gggcggcAAAAGCGGTGCTGGACAGCTCCGTAGAACGCGAAGCCCGCCCGATGCACCTTGGGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCCG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGAGGCCATCCCACAg < 2:1428497/238‑1 (MQ=255) ggcggcAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAgg < 1:66459/239‑1 (MQ=255) gTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGGGACGATGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCg > 2:316109/1‑238 (MQ=255) ggtggaatcctcCGTAGAACGAGAGGCCTGCCCGTTTCACCGTGCGCCGCCCTCCGCCCACGTAAATCCCCTGAGG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGGGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCCC‑CCACCCAGCGGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGGGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGcc < 2:810322/229‑1 (MQ=255) ctcCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCCGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑CATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGCTGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgatgg > 1:1745772/1‑239 (MQ=255) ctcCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgatgg > 1:271484/1‑239 (MQ=255) ctcCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCCC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCCCGC‑CTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCACCCCACAGGTGGGGTTAACCGCCAGCGTgatgg > 2:53937/1‑239 (MQ=255) ccGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGggatggat > 2:2047989/1‑239 (MQ=255) gTAGAACGCCAAGCCCGCCCGGTGCACCTTGCGCCGCCCCCCAGCCCCGGCAATCCCCTGATG‑GGGGGGGACGCGCTGGCGGTGGCGGTCATGGGGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCCCCCCGCCGGGGCCCTGGGCGCGCGC‑TTGCTA‑AATAAAGTGCATCATCTGAGGCGCCGGGGCGTGGCCCTCCCACCGGGGGTGTTAACCGCCAGCGTGATGgatgc < 2:919252/239‑1 (MQ=255) tAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑ACTAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATACCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGgatgcg > 2:2188415/1‑239 (MQ=255) tAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACGGCCAGCGTGAGGgatgcg > 2:836733/1‑239 (MQ=255) tAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGAGTGATGgatgcg > 1:1416042/1‑239 (MQ=255) tAGAACGCGAAGCCTGACCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCAC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGAAGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGCGGCGCCAACCGCCAGCGAGATGgacgcg > 1:570786/1‑239 (MQ=255) agagCGCGACGCCCGCCGGAGGCCCCTGCGGCCGCCCCCCGGCCCCGTCAATACCCGGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGGGCGGATTTAATGAAGAGGATTTTGCCGGCCC‑CCCCCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGAGGATGCCTCCCCACAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGgatgcga < 2:950731/239‑1 (MQ=255) cgcgAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGgatgcgat > 2:1145333/1‑236 (MQ=255) cgCCTGCCCGGTGACCCTGGCGCCGCCCCCCAGCCCCTTCAA‑GCCCTGGGGTTTGGGTACGGCGCGGCCGATGGCGGTCATGCGGGCGCGGGGATTTAAGGAAAAAGATTTTCCCCGCTC‑CCCCCCAGCGGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCACCATCGAATGCGGCGGGACGAGCCCTTCCCACAGGTGGCTTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGaa < 2:402382/237‑1 (MQ=255) aGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCCTCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGa > 1:507270/1‑237 (MQ=255) cccGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGcc > 1:1402568/1‑239 (MQ=255) gATGCCCCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATTCCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGTTTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCCCCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTAAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCa < 1:53937/239‑1 (MQ=255) tGCGCCTTGCGCCGCCCTCCAGCCCCGTCATTACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGTTGGCGGTCATGCGGGCGGGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCAc < 1:1059211/238‑1 (MQ=255) tGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAAGGAAGAAGTTTTTGCCCGCCC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCACCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCAc < 1:1365860/238‑1 (MQ=255) ggCACCGTGCGCCGCCCTCCGGACCCGTCAATACCGTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGGGAGGGCGGTAAGGCAGGCGCGCGTATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCCCCCAGCCGGGGCACGGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCAc < 2:1797716/237‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCg > 2:1938279/1‑239 (MQ=255) tgggggcCGACCTCCCGCGCCGTCAATCCCCTGGGG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCGGGCGCGGGGATTTAATGAAGAAGCTTGTGCCCGCGC‑CCCCCCCGCGGGGGCTGTGGGCGCTCGT‑TTGCTA‑AATAAAGTGCATCATCTTGTGCGCCGTGGCGATGCCACCCCACGGGGGGCGTTACCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCt < 2:336556/234‑1 (MQ=255) ttGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGGACTGGGCGCTCGC‑TCGCTG‑AATAAAGTGCCTCATCTGATGCGACGTGACGCAGCCATCCCACAGGTGGTGTTAACCGCCAGCGAGATGGATGCTATGCTGGAACTCAGCCGCCACGGTCTg > 2:479995/1‑239 (MQ=255) gcCGACCCCCTGCACCGGCATGCCCCTGAGA‑GTGGGTGAGGCGCTGGCGGTGGCGGTCAGCCGGGCGCGCGAATTTAAGGAAGAAGATTTTCCCCGCTC‑CCACCGAGCCGGGGCTCTGGGCCCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCGGGGACGAGGCCACCCCGCGGGTGGCGTAAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGc < 2:1759712/239‑1 (MQ=255) cGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCtg > 1:887468/1‑239 (MQ=255) cTCCGGCACCGTAAATACCCTGATG‑AGGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCGGGGGGGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCCCCCAGCCGGGGCACGGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAGGTGCATCATCTGATGGGCGGGGACGATGCCACCCCCCAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGAAGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCtggtgg < 2:525088/239‑1 (MQ=255) cccGTAAATCCCGTGATG‑AGGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAGTATTTCGCCCGCCC‑CCCCCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCGGATGCGCCGTGCCGATGCCACCCCACAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTAtg < 2:763647/238‑1 (MQ=255) ccGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTAtgt > 1:811373/1‑239 (MQ=255) gTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTAtgtg > 1:1344754/1‑238 (MQ=255) tCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCtggtgg > 1:515726/1‑228 (MQ=255) tCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAc > 1:763647/1‑239 (MQ=255) tCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAc > 1:1463937/1‑239 (MQ=255) tCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAc > 1:1574821/1‑239 (MQ=255) tCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAc > 1:1629910/1‑239 (MQ=255) aaTCCCCTGTGG‑AGGGGTGAGGCGTGGGCGGTGGGGGTCATGCGGGCGGGCGTATTTAAGGAAGAAGATTTGCCCGGCCC‑CCCCCCAGCCGGGGCGCGGGGCGCGCCC‑TTGCGG‑AATAAAGTGCATCACCTGATGCGCCGGGACGAGGCCATCCCACAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGc < 2:1402568/239‑1 (MQ=255) aCCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCCCCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTca < 1:781058/239‑1 (MQ=255) ccTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTcaac > 1:267819/1‑239 (MQ=255) cTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTcaaca > 1:1895240/1‑239 (MQ=255) tgatg‑aTGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTcaaca > 1:239533/1‑238 (MQ=255) tgatg‑aTGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAATGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGC‑‑CACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAacaaca > 1:1539941/1‑239 (MQ=255) gatg‑atGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACCGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCaacaac > 1:1113689/1‑239 (MQ=255) gatg‑atGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCaacaac > 1:1421231/1‑239 (MQ=255) gatg‑atGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCaacaac > 1:1313342/1‑239 (MQ=255) gatg‑atGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGGCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAGGCTcaacaa > 1:906822/1‑238 (MQ=255) gatg‑atGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCACCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGGCTGGGGCTGGGGGCGGGTTGGGGCGCTCcaccac > 2:1662176/1‑239 (MQ=255) atg‑atgGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACAGCCAGCGTGCTGGCTGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGCCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGAAGCACAaccaca > 2:568672/1‑239 (MQ=255) ggTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGGATGTGAAGCTcaccaaacgcgaca > 2:2171954/1‑231 (MQ=255) aCGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCACCAACCGGGACAAggg > 2:360438/1‑238 (MQ=255) aCGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGc > 1:2188413/1‑239 (MQ=255) tGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCttt > 1:130043/1‑239 (MQ=255) tGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGAc > 1:715954/1‑239 (MQ=255) tCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGGTGCTGGAACTAAGCCGCACAGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTAAACAACAGGCAAAAGGAGTCTTTACCGGCGGCGAt > 2:2049137/1‑239 (MQ=255) tCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGAt > 1:1832873/1‑239 (MQ=255) cgcgGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCgctg > 1:1654979/1‑239 (MQ=255) cgGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCTAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCtggtgg < 1:533383/176‑1 (MQ=255) gATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCgctggctg > 1:1874579/1‑239 (MQ=255) gaagaTTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTcaacaa > 1:1699836/1‑183 (MQ=255) gaagaTTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTggcggcg > 1:689104/1‑238 (MQ=255) gaagaTTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTggcggcg > 1:56508/1‑238 (MQ=255) gaagaTTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGGACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGGTTTACGTCGCTGGCTGGTTggcggcgg > 1:785216/1‑239 (MQ=255) gaagaTGTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGCACCCAGCCGCACCGGTCTGGGACTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGCATTACGTCCCTGGCTGGTTgcaggagg > 2:1959971/1‑232 (MQ=255) agaTTTCCCCCGCTC‑CCCCCCAGCCGGGGCACGGGGCGCTCTC‑TTGCTG‑AATAAAATGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGC‑‑CACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCa < 2:1539941/239‑1 (MQ=255) tttttGCCCGCCC‑CCCCCCCGCCGGGGCACTGGGCGTTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTCCATCATCTGAGGCGCCGGGACGATGCCACCCCACGGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCa < 2:56508/238‑1 (MQ=255) tttttGCCCCCTCACCACCC‑GCGGGGGACTTGGGCGCTTCC‑TT‑CTGTAATAAAGTGCAACGCCTTATGCGCATTTACGATGCCTTCCCTCGGGGGCCGTTCTCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCGCCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCa < 2:785216/238‑1 (MQ=255) tttcGCCCGCCC‑CCCCCCAGCCGGGGCACGGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCCTCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCACCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCa < 1:2047989/238‑1 (MQ=255) cgcccgccc‑CCCCCCAGCGGGGGCCCTGGGCGCTCGC‑TTGGTA‑AATAAAGTGCACATTCGGGTGCGCGGGGCCGATGCCACCCCACAGGGGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTca < 2:1463937/238‑1 (MQ=255) gCCCCCCC‑CCCCCCGGCGGGGGCACTGGGCGCTCGT‑TTGCGA‑AATAAAGTGCATCCGCTGAGGGCCCGTGACGATGCCATCCCCCAGGTGGCGTTACCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTcac < 2:130043/239‑1 (MQ=255) gccc‑ccaccggGCGGGGGCCCGGGGCGCTCGT‑TTGCTG‑AAAAAGGTGCATCCTTGTAGGGGCGGGGCGGTTGCCACCCCACGGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACg < 2:1922619/236‑1 (MQ=255) gCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTcaccac > 1:1556775/1‑238 (MQ=255) cc‑ccccccgGCCGGGGCACTGGGCGCTCTC‑TTGCAG‑AATAAAGTGCACCATCTGATGCGCCGGGAGGATGCCACCCAACGGGGGGGTTTACCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGc < 2:689104/237‑1 (MQ=255) cggCCGGGGC‑CTGGGGGCTGGCTTTGGTA‑AATAAGGGGCATCATCGGAGGGGCGGTGACGATGCCACCCCCCGGGTGGGGTAAGCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAAt < 2:1101680/237‑1 (MQ=255) tcgc‑tTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTcggcg > 1:1928307/1‑239 (MQ=255) tGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATc > 1:546758/1‑238 (MQ=255) tGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATc > 1:2075275/1‑238 (MQ=255) atcatcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCCCCACGTTGCAATCGcca > 1:1021964/1‑237 (MQ=255) atcatcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCaa > 1:2061148/1‑239 (MQ=255) atcatcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGGCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGAAGACGGTCGGCGGCCCCACGTTGCAATCGCaa > 1:806390/1‑239 (MQ=255) catcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTcaacaa > 1:1482815/1‑120 (MQ=255) catcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAg > 1:307963/1‑239 (MQ=255) tcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTc > 1:1741389/1‑239 (MQ=255) gttGCGCCGTGACGGTGCCACCCCACAGGGGGCGTTATCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTcgcg < 1:1662176/237‑1 (MQ=255) tGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCCGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGcc > 1:2132008/1‑239 (MQ=255) gcCGGGACGATGCCACCCCACGGGTGGCTTAACCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGACACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCAt < 1:360438/238‑1 (MQ=255) ccGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCGGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGGACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCg > 1:2144585/1‑239 (MQ=255) ccGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCCCCACCCCAGTCAATTGAGCGATTGCGGTCGGGGGCACCCCGTTGCAATCGCAAAGGCGCGCCCTc > 2:1212195/1‑238 (MQ=255) cGTGACGGTGCCATCCCCCGGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGa < 1:76813/239‑1 (MQ=255) cGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCg > 1:1475580/1‑238 (MQ=255) cGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCg > 1:1086739/1‑238 (MQ=255) cGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGGACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCACTCGCAAAGTCGCGCCATCg > 1:1049038/1‑238 (MQ=255) tGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCATTCCCCCCGCCAGTACATGAAGCGGTGATGGTGCGCGGCGCCACGTTGCAATCGCAACCTCGCGCCATCCAc > 2:193520/1‑238 (MQ=255) ggcGATGCCCCCCCAGCGGTGGTGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCTCCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGTCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCTCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGc < 1:2049137/237‑1 (MQ=255) aCGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGcc > 1:1209689/1‑239 (MQ=255) ccctCCCACGGGTGGCGTTACCCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTCCAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCCCTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGCCAAaga < 1:2188415/235‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGCCAAAgaga > 1:1434370/1‑238 (MQ=255) | GGCCTGGCGGCAAAAGCGGTGCTGGATATCTCCGTAGAACGCGAAGCCTGCCCGATGCACCTTGCGCCGACCTCCAGCACCGTCAATACCCTGATG‑ATGGGTGACGCGCTGGCGATGGCGGTCATGCAGGCGCGCGGATTTAATGAAGAAGATTTTGCCCGCTC‑CCACCCAGCCGGGGCACTGGGCGCTCGC‑TTGCTG‑AATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTATGTGACGCTCAACAACAGGTACAAGGCGTCTTTACCGACGGCGATTTACGTCGCTGGCTGGTTGGCGGCGGCGCACTCACCACGCCAGTCAATGAAGCGATGACGGTCGGCGGCACCACGTTGCAATCGCAAAGTCGCGCCATCGACGCCAAAGAGA > NC_007779/2828859‑2829330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |