| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,244,258 | T→G | 9.3% | F127V (TTC→GTC) | Y75_RS16105 → | hexuronate transporter ExuT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,244,258 | 0 | T | G | 9.3% | 565.1 / 2.2 | 209 | F127V (TTC→GTC) | Y75_RS16105 | hexuronate transporter ExuT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/136); new base G (27/3); total (69/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.47e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CTATATCATCGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACTATATTATTAATGGTCA > NC_007779/3244023‑3244496 | atatCATCGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TGTTGAAG‑GCCGCTCCGGAAT‑GGTGccc > 2:251985/1‑239 (MQ=255) atatCATCGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TGTGTAAG‑GCAGCTCC‑GGAT‑GGGTCCCg > 2:1499289/1‑239 (MQ=255) atatCATCGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGTAAG‑GCCGGTCC‑GGAT‑GGTTc > 1:973871/1‑236 (MQ=255) tcatcGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGGTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCg > 1:1925220/1‑239 (MQ=255) tcatcGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCg > 1:1893568/1‑239 (MQ=255) tcatcGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGAAGCGATGATCCCGGCGGG‑GACGTAAA‑CCAGCGCC‑GGAA‑GGTGCCCgggg > 2:1956514/1‑237 (MQ=255) gCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GTGGAAAG‑TCAGCACC‑GGAG‑GGTCTACGGCG‑AAaga > 2:577167/1‑239 (MQ=255) aGCCTAATCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAagag < 1:1654506/238‑1 (MQ=255) ccTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑aaa < 1:945664/233‑1 (MQ=255) cTATGCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGGGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCg < 2:1172089/237‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCa < 1:1676259/239‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGAGCCCGGCGGG‑GCTGGAAG‑GCCGCTCC‑GAATGGGTTCCCGCCG‑aaatgcgggcc > 2:2014092/1‑230 (MQ=255) gctgctTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCCTGAAG‑ACCGCTCC‑GGAT‑GGGTCCCCGAG‑CAAGAGCGTGCCCT‑cc > 2:1271334/1‑237 (MQ=255) tgctTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGccg > 1:260853/1‑237 (MQ=255) tgctTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGCGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGCGTGGCCTGGCTGTTGCACGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGGAAG‑CCAGCTCC‑CACT‑GATCCGCGCCG‑AAAGAGAGTTCCCT‑CGcgg > 2:1416628/1‑237 (MQ=255) tataCGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAACTCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GTTGGAAGACCAG‑TCC‑GAAT‑GGGTTTCGGGG‑GAAGAGTGCTCCCT‑CCCacactg > 2:313153/1‑234 (MQ=255) tataCGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAgg < 1:43691/239‑1 (MQ=255) tataCGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAgg < 2:1571067/239‑1 (MQ=255) ataCGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAATCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGc < 1:1858213/239‑1 (MQ=255) ggTCATGCAACCGGTTGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACt < 2:1760494/239‑1 (MQ=255) cATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCg > 1:351932/1‑208 (MQ=255) cATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCg < 2:351932/208‑1 (MQ=255) cATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGTAAG‑ACCGCGCC‑GCAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAGAGCGATCCCT‑CGCCGTAGGCTACGTTa > 2:606126/1‑239 (MQ=255) tGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TGTGGAAG‑CCCGCTCC‑CGAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAAAGCGGGCCAT‑CGCGAGAGGCTACTTTTAc > 2:889868/1‑239 (MQ=255) tGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGATAC‑CCGGCTCC‑GCAC‑GGGTCCCCGCG‑AAAGAGCGTTCCCT‑CGCCGCAgggcaccttca > 2:1769251/1‑229 (MQ=255) aaCCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTa < 2:951554/239‑1 (MQ=255) ggTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGCAG‑Gtt > 1:1242622/1‑239 (MQ=255) ggTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGGTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑Gt > 1:564503/1‑238 (MQ=255) aGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑GCAGCCCC‑GGAA‑GGGGCCCGGGG‑TAAGGGGCTTCCAT‑CGCCGCAGGCCACTTTAAaggag‑ggtgt > 2:1236492/1‑234 (MQ=255) gTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACt < 1:731376/219‑1 (MQ=255) ttATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGAtt < 1:1769251/238‑1 (MQ=255) tACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAgg < 1:1958379/208‑1 (MQ=255) ggATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGGAAG‑CCAGGGCC‑GCAT‑GGGGTCCGGCG‑AAAGCGCGGTCCAT‑CGCCGCAGGGCACTTTTACGTAG‑GGTCTTCGCTTtgtggggtgg > 2:1304582/1‑233 (MQ=255) ggATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCGCC‑GAAT‑GGGTTCCGGCG‑AAAGAGGGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGGAG‑GGTCTTCGATTGGTGCgatga > 1:842805/1‑239 (MQ=255) gATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TGTGAAAG‑CCAGCTCC‑GGAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAGAGCGGTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGCTTGGTGCgatgat > 1:1110057/1‑239 (MQ=255) gATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCCTGAAG‑CCCGCCCC‑CAAG‑TGTTCCCCGCC‑AAACGGCGGTCCATCCGCGGTA‑GCGACCTTTACGTAGTGTCTTTGGATTGGTgggtggt > 2:1315181/1‑233 (MQ=255) gtgCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTTCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGGTGATCCCGGCGGGTTGTGAAAC‑CCGGCCCC‑G‑CT‑GGGTCCCCGCGCAAAAGGCGTTCC‑T‑CCCCGTAGTGCACCTTTACGCAG‑GTTCTTCGGTTGTGGGGGTGATTgc > 2:1740888/1‑239 (MQ=255) cTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGGAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTTGAAG‑CCCGCCCC‑GGAT‑GGTTTCCCGCG‑AGAGAGGGGTCCCT‑CGCAGTTGGCTCCGTTAACGTGA‑GGTCCTCGATTGGTGGGTCGATTtcgc > 2:1229698/1‑238 (MQ=255) gTACGAAAATCGGTTATGCAAGGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGcgccgcc < 1:2010429/238‑1 (MQ=255) cGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCtg < 1:1816804/239‑1 (MQ=255) gAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGGTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCtgg > 1:1412284/1‑239 (MQ=255) tCGGTTATGCAATGGTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTa < 1:1163633/239‑1 (MQ=255) tgcatggTTTGGTGTGCTGGGGGCCGGGTTCTGTGGGGCAGCCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGAGGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCaa < 2:1110057/233‑1 (MQ=255) tGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCaa < 1:295120/239‑1 (MQ=255) tGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGGTCCCGGCG‑GAAGAGGGTTCCAT‑CACAGTAGGCCAACTTAACGGTA‑GTTCTTAGAGTGGGGCGATGACTGCGCCGCCGCTGGTGGTG‑Tggggca > 2:1805144/1‑236 (MQ=255) tGCAATGTTTGCGGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAGCCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCaa < 1:1271334/239‑1 (MQ=255) aaTGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCg < 1:1284902/239‑1 (MQ=255) aaTGGTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCg < 1:1093956/239‑1 (MQ=255) tttGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGAAAG‑CCCGGCCC‑GGAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAAAACGGTCCCT‑CGCAGTAGGCAACTTTTACGGTG‑GTTCTTCGGTTTGTGTGGTTGTTGTGCCGCCGCTGGTGGGAGTGGGCaacggtat > 2:1930309/1‑233 (MQ=255) gctgtgctgtGGGGCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGca < 1:2206994/239‑1 (MQ=255) gctgtgGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCt < 2:1330681/210‑1 (MQ=255) gctgtgGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCt > 1:1330681/1‑210 (MQ=255) ctgggGGCCGTGGTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGAt < 1:2094313/185‑1 (MQ=255) gggCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAg < 1:2142168/239‑1 (MQ=255) ggCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGAAAG‑GCAGCTCC‑GAAT‑GGGTCCCGGCG‑GAAGAGGGGTCCAT‑TGCAGGTGGGCACTTTAACGTAA‑GGTCTTGCGTTGGTGCGCTGATTTCGCCGCCGCTGGGGGGA‑CGGGGAAGTGTAATGCACCGCTGGGAgg > 2:165983/1‑238 (MQ=255) gCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGa < 1:1042458/238‑1 (MQ=255) gCCGTGTTCGGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGGAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAACG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGa < 1:1947442/238‑1 (MQ=255) gCCGTGTGCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGa < 1:2082977/238‑1 (MQ=255) ccGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGAt < 1:800231/238‑1 (MQ=255) ccGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGAt < 1:313153/238‑1 (MQ=255) cGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATgg < 1:1805144/239‑1 (MQ=255) tgtTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGGAAG‑CCAGCGCC‑GCAT‑GGGTCCCGGGG‑AAAGAGAGGTGCAT‑TGCAGTAGGGCAACTTAAAGTAG‑GTTGCTCGATTTGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGGGGGA‑TGGGGAATCGTTATTCACCACAGGCAGGTGGCa > 2:800231/1‑239 (MQ=255) tgtTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCa > 1:715212/1‑239 (MQ=255) gtTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCGCAGCTGGCAGATGGCAt < 1:1629049/239‑1 (MQ=255) gtTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCAt < 1:606126/239‑1 (MQ=255) tgCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TGTGAAAG‑GCAGCTCC‑GCAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGGTTCCT‑CGCAGGAGGCCACTTTAAAGTAG‑GGTCTTCGATTGGTGGGCTTATTGCGCCGCCGGCGGGGGTA‑TGGGGAATCGGAATGGACCGCTGGCAGATGGGATTTatgagt > 2:2084846/1‑234 (MQ=255) cAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑GCTGGAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGGTTCCGGCG‑AAAGAGCGGTCCCT‑CGCAGTAGGCCACTTTAAAGTAG‑GGTCTTCGATTGGGGCGATGGTTGCGCCGCCCCTGGGGGGA‑TGGGGAATAGTAATGCCCAGCTGGGCGAAGGGATTTATCCTCTcc > 2:2137883/1‑239 (MQ=255) gcTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCAt < 2:1041931/239‑1 (MQ=255) gcTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCAt < 2:721492/239‑1 (MQ=255) cTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCAt < 1:1007743/238‑1 (MQ=255) cAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAg < 1:667039/238‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGa < 1:1315181/238‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGa < 1:1499289/238‑1 (MQ=255) tGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCCGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGGTTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGGGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCCTTTATCATCTTCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGGGATGGCCTGGGTgg > 2:753722/1‑238 (MQ=255) gCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGc < 1:1712446/172‑1 (MQ=255) tCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGAtt < 2:1553301/238‑1 (MQ=255) tCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGAtt < 1:1969185/238‑1 (MQ=255) tCGTGGGTCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGAtt < 2:1895875/238‑1 (MQ=255) ggtgCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAGAGCGATCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGTATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCta > 1:1449099/1‑239 (MQ=255) gCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCcgc < 1:1122681/238‑1 (MQ=255) cgGGAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGa < 2:1450919/238‑1 (MQ=255) cgGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGa > 1:1791273/1‑238 (MQ=255) agcagcGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAg < 2:1674207/238‑1 (MQ=255) gcagcGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGGGGGA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGaa > 1:200749/1‑239 (MQ=255) cGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGatggcat < 1:1557327/201‑1 (MQ=255) tCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGGTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGAc < 1:484411/238‑1 (MQ=255) ggg‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATgaag < 1:237445/239‑1 (MQ=255) tCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATgaagaa < 1:61998/238‑1 (MQ=255) tGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGGTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAAcgc < 2:1828216/239‑1 (MQ=255) aaG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGa < 1:466335/238‑1 (MQ=255) aaG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGa < 1:509483/238‑1 (MQ=255) aaG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGAc < 1:1352522/239‑1 (MQ=255) aatgctgCTCC‑GAAT‑GGTTCCGGGCG‑AAAGAGGGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCGCAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGa < 1:1151733/232‑1 (MQ=255) cAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACtat < 1:2029311/238‑1 (MQ=255) cc‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACTATattatt < 2:399369/239‑1 (MQ=255) gAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACTATATTATTaa < 1:938194/239‑1 (MQ=255) tgattCCAGGCG‑AAAGAGTGTTCCAT‑CGCTGTAGGCTACTTTATCGTAG‑GTGATTCGATTGGTGGGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACTATATTATTAATgg < 2:1630185/236‑1 (MQ=255) ttCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGAcc < 1:1486115/207‑1 (MQ=255) ttCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGAc < 2:629270/222‑1 (MQ=255) ttCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGAc > 1:629270/1‑222 (MQ=255) | CTATATCATCGCAGCCTATTCTGCTGCTTATACGGTCATGCAACCGGTAGCAGGTTATGTACTGGATGTGCTGGGTACGAAAATCGGTTATGCAATGTTTGCTGTGCTGTGGGCCGTGTTCTGTGGTGCAACCGCGCTGGCAGGTAGCTGGGGTGGCCTGGCTGTTGCTCGTGGTGCGGTCGGTGCCGCGGAAGCAGCGATGATCCCGGCGGG‑TCTGAAAG‑CCAGCTCC‑GAAT‑GGTTCCCGGCG‑AAAGAGCGTTCCAT‑CGCAGTAGGCTACTTTAACGTAG‑GTTCTTCGATTGGTGCGATGATTGCGCCGCCGCTGGTGGTA‑TGGGCAATCGTAATGCACAGCTGGCAGATGGCATTTATCATCTCCGGTGCATTGAGCTTTATCTGGGCGATGGCATGGCTGATTTTCTATAAACATCCGCGCGACCAGAAGCATCTGACCGATGAAGAACGCGACTATATTATTAATGGTCA > NC_007779/3244023‑3244496 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |