| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 3,797,586 | A→T | 5.2% | T321S (ACT→TCT) | Y75_RS18845 → | adenine permease AdeQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,797,586 | 0 | A | T | 5.2% | 1335.4 / 4.4 | 442 | T321S (ACT→TCT) | Y75_RS18845 | adenine permease AdeQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (230/172); new base T (2/28); total (236/206) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-08 | |||||||||||
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Only 100 of 454 total aligned reads displayed.
GGTGAAGTAGATTTGAGCGGCGCGTTAACACTTGAACTCGCCGGTATCATTTTCTCCTTTATGCTGATCAACCTATTTGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTCCCC‑AATATGAATAAGGCGCTGTATGTTGATAGCGTCAGTTCGGTGGCGGGTGCGTTTAT‑CGGCACCTCGTCTGTTACTGCCTATATTGAAAGTACTTCTGGTGTGGCAGTCGGTGGCCGCACGGGGCTGACT‑GCGGTTGTGGTTGGCGTTATGTTCCTGTTGGTTATGTTCTTCTCACCGCTGGTGGCGATAGTTCCTCCTTACGCAACCGCCGGAGCGTTAATCTTTGTTGGCGTGCTGATGACTTCGAGCCTGGCGCGCGTTAACTGGGATGATTTTACCGAATCGGTGCCTGCGTTTATTACCACGGTGATGATGCCCTTTACTTTCTC > NC_007779/3797349‑3797824 | gATTTGAGCGGCGCGTTAACACTTGAACTCGCCGGTATCATTTTCTCCTTTATGCTGATCAACCTATTTGATTCATCAGGAACATTAATTGGTGTAACTGATAAAGCGGGCTTAATAGATGGTAACGGTAAATTCCCC‑AATATGACTAAGGCGCTGTATGTTGATAGCGTCAGTTCGGTGGCGGGTGCGTTTAT‑CGGCACCTCGTCTGTTATCGCCTATATTGAAAGTACTTCTGgtgt > 1:1909035/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |