| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,799,610 | 0 | C | G | 6.3% | 882.5 / 4.8 | 330 | A312G (GCG→GGG) | nepI | purine ribonucleoside efflux pump NepI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/172); new base G (20/7); total (151/179) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.17e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
TTGCTTTCTTCACGTATATTCGCCCGGTGTATATGAACCTGGCGGGATTCGGCGTGGATGGCTTAACGCTGGTGCTGTTGAGTTTTGGTATCGCCAGCTTTATTGGTACGTCGCTTTCGTCGTTCATTCTTAAACGTTCGGTAAAACTGGCCTTAGCAGGCGCGCCGTTAATACTGGCTGTGAGTGCGTTGGTACTGACGTTGTGGGGAAGCGATAAAATCGTTGCTACC‑GGCGT‑GGC‑GATTATCTGGGGGCTAACTTTTGCATTG‑GTTCCCGTCGGCTGGTCAACGTGGATCACCCGCTCGCTGGCCGATCAGGCAGAAAAAGCCGGGTCTATTCAGGTGGCGGTTATTCAGCTTGCTAATACCTGTGGCGCGGCAATCGGCGGTTATGC‑GCTGGATAAT‑ATTGGTCTGACTTCGCCGTTGATGTTGTCCGGCACATTGATGTTGCTGACTGCATTGTTGGTTACTGCAAA > NC_007779/3799373‑3799844 | ttGCTTTCTTCACGTATATTCGCCCGGTGTATATGAACCTGGCGGGATTCGGCGTGGATGGCTTAACGCTGGTGCTGTTGAGTTTTGGTATCGCCAGCTTTATTGGTACGTCGCTTTCGTCGTTCATTCTTAAACGTTCGGTAAAACTGGCCTTAGCAGGCGCGCCGTTAATACTGGCTGTGAGTGCGTTGGTACTGACGTTGTGGGGAAGCGATAAAATCGTTGCTACC‑GGCGT‑GGC‑g < 1:1447718/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |