| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 3,849,617 | C→G | 9.0% | A183G (GCG→GGG) | tdh → | L‑threonine 3‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,849,617 | 0 | C | G | 9.0% | 747.4 / 9.4 | 270 | A183G (GCG→GGG) | tdh | L‑threonine 3‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/179); new base G (26/3); total (87/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-11 | |||||||||||
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Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CCCATTTGTGCCGCAACACGATAGGCGTTGGTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAAAATCCCCGACAATATTTCCGATGACTTAGCCGCAATTTTTGATCCCTTCGGTAACGCCGTGCATACCGCGCTGTCGTTTGATCTGGTGGGCGAAGATGTGCTGGTTTCTGGTGCAGGCCCGATTGGTATTATGGCAGCGGCGGTGGCGAAACACGTTGGTGCACGCAATGTGGTGATC‑ACTGATGTTAACGAATACCGCCTTGAG‑CTGGCGCGTAAAATGGGTATCACCCGTGCGGTTAACGTCGCCAAAGAAAATCTCA‑ATGACGTGATGGCGGAGTTAGGCATGACCG‑AAGGTTTTGATGTCGGTCTGGAAATGTCCGGTGCGCCGCCAGCGTTTCGTACCATGCTTGACACCATGAATCACGGCGGCCGTATTGCGATGCT > NC_007779/3849380‑3849854 | tttGTGCCGCAACACGATAGGCGTTGGTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAAAATCCCCGACAATATTTCCGATGACTTAGCCGCAATTTTTGATCCCTTCGGTAACGCCGTGCATACCGCGCTGTCGTTTGATCTGGTGGGCGAAGATGTGCTGGTTTCTGGTGCAGGCCCGATTGGTATTATGGCAGCGGCGGTGTCGaacc > 1:2202673/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |