| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 3,849,619 | A→G | 7.7% | K184E (AAA→GAA) | tdh → | L‑threonine 3‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,849,619 | 0 | A | G | 7.7% | 764.0 / 2.1 | 266 | K184E (AAA→GAA) | tdh | L‑threonine 3‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/178); new base G (25/2); total (84/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.77e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CATTTGTGCCGCAACACGATAGGCGTTGGTGTTAATCGCCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAAAATCCCCGACAATATTTCCGATGACTTAGCCGCAATTTTTGATCCCTTCGGTAACGCCGTGCATACCGCGCTGTCGTTTGATCTGGTGGGCGAAGATGTGCTGGTTTCTGGTGCAGGCCCGATTGGTATTATGGCAGCGGCGGTGGCGAAACACGTTGGTGCACGCAATGTGGTGATC‑ACTGATGTTAACGAATACCGCCTTGAGCTGGCGCGTAAAATGGGTATCACCCGTGCGGTTAACGTCGCCAAAGAAAATCTCAATGACGTGATGGCGGAGTTAGGCATGACCGAAGGTTTTGATGTCGGTCTGGAAATGTCCGGTGCGCCGCCAGCGTTTCGTACCATGCTTGACACCATGAATCACGGCGGCCGTATTGCGATGCT > NC_007779/3849382‑3849854 | tggCCGCAACACGATAGGGGTTGGTGTTAATCGGCCGGGCTGCTTTGCCGAATATCTGGTGATCCCGGCATTCAACGCCTTCAAAATCCCCGACAATATTTCCGATGACTTAGCCGCAATTTTTGATCCCTTCGGTAACGCCGTGCATACCGCGCTGTCGTTTGATCTGGTGGGCGAAGATGTGCTGGTTTCTGGTGCAGGCCCGATTGGTATTATGGCAGCGGCGGTGGCGAAACACg < 2:1198803/237‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |