| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,858,410 | T→G | 8.8% | G186G (GGT→GGG) | cysE → | serine O‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,858,410 | 0 | T | G | 8.8% | 545.3 / 3.7 | 196 | G186G (GGT→GGG) | cysE | serine O‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/106); new base G (25/2); total (82/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.31e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TTTTCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACC > NC_007779/3858173‑3858645 | ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 2:710844/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 1:857807/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 1:272403/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 2:2032829/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 1:659175/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 1:128623/238‑1 (MQ=255)ttttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGt < 2:858450/238‑1 (MQ=255) tttCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCTCCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCAGCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTaa < 1:866597/239‑1 (MQ=255) tCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑At < 2:255989/239‑1 (MQ=255) cacgtccTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCCCTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑At < 2:598856/234‑1 (MQ=255) tGCCTTGCGGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGGCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCtg < 2:2064528/239‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTTAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAA‑ATCtggg‑gg > 1:1597907/1‑239 (MQ=255) ttGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCtggt‑gg > 1:1442123/1‑239 (MQ=255) ttGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGGAGTATCGATTCTGCCATCTGTGACGCTTGGGCGGACGGGGAA‑ATTtggt‑gg > 1:1193249/1‑239 (MQ=255) cAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCCTCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGAATGAAAA‑AGAGCTAATGGATCTGGCATCTGTGGCGCCTGGGGGGAAGGGTGA‑ATCAGgg‑ggtg > 1:2200825/1‑238 (MQ=255) ccTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGAc < 1:1047557/236‑1 (MQ=255) cTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGt < 1:195929/238‑1 (MQ=255) cTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTc < 2:1697030/239‑1 (MQ=255) aTCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTTAAAA‑CGGCATATACATTCTGCAAACTAGGAAGGTTGGCGGGGAGGGGAA‑ATCTGGT‑AGTGACCgcta > 2:1384438/1‑235 (MQ=255) tCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGGTTGAAAA‑CGAAGTATCGATTCTGCAATCTGTGGCGCCTGGCGGGGAGGGTGA‑AACTGGG‑GGGGACCggccc > 1:222743/1‑234 (MQ=255) tCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CTACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTATGGGGGA‑ATCTGGG‑GGTCGCCGTCAc > 1:615494/1‑238 (MQ=255) tCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGACGGATAGATTCTTCAATCTTTGAAGCTTGGCGGGAAGGGGAA‑ATCTGGT‑GGGGAACGTCAc > 1:1432927/1‑238 (MQ=255) tCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGGTTGAAAA‑AGAAGCTGCGATTCTGCAATCGGTGACGCTTTGTGGGGCGGGGAA‑ATCAGGG‑GGGGAGCGTCAACCGgaa > 1:2140408/1‑239 (MQ=255) ggtgaagtgTTGTGGAAGTAGGGTCGTCACGCACTGGCAATCGTTCTGCAAAACCAGGTTGCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGTTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGTCAGGCATCGTCGTTGGTGGACCGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAatat < 2:1644068/231‑1 (MQ=255) tCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAAt < 1:823677/237‑1 (MQ=255) cTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTg < 1:886324/239‑1 (MQ=255) cTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTg < 1:516148/239‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCGCCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGa < 1:451051/239‑1 (MQ=255) tGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTg < 1:540073/238‑1 (MQ=255) gggtggtGGACTCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTATCTGCAAAACCAGGTGTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTTGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGa < 2:1771784/238‑1 (MQ=255) tgGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGACGGATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGAGGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGACACGCACCCCAAAATTCGTGAAGgtgt > 1:715309/1‑239 (MQ=255) tgGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGATTGAAAA‑CGACGCACCGATTATCCAATCTGGGACGCTTGGCGGGACGGGGAA‑ATCTTGG‑TGTGGACGTGACCCGCAAAATCGGGGAggggg > 2:823677/1‑236 (MQ=255) ggAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCAGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGgtgt < 2:505989/238‑1 (MQ=255) aTCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGTAAA‑CGACGGAACGATCGTGCAATCTGTGACGCCTGGCGGTTCGGGTAA‑AGCCGGT‑GGTGACCGTTTCCCTGAAATTCTGGAAGGGGtgttg > 2:142865/1‑239 (MQ=255) cAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAA‑ATCTGGG‑GGGGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGGAGGGGtgatgag > 1:1848899/1‑238 (MQ=255) aGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGGGGGACGGGGAA‑ATCTGGG‑GGGGAGCGGCACCCGAAAATTCGGGAAGGGGtgaggaat > 1:319260/1‑237 (MQ=255) gTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTTGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAA‑AAATGGG‑GGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGA‑TTggctcg > 1:569278/1‑239 (MQ=255) cgcgCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGAGATTCGCCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTggcgcggg < 1:486596/239‑1 (MQ=255) gCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTTAAAA‑CGACGTATACGTTCGTCCATCCGGGCCGGTTGGGGGGAAGGGGAA‑ATCTGGG‑GGTGGCCAGTACCCGACAAATCGTGGAGGGGGGATGA‑TTggcgcgggggggacaaa > 2:1722277/1‑230 (MQ=255) aTCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCt < 2:909482/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCgg < 1:1206360/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCgg < 1:675486/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCgg < 1:2025539/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGGGAAGGGGGGATGG‑TTGGGGCGGGCGCGAAAATCCTCg > 1:1684669/1‑238 (MQ=255) ttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGGAAGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGc < 2:499084/239‑1 (MQ=255) tCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCa < 1:1722277/239‑1 (MQ=255) tCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGGGAAGGGGTGGTGA‑TTGGCGCGGGGGGGGAAATCCTCgggc > 1:747661/1‑237 (MQ=255) aaaCCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTg < 1:896760/239‑1 (MQ=255) cTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGAGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGggcgc < 2:556701/239‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTCGATAGTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGGTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAG‑CGACGTATCGGTTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑TGTGACCGTCACCCGAAAATTAGTGATGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAATTTTGgcgcgtcgcg < 2:279392/238‑1 (MQ=255) tCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGGATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TGGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GAtt < 1:667371/236‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGgc‑gc < 1:1378476/239‑1 (MQ=255) atatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑AGACGGATCGATTCTGCCATCTTGGACGGCTGGCGGTACGGGGAA‑ACATGGT‑GGTGATCGTCACCCGCAAATTCGTGACGG‑GGGGTGAGTTCGCGCGGGGGCGGAAAACCTCGGCAATATTGAAATGGTGCGCGGGGCGCA‑GGTTTGC‑GCa > 2:185031/1‑239 (MQ=255) cccGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGATTGAAAA‑CGACGTAACGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTGCGGGTGA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGGAAAATCGTGAAGGGGGGGTGT‑GTGGGGCGGGCGCGAAAAACCCCAGCCATATTTAAGGTGGGGGTGGCGGGCA‑GGTTGgt‑gccaggtacg > 2:134181/1‑231 (MQ=255) cGGCAGCAAAAATTGGTTGCGGTATCATGGTTGACCTCGCGAGAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGAGTCTGCAAGCTGTGAAGCTTGGCTGTACGGGTAA‑CTCTGGT‑GGGGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGG‑GCCGGTGCCgtg < 2:1581485/239‑1 (MQ=255) gcagcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGATTGAAAA‑AGACGTAACCATTTTGCAATCTGGTACGGCTGGGGGGAAGGGGAA‑AACAGGTGGGGGCCCGCCCCCCAAACATTGGGGAGGGGGGGA‑GA‑TTGGCGGGGGGGGGAAAAAACTCGGACAAAATGAAGTGGGGTGGGGGGCGGA‑AAATGGG‑GCAGGGTCCgggtg > 2:120922/1‑235 (MQ=255) cagcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGGGATTGAAAA‑AGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTTGTGGAGGGGTGATGA‑TTGGGGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGGTGGGCGCGGCGCGGA‑GATTGGC‑GCAGGGTCCgtgggg > 1:126264/1‑237 (MQ=255) aaTTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAc < 1:134181/239‑1 (MQ=255) ggTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCG‑AAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg < 1:1717378/239‑1 (MQ=255) tCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg < 1:1118237/238‑1 (MQ=255) gcggggTATCAGGCTTGACCACGCGACAGGCATGGTCGTTGCTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg < 2:1944691/234‑1 (MQ=255) cgcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg‑c < 1:977315/238‑1 (MQ=255) cgcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg‑c < 1:1868330/238‑1 (MQ=255) cgcgGTATCATACTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAG‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGGCACACGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg‑c < 1:798787/238‑1 (MQ=255) gcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTg‑ccg < 2:326877/239‑1 (MQ=255) tATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAgg < 1:987503/210‑1 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGGAAA‑CGACGTATCGACTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTGCGGGGAA‑AACTGGG‑GGTTACCGTCACCCCAAAATTTGCGAAGGGGTGATGA‑ATGGGGCGGGGGCGGAAAAACCCGGCGATATTTGAATTGGGCGCGGGGCGGA‑GATTGGG‑GCAGGTTCCGTGGGGGTGCGAC‑CGGGG‑CCGCCGCCTacccccc > 2:292319/1‑237 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CCACGGATCGATTTTGCAATCTGTGACGCCTGGCGGTGAGGGGAA‑AACTGGG‑GGTGTCCGGCACCCGCAAATTTGCGAAGGGGGGGTGA‑TTGGCGCGGGGGCGGAAAACCTCGGCAATATTGAAGGTTGGGGGGGCGGGGA‑GGTTGGT‑GGGGGGTGCGTGGGGCTGGAACGCGGTg‑ccccccagcccccct > 2:2026626/1‑228 (MQ=255) gcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CCACGGATCGATTCTGCAATCTGTGACGCCTGGCGGGACGGGGAA‑AATCGGG‑GGGGACCCTCCCCCGAAAAATTGTGGAGGGGGGGTGG‑TTTGCGGGGGGGCGGAAAACCTCCGCAATATTTAAGGTGGGCGGCGGGCGAA‑GGATGGG‑GCAGGGTCCCGGGGGGTGGAAA‑CGGTG‑CCGCCGCCTaccaacccccgcgg > 2:897521/1‑229 (MQ=255) ttgTGGAACGGGGGGTATTTAAAACCGACGTTTGGATTTGGCAGTCTTGGACGTGGGGCGTGAGGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGCCCGTCCCCCGAAATTGGGTGAGGGTGGGATGA‑TTGGCGCGGGGGGGAAAATCCTCGGCAATTTTGAAGGGGGGCGCGGCGAGAA‑GATTGGC‑GCGGGTTCCGTGGTGCTGAAAC‑GGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTAt < 2:126264/236‑1 (MQ=255) tGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTTAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGGTCCGTGGGGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGGATTg > 1:1930346/1‑239 (MQ=255) cggtgaggtttGAAAA‑CGAGGTGGTGATTCGGCATTCGTTGACGGTTGGTGGT‑GGGGTAATATGTGGG‑GGTGACCTGCCCCTGAAAATTCGTGAGGGTGTGAGGA‑TGGGGGGGGGCGCGAAATTCCCCGGCAATATGGATGTGGGGTGGGGCGCGAA‑G‑TTGGCGGCGGTTTCCGTGGTGCTGCAGC‑TGGTG‑CCGCCGCATCCCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCg < 2:189496/225‑1 (MQ=255) ggTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGGG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAg > 1:841613/1‑239 (MQ=255) tggataaaaa‑CGCCGTACTGATTCTGCAATCTGTGGCGGTTGGGGGTGGGGGGAA‑AGCTGGT‑GGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAGGGTGTGATGG‑TGGGGGGGGGCGCGAAAATCCTCGGAATTATTGAGGGGGGGCGCGCCGCGAA‑TATGGGC‑GCGGGTCCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CGGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGa < 2:841300/232‑1 (MQ=255) tGATTGAAAA‑CGACGTATCGTTTCTGCAATCTGTGACGCTTGGGGGTATGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGGAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCCCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGa < 2:1059405/238‑1 (MQ=255) tGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TGGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGa < 1:465708/238‑1 (MQ=255) ggATTAAAAA‑CGGCGTTGCGTTTCTGCACTCGGTGCCGTTGGGCGGTAGGGGTAA‑TGCGGGG‑GGTGCCCGCCCCCCGAAATTTGGTGAGGGGGGGTTGT‑TTGGGGCGGGGGCGAAAATCCTCGGAATTATGGAAGTGGGGCGGGGCGCGAG‑TATTGGG‑GCGGGTTCGGTGGTGTGCCAAC‑GGGTC‑CCACCCCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGa < 2:517294/237‑1 (MQ=255) aaaa‑CAACGTATCGTTTTTGCAATCTGTTACGTTTGGGGGGAGGGGAAA‑ATCTGGG‑GGGGCCCGTCCCCCGAAAATTGGGGAAGGTGTGATGG‑GTGGCGCGGCCGCAAAAACCCTCGGCAATATTGAAGGTGGGCGCGG‑GCGAAGGATTGGC‑GCAGGTCCCGTGGTGCTG‑ACC‑CGGGGCCCGCCCCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGAt < 2:1597907/239‑1 (MQ=255) acgagttgtCGATTGTGCTATGTGTGGCGTTGGGGGGTGCGGATAA‑ATGTGGT‑GGGGCCCGTCACCCAAAATGTGGTGAGGGGGTGATGA‑TGGGCGGGGGCGCAAAAACCCGGGGCAATTTTGAAGTGGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCGGGTGCGGTGGTGCTGCACC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAg < 2:747661/231‑1 (MQ=255) acgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCa > 2:1439437/1‑239 (MQ=255) cgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCa > 1:299262/1‑238 (MQ=255) cgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCa > 1:591028/1‑238 (MQ=255) aTCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCaa > 1:361503/1‑239 (MQ=255) ttCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGG‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTACTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCCTCAATGGaa > 2:369649/1‑238 (MQ=255) tGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATg > 1:1989790/1‑239 (MQ=255) cAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATgg > 1:1450904/1‑238 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGc > 1:156383/1‑239 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGc > 1:1320342/1‑239 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGATCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGc > 1:1940167/1‑239 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTCTTGTCGGTAAACAAGACAGCGATAAGCCATCACTGGATATGGCCCAg > 2:800981/1‑238 (MQ=255) gACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCgg > 1:275716/1‑90 (MQ=255) gACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCgg < 2:453062/90‑1 (MQ=255) gACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCAtt > 1:2095800/1‑239 (MQ=255) tggggggTAGGGGTAA‑ATCGGGT‑GGGTACCGTCACCCGAAAATTCGTGAGGGTGTGAGGA‑TGGGCGCGGGCGGGAAAATCCTCGGAAATATTGAGGTGGGGCGGGGCGCGAA‑GATGGGC‑GCGGGTTCCGGGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 2:156383/233‑1 (MQ=255) tGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACg > 1:1078682/1‑239 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCCGACAGCGCTAAGCCAGTAATGGATATGGAACAGCCTTTCAACgg > 2:1495539/1‑239 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCCTCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACgg > 1:1803793/1‑239 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGAGTGATGA‑TAGGAGCGGGCGCGAAAAACCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAG‑GATTGGC‑GCAGGATCCGTGGTGCGGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCGGGCGTTCCGGCCCGGATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAACATCATTTCAACgg > 2:793868/1‑239 (MQ=255) cGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATGCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATGGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCACC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGt < 1:1555682/238‑1 (MQ=255) ggTAA‑ATCTGGG‑GGGGACCGCCCCCCGAAAATTCGTGAGGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGGGCGAAAATCCTGGGCAATATGGAGGTGGGGCGCGGCGCGAA‑GATGGGC‑GCGGGTTCGGTGGTGCTGCACC‑CGGTG‑CCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc < 1:142865/238‑1 (MQ=255) | TTTTCATGCCTTGCAGGCCTATCGCATCGGTCACTGGTTGTGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAA‑CGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAA‑ATCTGGT‑GGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGA‑TTGGCGCGGGCGCGAAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGAA‑GATTGGC‑GCAGGTTCCGTGGTGCTGCAAC‑CGGTG‑CCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACC > NC_007779/3858173‑3858645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |