| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,908,704 | G→T | 8.5% | P194Q (CCG→CAG) | Y75_RS19370 ← | D‑xylose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,908,704 | 0 | G | T | 8.5% | 841.2 / 8.0 | 305 | P194Q (CCG→CAG) | Y75_RS19370 | D‑xylose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/179); new base T (26/3); total (123/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.26e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
GTATTTGCCAACAACGTAATAGGTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAA > NC_007779/3908467‑3908938 | gTATTGTCCAACCACGGAATAGGTTTAGACACCGTCATAGTGTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTACTACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCGCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GTGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCg < 2:372182/238‑1 (MQ=255) ttGCCAACAACGTAATAGGTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATGTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAAc < 1:651807/239‑1 (MQ=255) caacGTAATAGGTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGT‑GCGGTTT‑TCATAAATTTCAATTC‑TGTTTTCGGTAAcccgaca > 2:1851459/1‑233 (MQ=255) gTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCa < 1:1409217/230‑1 (MQ=255) acCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAc < 2:1919241/239‑1 (MQ=255) ccGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGC‑GCGGGTT‑CCATTATTTTTAATTC‑GTTTTTTGGTTACCACCC‑ATCAACCCCTTGGTCaacaaca > 2:173675/1‑238 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGGGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGG‑GCGTTTT‑TCATATTTTTCTATTG‑GTTTTTCGGTAACCAACC‑CTCTATCCATTGGTTACCAAC‑g > 1:2092424/1‑238 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGC‑GCGTTTT‑TCATAAATTTTACAGG‑TTTTTTCTGTAAACACCC‑ATCTACCCATTTGTcctttttct > 2:1409217/1‑231 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGT‑GCGTTTT‑TCATTATTTTTAAATC‑GGTTTTCGGTAACCAGCC‑CTCAAACCCTTTGTCCCCCAct > 2:232535/1‑237 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑TCCTCATTTTCAATTT‑GTTTTTCGGGAAACGACC‑ATCAACCCCTTGGTCACCaaaa > 2:1948727/1‑236 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑TCCTAATTTTCTATGC‑GGTTTCTCGTAAACAGAC‑ATACACCCCTTTGTGAcctaaa > 2:1103394/1‑234 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGGTTT‑TCATAATTTTCAATGC‑GTTTTTTCGTTAACAGCC‑ATCAACCCACTTGTTACCAAca > 1:67151/1‑237 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGGTATTATTGGCGG‑GGATC‑GGGGTTT‑CCTACATTTTTAATGT‑GTTTTTCTTTAAACAAGC‑ATCAACCCCTTGCTctaccacca > 2:1668680/1‑231 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTAAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGT‑GGGTTTTCCCATATTTTTAAAT‑T‑GTTTTTCGGGTACCCGCC‑CTCAAACCCTTTGTTAACaaaca > 2:1176889/1‑236 (MQ=255) gTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑GTAGC‑GCGTGTT‑TCATAATTTTTAATTT‑GTTTTTCGGTAACCAGAC‑ATCAACCCACTGGTCACCAAA‑Ga > 2:799372/1‑238 (MQ=255) gTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCATGATAAACCTTGCGAGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTGGT‑GGGTTTT‑ACATAAATTTTAATTC‑GTTTTTCGGTAAACACGC‑ATTAACACACTGGTCaacaacc > 1:1738029/1‑236 (MQ=255) tCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGGATTTGG‑GGGTTTT‑‑CATAATTTTTTAATC‑GTTTTTCTGTAACCACCC‑ATCCACACACTGGTCACCAAC‑GAC‑t > 1:1642851/1‑239 (MQ=255) tGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGT‑GCGGTTT‑TCCTAATTTTTTATTT‑GTTTTTCGGTAACCAGCC‑AACCACCCACTGGTTCCCCAC‑CAC‑CTTTAtttt > 2:431259/1‑239 (MQ=255) tGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTGTG‑GCGCTTT‑CCCTAATTTTCAAAGC‑GTTTTCTTGGAACCAGCC‑ATCAACCCCTTTGTTACCAAC‑CAC‑CTTAAtttt > 2:2072459/1‑239 (MQ=255) cGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGG‑GCGGTTT‑TCATAATTTTCAAATC‑GTTTTTCCGTAACCAACC‑AACAACCCATTTGGCCCCCAC‑GAC‑CTTAAttttt > 1:1699043/1‑238 (MQ=255) cGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGaa < 2:1818084/239‑1 (MQ=255) aTACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCTTCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCTGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTa < 1:1290554/239‑1 (MQ=255) tACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTaa < 1:1671048/239‑1 (MQ=255) cGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑CTAGC‑GCGGGTT‑TCCTAACTTTTAATGC‑GTTTTTCCGGAAACAACC‑ATCCACCCATTGGTCACCCAC‑AAC‑TTTACTTTTTTCGGAATCAACGCaaag > 2:886868/1‑237 (MQ=255) tttAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGt < 1:553486/233‑1 (MQ=255) aTACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTaa < 1:1562146/239‑1 (MQ=255) cTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTCTT‑GGGGTTT‑CCATAAATTTTCACGT‑TTTTTTCGGTGACCAGAC‑CGCCACCCCTTGGTCAACAACAGAT‑TTTCATTTTT‑CGGAATCAACGTCAGGTTTTacaaat > 2:1324992/1‑234 (MQ=255) cTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACt < 1:1600722/239‑1 (MQ=255) cTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACt < 1:182819/239‑1 (MQ=255) cTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACt < 1:1216626/239‑1 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTTC‑GCGTTTT‑TCATAATTTTTAATTT‑GCTTTTTTTGAACCAGCC‑CACAAACCCTTTGTCCCCCAC‑CACTTTTATTTTTTCCGAAAACACCATAAGGTTTTaaacatt > 2:618430/1‑234 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGCGGGGTTTT‑CATTAATTTTC‑ATGCGGTTTTCCGG‑AAACAGCC‑CTTCACCCCTTGGTCACCAAA‑GAC‑TTTTATTTTTTCGGAATCAACCTAATGTTTTTacccctt > 1:184950/1‑234 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGC‑GCGGTTT‑TCATAATTTTCAACTC‑GGTTTTCTGTAACCAGCC‑ATCAAACCACTGGTCACCAAC‑ATC‑TTTTAGTTTTTCGGAATCCACGCAAGGGTTTTACACtt > 2:767901/1‑238 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTGC‑GCGCTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACtt > 1:510562/1‑237 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGG‑GCGGTTT‑TCATAATTTTTAATTC‑GTTTTCCGGTGACCAAAC‑ATCTACCCATTTGGCTCCCAC‑GAA‑CTTACATTTTTCGTAATCAAACGAAGGTTTTAACACctt > 2:1016324/1‑238 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑ATAGG‑CCGGTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTTCGGTTACCAGCC‑ATCAACACATTGGTCACCAAC‑GAA‑TTTAATTTTTTCGGAAACAACGGAAGGGTTTAATACCTTc > 1:1501677/1‑239 (MQ=255) tCCGCATCCTGGCCGGATATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCAGTGGTCACCaa < 1:2204845/190‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGgcg < 1:1492435/239‑1 (MQ=255) ccGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTTAG‑GCGGTTT‑TCCTAAATTTTAATAC‑GTTTTTCGGGAACCAGCCAATCAACCAATTGTTCCCCAA‑‑GAC‑TTTAATTTTTCCCGAATCAACATAAGGTTTTAACAACTTTATTTTTCCGgcgccgca > 1:226974/1‑235 (MQ=255) ccGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGGTTT‑CCATTATTTTTAATGC‑GTTTTTCTGTAAACAAGC‑ATCAACCCCTTTGTTACCAAC‑CAC‑TTTTATTTTTCCGTGATCTACGGAAGGGTTTAACACTTTCCTTTTTCCGTCCCggg > 2:550479/1‑237 (MQ=255) cGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGaa < 1:1182184/238‑1 (MQ=255) cGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGaa < 1:1591906/238‑1 (MQ=255) ttGCTACTTTCCCTGATAATCCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACGTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑TTTTTCCGGTAACCAGCC‑AGCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGGAAGTTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCt < 1:2072459/237‑1 (MQ=255) ttGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCt < 1:878803/237‑1 (MQ=255) tGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTgg < 2:939761/239‑1 (MQ=255) tACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCg < 1:1011504/238‑1 (MQ=255) cTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTATT‑GCGTTTT‑TCATAATTTTCAATTT‑GTTTTTTCGTAACCAGCC‑ATCAACCCACTGTTCACCAAA‑CAC‑CTTATTTTTTTCCGAATCTACGTAAAGTTTTTACCCTTTCATTTTTTCACCTCGGGACAGCTTTGGgttg > 2:705675/1‑239 (MQ=255) aCCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCg < 2:150934/239‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCTTAATGCCTTAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTATT‑GCGGTTT‑CCCTAATTTTTAATGC‑GTTTTTCGGTAAACAGCC‑ATCAACCCATTTGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTTCGGAATAAACGTAAGGTTTTTACACTTTCATTTTTTCGGTGCGGAAAAGCTTGGCGGTGTTTTCTACCAGCGa > 2:1901051/1‑239 (MQ=255) gcgcTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAgccgcc < 1:1869058/239‑1 (MQ=255) gcgcTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCAGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAgccgc < 2:569888/238‑1 (MQ=255) cgtttAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGTTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAAGTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTTGCGTTGTTATCTACCGGCGAgccgcc < 2:1469704/235‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGAATTGCCCCGCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTaa < 1:260585/178‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAAc < 1:2160278/127‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCt < 1:905927/207‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCGCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCATGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 2:497258/239‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:790729/239‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:984/239‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:767901/239‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGACGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:1122446/239‑1 (MQ=255) tGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAgccgcc < 1:1225224/231‑1 (MQ=255) gacaagAATTGCCCCACCTTCTGGGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑TTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 2:746216/233‑1 (MQ=255) ttGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTa < 1:1084838/239‑1 (MQ=255) ttGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTa < 1:1438819/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:1160764/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:1993911/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:364634/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:46804/239‑1 (MQ=255) ccTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑TCATAATTTTTAATGC‑GTTTTTCCGTAACCAGCC‑CTCAACCCCTTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTTATTTTTTCGGAATCAACGTAAGGGTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGGACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCCTCAGGGAGTAATTACCCTgtct > 1:746216/1‑236 (MQ=255) tGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGaa < 1:618430/239‑1 (MQ=255) ggTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTATC‑GCGTTTT‑TCCTAATTTTTAATTC‑GGTTTTCCGTAACCAGCC‑ATCAACCCCTTTGTCACCCAC‑GAC‑CTTTATTTTTTTCGAAACAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTTTCTGGCGCGGAACAGCTTTGTGTTGTTATCTACCTGCGCGCCGCCCACACGGAAGTAAATACCTTGCgggccaa > 2:1051797/1‑234 (MQ=255) ggTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCgg < 1:325437/170‑1 (MQ=255) ggaaTCGTTTGAGTCAACTAAAGCTTCAATTTTGTTTTTTTTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTCCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ACCAACCCATTGGTCCCCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGCCGTTGTTATCTACCGGCGAGCGGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAata < 2:1983572/235‑1 (MQ=255) ggCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAatat < 1:1932812/239‑1 (MQ=255) cGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGAcc < 1:1262733/239‑1 (MQ=255) gTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTTCCTTGCGGAACAATATCGACCa < 2:1739569/239‑1 (MQ=255) gTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCa < 1:1900762/239‑1 (MQ=255) aGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTTAATGC‑GTTTTTCGGTAAACAGAC‑CTCAACCCCCTGGTCCCCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTTCGGAATCAAAGTAAGGGTTTAAAACTTTCATTTTTTCGGCGCGGAACAGCTTGGGGTTGTTTTTTTCCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGTGGAACCATATCGACCAggggt > 1:1811262/1‑237 (MQ=255) ggCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCt < 2:1247588/238‑1 (MQ=255) aaCTACATCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCtttt < 2:67151/238‑1 (MQ=255) aCTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATTC‑GTTGTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACTCTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGc < 1:1906404/239‑1 (MQ=255) aCTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGc < 1:1552297/239‑1 (MQ=255) aTCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGc < 1:1723288/235‑1 (MQ=255) aTCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGc < 1:739637/235‑1 (MQ=255) aaTTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCAc < 1:2197976/239‑1 (MQ=255) attGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:1617305/175‑1 (MQ=255) gg‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCga < 1:3814/239‑1 (MQ=255) gg‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCga < 1:201961/239‑1 (MQ=255) aGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCgaaaga < 1:422271/239‑1 (MQ=255) cgTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCTGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTa < 2:1786998/170‑1 (MQ=255) cgTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTa > 1:1786998/1‑170 (MQ=255) ttt‑CCATAATTTTCAATTC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTATGGTTTTAACACTTGCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATaa < 2:340370/239‑1 (MQ=255) ttCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATc < 2:1638225/239‑1 (MQ=255) tCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg > 1:1405280/1‑146 (MQ=255) tCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGa > 1:13428/1‑201 (MQ=255) aTGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTTGGCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAAGCAACGTAAGGTTTTATCACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCAACCGGCGAGCCGCGCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCa < 2:1574652/239‑1 (MQ=255) tGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCCCCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAg > 1:1963949/1‑130 (MQ=255) tGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCa > 1:2056763/1‑238 (MQ=255) gC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCGTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATc < 1:966887/239‑1 (MQ=255) gTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGt < 1:83675/239‑1 (MQ=255) | GTATTTGCCAACAACGTAATAGGTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGG‑TTAGC‑GCGTTTT‑CCATAATTTTCAATGC‑GTTTTCCGGTAACCAGCC‑ATCAACCCATTGGTCACCAAC‑GAC‑TTTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAA > NC_007779/3908467‑3908938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |