| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 3,935,459 | A→G | 11.8% | I279V (ATT→GTT) | dppB → | dipeptide ABC transporter permease DppB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,935,459 | 0 | A | G | 11.8% | 962.4 / 17.8 | 333 | I279V (ATT→GTT) | dppB | dipeptide ABC transporter permease DppB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/259); new base G (44/2); total (70/263) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-34 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
TGCCGTCGCCCATATGATCTTGCCTGCCATTGTGCTGGGTACTATTCCGCTGGCGGTCATTGTGCGTATGACACGCTCCTCGATGCTGGAAGTGCTGGGCGAGGATTACATCCGCACCGCGCGCGCCAAAGGGCTAACCCGCATGCGGGTGATTATCGTCCATGCGCTGCGTAACGCGATGCTGCCGGTGGTGACCGTTATCGGCCTGCAGGTGGGAACATTGCTGGCGGGGGCGATTCTGACCGAAACCATCTTCTCGT‑GG‑CCCGGTCTGGGACGCTGGTTGATTGACGCACTGCAACGCCGCGACTATCCGGTAGT‑GCAGGGCGGCGTATTGCTGGTGGCGACGATGATTATCCTCGTCAACTTGCTGGTCGATCTGCTGT‑ACGGCGTGGTGAACCCGCGTATTCGTCATAAGAAGTAAGGGGACATCATGT‑CACAGGTTACTGAAAATAAAGTGATTAGCGCACCGGTG > NC_007779/3935224‑3935695 | tGCCGTCGCCCATATGATCTTGCCTGCCATTGTGCTGGGTACTATTCCGCTGGCGGTCATTGTGCGTATGACACGCTCCTCGATGCTGGAAGTGCTGGGCGAGGATTACATCCGCACCGCGCGCGCCAAAGGGCTAACCCGCATGCGGGTGATTATCGTCCATGCGCTGCGTAACGCGATGCTGCCGGTGGTGACCGTTATCGGCCTGCAGGTGGGAACATTGCTGGCGGGGGCGAtt < 1:775744/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |