| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 3,935,845 | A→C | 6.2% | A64A (GCA→GCC) | dppC → | dipeptide ABC transporter permease DppC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 3,935,845 | 0 | A | C | 6.2% | 1132.2 / 4.3 | 395 | A64A (GCA→GCC) | dppC | dipeptide ABC transporter permease DppC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (234/116); new base C (6/30); total (241/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.50e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
CGTGGTGAACCCGCGTATTCGTCATAAGAAGTAAGGGGACATCATGTCACAGGTTACTGAAAATAAAGTGATTAGCGCACCGGTGCCGATGACCCCGTTACAGGAGTTCTGGCACTATTTTAAACGCAACAAAGGCGCGGTCG‑TCGGGCT‑GGTTTACGT‑CGTCATCGTGCTGTTCATCGCGATCTTTGCCAACTGGATTGCACCCTATAACCCGGCGGAACAGTTCCGCGATGCACTGCTCGCCCCGCCAGCCTGGCAGGAAGGCGGCAGCATGGCGCACTTGCTGGGCACCGATGACGTAGGCCGTGATGTGCTGTCGCGCCTGATGTACGGTGCGCGCCTGTCGCTGCTGGTTGGCTGTCTGGT‑AGTTGTGTTATCGCTGATTATGGGCGTTATTCTCGGCCTGATCGCCGGTTACTTTGGCGGCCTGGTCGATAACATCATTATGCGCGTGGTCGATATCATGCTGGC > NC_007779/3935611‑3936081 | cGTGGTGAACCCGCGTATTCGTCATAAGAAGTAAGGGGACATCATGTCACAGGTTACTGAAAATAAAGTGATTAGCGCACCGGTGCCGATGACCCCGTTACAGGAGTTCTGGCACTATTTTAAACGCAACAAAGGCGCGGTCG‑TCGGGCT‑GGTTTACGT‑CGTCATCGTGCTGTTCATCGCGATCTTTGCCAACTGGATTGCACCCTATAACCCGGCGGAACAGTTCCGCGATGCACt > 1:1026792/1‑237 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |