| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,974,708 | T→G | 18.0% | V35G (GTT→GGT) | gadX → | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,974,708 | 0 | T | G | 18.0% | 294.9 / 19.6 | 133 | V35G (GTT→GGT) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/60); new base G (23/2); total (71/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.60e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAA > NC_007779/3974470‑3974946 | aTTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TC‑GTTTTTGACGGAtcaaacgaact > 2:78849/1‑229 (MQ=255) tcatcCTGTTCTCCGGCTTCCTTTAAAATTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACACGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGa < 1:1758465/239‑1 (MQ=255) ttCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TC‑GGTTTTT‑TGGTTG‑C‑AAG‑ACCAATTCTAGTAGATaa > 1:2210682/1‑239 (MQ=255) ttCTACCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑TCC‑CG‑GTTTTTG‑CGGGAG‑T‑AAG‑CCAAAATCTTGTAGAGaa > 2:1681069/1‑239 (MQ=255) tAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGG‑C‑ATC‑AG‑GTTTTTG‑TGGGTT‑C‑AAT‑GCAAATTTTATTAATTAAG‑TGA‑G‑ttttatcttt > 2:2008951/1‑231 (MQ=255) atcaatcaATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGTAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGG‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCgtg‑t < 2:231325/239‑1 (MQ=255) gcggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTATTTGTG‑TG‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTTATTA‑ttt > 1:602285/1‑239 (MQ=255) cggcgTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑CT‑GTTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAG‑CCAAATTTTATTAGAAAAG‑TGT‑G‑TTGG‑AAAATTTTTTTTTTGT‑‑TT‑AA‑GGGG‑GACG‑CTTTTCATTA‑ttt > 1:989243/1‑239 (MQ=255) cgTACTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAATTTGAGTAGTTTAG‑GGG‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTTTTTATT‑TT‑AA‑AGGA‑CAAG‑C‑TTTcttctgtctttt > 2:1552547/1‑228 (MQ=255) cAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TT‑GTTTTTT‑TTGGTG‑G‑AAG‑CCAAAATCGAGTAGATAAA‑TGT‑G‑TT‑G‑TAAATTTTTTATTTGTG‑TC‑AATGAGA‑AAC‑‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCCATGTCT‑Aa‑ggaggag > 2:2155139/1‑239 (MQ=255) aGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TTGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTATTTAGGTAAA‑TGT‑G‑GT‑T‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑AGGA‑CACG‑C‑TTCAATTA‑TTTTTCCCCCTGCTC‑Ca‑gtaggggg > 2:1422114/1‑239 (MQ=255) tAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGa‑ca < 1:509997/201‑1 (MQ=255) ttATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑AAC‑TC‑GGTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAG‑CCCAATTCGAGTAGATAAA‑TGT‑G‑GT‑G‑GAAAATTTTTATTTGTG‑TC‑CA‑GGGA‑AACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTTCCCCTGCTC‑CA‑TGAGGAGGCATTAAATCt > 1:2086493/1‑239 (MQ=255) ttATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑GCCTTG‑GTTTTTT‑GGGTTG‑‑‑AAG‑CCAAAATTGAGTAGATAAG‑TGG‑G‑GT‑G‑GTAATTTTTTTTTCGTG‑TC‑AA‑AGGG‑GACG‑C‑CTTTATTT‑TTTTTTCCGATTCTC‑TC‑GGGGGGGGGAGTAAATCt > 1:1620985/1‑239 (MQ=255) ttATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑CG‑GGTTTTG‑CGGACG‑C‑ATA‑ACAAAATCTAGACGATAAG‑AGG‑G‑GT‑G‑TAAATTTTGTTTTTTGG‑TC‑AA‑CGGG‑CAAA‑C‑TTACATTA‑TTTTTCCCGATTGTT‑CA‑TTAGGAGGCGTTAAAtat > 1:1023109/1‑237 (MQ=255) aTGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ATC‑TG‑GGTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTTTAGTAGATAAG‑CGG‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTTGTG‑TT‑AA‑AGGA‑GACG‑C‑TTTTATTA‑TTTATTCCGCTGCTT‑AA‑AGAGGGGGGATTaaaatt > 1:1087295/1‑234 (MQ=255) aTGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTTTTGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑TAAATTTTGTTTTTTTG‑TC‑AA‑GGGA‑AACG‑C‑TTTCTTTA‑TTTCTCCCGTTTCTC‑AA‑GGGGGAGGCATTAAAACt > 1:1137842/1‑237 (MQ=255) gTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGTT‑G‑AAG‑CCAAATTTGAGTAGATAAA‑TGT‑G‑TT‑T‑GAAATTTTTTTTTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTTCCGCTTCTC‑AA‑AGAGGGGGCATTAAATCTTctt > 1:745573/1‑237 (MQ=255) atatTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑TT‑GGTTTTT‑TGGGTG‑G‑AAG‑CCCAAATCGAGTAGAAAAG‑TGT‑G‑GT‑G‑AAAATTTTTTTTTTTTG‑TT‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTCCCGCTTCTC‑AA‑GGAGGGGGCATTTAATCATCATGc > 1:1422551/1‑238 (MQ=255) aGTCAACTATGCAGTCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑TG‑GTTTTTG‑TGGGTG‑A‑AAG‑CCCAAATTTAGTAGGTAAA‑GGG‑G‑TT‑T‑AAAATTTTTTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑AAAG‑C‑TTTTATTA‑TTTTTTCTGATGGTC‑AA‑GAAGGAGGCATTAAAAATTCATTtaa‑a‑taaa > 1:1102962/1‑239 (MQ=255) aGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑TG‑GGTTTTT‑TGGGGG‑T‑AAA‑CCAAAATTTAGTAGATAAG‑AGT‑G‑TT‑G‑TAAATTTTGTTTTTGTG‑TC‑AA‑AGGAGTAGG‑C‑TTT‑TTTT‑TTTTTCTCCATGCTC‑AA‑GGAGGAGGGAGTAAAACTTTATgtaactaaa > 2:1586796/1‑231 (MQ=255) tGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGTGG‑ACC‑TG‑GTTTTT‑‑TGGATG‑C‑TAG‑ACAAAATCGTGTAGATAAA‑AGT‑G‑TT‑G‑TAAAATTTTTATTTGTT‑GC‑AA‑AGGA‑AACA‑C‑TTTTATTT‑TTTCTATCTATGCTC‑TA‑AGAGGGGGCTATATATTATCCTTCAC‑T‑TAAAAAACtttat > 1:2113157/1‑237 (MQ=255) aTCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATGTATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTGTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCAt < 2:1955160/239‑1 (MQ=255) tCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGTGG‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGTGG‑C‑AAC‑CAAAATTC‑AGTAGATTAA‑AGG‑G‑TT‑T‑GAAATTTTTTTTTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑GACG‑C‑CTTTATTT‑TTTTTTCCCATGGTC‑TA‑AGAGGGAGGATTTAAACTTTCTTCAA‑A‑Taaaaaaaattttttctt > 2:747129/1‑228 (MQ=255) tCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑CG‑GGTTTTT‑TGGAGG‑G‑AAA‑CCCAAATTGAGTAGATAAA‑TGT‑G‑GT‑G‑TGAATTTTTTATTTTGG‑TT‑AA‑GCGG‑CACC‑A‑TTTCATTA‑TTTTTTCCGCTGCTC‑AA‑AGAGGAGGGGTTAAAACTTTTTGTAC‑A‑TAAAAAAAATTCTTCttt > 1:1713647/1‑239 (MQ=255) tCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑TAC‑TT‑GTTTTTT‑GGGGTG‑C‑AAA‑CCAAAATTAAGAAGATAAG‑AGA‑G‑GT‑G‑TAAATTTTGTTTTTGTG‑TC‑AA‑AGGA‑CACG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTTCCGATGCTC‑AA‑GGAGGGAGCATTAAATATTTTTGTAC‑A‑TAAAAAAAATTTTTCAtt > 2:1153959/1‑239 (MQ=255) tCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑GCC‑TT‑GTTTTTT‑TTGATGTC‑AAC‑CCAAA‑TCTCGTAGAAAAA‑GGTGG‑TG‑G‑AAATTTTTTTTTTTTTG‑TC‑AG‑GGGA‑CA‑G‑C‑TTTCATTATTTTTTCCCTAT‑CTCTAA‑GAGGGGGGCTTTAAACTTTCTTGAAT‑A‑AAAAAAAGTtttttctt > 2:933313/1‑237 (MQ=255) tCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑TG‑GGTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTGGGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TT‑AA‑GGGA‑CAAG‑A‑CTTCATTA‑TTTTTTCCGATTGTT‑AA‑TGAGGAGGGATTAAAACTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTTCTCAtt > 1:1062350/1‑239 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑TT‑GTTTTTT‑TTGGTG‑G‑AAG‑ACAAAATTTAGGAGATAAG‑AGT‑G‑TT‑T‑TAAATTTTTTTTTTTTG‑TC‑AA‑GGGA‑AACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTTCCTCAGCTC‑AC‑GTAGGAGGCGTTAAAACTTCTTATAC‑A‑Taaaaaaaattttttatt > 2:470853/1‑226 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑GTGGTG‑G‑AAG‑ACACAATTTATAATATAAG‑GGG‑G‑TT‑T‑GATATTTTTTATTTTTG‑TCTAA‑GGGA‑ACCC‑C‑TTTCTTTT‑TTTTTCCCCATGTTT‑TA‑‑GAGGGGGGATTTAATATTTATGCAC‑A‑ATAAAAAATTTTTTCTTTaa > 2:867352/1‑238 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTc < 1:119423/119‑1 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTAc < 1:1788188/239‑1 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑CG‑GTTTTTT‑TTGGTG‑CAAAA‑CCAAATT‑ATGAATGTAGA‑TGT‑G‑TT‑G‑TAAAATTTTTATTTTTT‑TG‑TA‑AGGA‑ACCG‑C‑TTTTATTA‑TTTTCTCCGATTGTC‑AA‑CGAGGAGGGATTTAATATTCACTCAC‑A‑TAAAAAAATTTCTTCaat > 2:1775826/1‑235 (MQ=255) aCTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑CC‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑ACAAAATTTAGAAGAAAAA‑TGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTGTATTTGTG‑TC‑TA‑GGGA‑GACG‑C‑TCTTATTA‑TTTTTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAAACTTCATTCAC‑A‑TATAAAAGTTTTTTAAtt > 2:1076223/1‑237 (MQ=255) cATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGa < 1:1846384/117‑1 (MQ=255) cATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCg < 1:964185/180‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcat < 1:381451/238‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcat < 1:1395697/238‑1 (MQ=255) gAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcat < 1:1527895/238‑1 (MQ=255) atttGTTTAATTGGGTATCAAAGACATAAATATATTTTCTCCATTGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATT‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑ATAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcatca < 2:1142550/237‑1 (MQ=255) ttGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGTG‑T‑AAG‑ACAAATTCTAGTAGATAAG‑GGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTTTTTTTT‑TT‑AA‑AGGG‑CACG‑C‑GTTCATTA‑TTTTTCCCCATGCTC‑TA‑GGAGGAGGGGTTAAATCTTTATGCAC‑ATTAAAAAAGTTTTTTC‑TTACtca‑ttcatttct > 2:630271/1‑235 (MQ=255) ttGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑T‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGTG‑G‑AAG‑CCAAATTATTATAGATAAG‑TGT‑G‑GT‑G‑AAAATTTTTTTTTTTTG‑GC‑AA‑GGGC‑CACG‑G‑ATTCATTA‑TTTTTCCCGCTGCGC‑TA‑GGAGGGGGGATTAAATCTTTATTATC‑A‑TCAAAAAAATTTTTCTCTTCACG‑TTCATAAcc > 2:1945345/1‑238 (MQ=255) ttGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACt < 2:2137765/239‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACT‑TG‑GGTTTTT‑CTGGTG‑G‑ATA‑ACATAATCTAGTATATAAG‑TGT‑G‑TG‑G‑AAAATTTTTTATTTTTG‑TT‑CA‑GTGT‑GAGA‑C‑TCTCATTT‑TTTTTCCCGGCTTTT‑AA‑TGTGGGGGCAGTAAATCTTTACTGAT‑A‑TGAAAAAATTTCTTCATTATTTG‑ttttattc > 2:206698/1‑229 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑Aa‑ggagga < 1:1575922/183‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGc < 1:1858982/201‑1 (MQ=255) tCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcatca < 1:1929380/234‑1 (MQ=255) tAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑GAACA‑TG‑GTTTTT‑‑CGGGTG‑C‑TAA‑CCAAAATTGAGTAGATAAG‑TGA‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTTATTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑A‑CTTCCTTT‑TTTTTCCCGATGCTT‑AA‑GGAGGAGGGCTTAAAACTTCATTCCC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTTATTACTAG‑TTCATCACTgtagt > 1:782682/1‑239 (MQ=255) tAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTgtagt < 1:1681069/239‑1 (MQ=255) aTTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGGG‑T‑AAA‑CCAAAATTGGTTAGATAAG‑AGT‑G‑GT‑G‑GAAAATTTTTTTTTTTG‑TG‑AA‑AGGG‑CACG‑C‑ATTTCTTA‑TTTTTTCCGATTTTT‑AACGGGGGGGGAATTAAAT‑TTTATTACC‑A‑TAAAAAAAATTTTTTATTTCTTG‑Tttatccccttcttt > 2:1891456/1‑229 (MQ=255) aTTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGtagtag < 1:2155139/239‑1 (MQ=255) ttGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAG‑TT‑GTTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAA‑ACAAAATATGGTAGATTAGATGG‑G‑TT‑G‑‑AAATTTTGTTTTGTTG‑TG‑AA‑AGGG‑AAAG‑C‑TTTTATTA‑TTTTTTCCGGTGGTT‑AT‑AGAGGAGGGATTAAAAAATCATGTAT‑A‑TAAAAAAATTTTTTCTTTATTCC‑TTCATCAATTgagtagc > 1:441555/1‑238 (MQ=255) tATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑GCC‑TG‑GTTTTTT‑CGGGTG‑G‑AAA‑CCAAAATCGAGGAGAAAAA‑TGG‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTTTTTGTG‑GT‑AA‑AGGA‑AAAG‑C‑CTTCATTT‑TTTTTCCCCCAGCTC‑CA‑AGGGGAGGCATTAAATATTCTTTCAA‑A‑TAAAAAAAATTTTTCATTTATCG‑TTCATCACTCTATTTAAGatat > 2:1907653/1‑239 (MQ=255) tATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GGTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATCGAGGAGATAAG‑TGG‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑CTTTATTA‑TTTTTCCCCATGCTC‑AA‑GGAGGAGGGATTAAATATTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGATTCTTTTTTACTCG‑TTCTTCACTGTAGTAGAGatat > 1:1471859/1‑239 (MQ=255) tATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑CG‑GTTTTTT‑TGGGTG‑T‑AAG‑CCAAAATTGAGGAGATAAA‑GGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTTTTTGTT‑TC‑CA‑GGGA‑GACG‑C‑CTTTATTA‑TTTTTCCCGTTGCTC‑AA‑GGGGGGGGGGTTAAATCTTTATGCCC‑A‑AAAAAAAGATTTTTTATTAATAG‑TTCTTCATCTTTGTAGAAatat > 2:1191388/1‑239 (MQ=255) tGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑CG‑GGTTTTG‑TCGGTG‑C‑AAA‑CCAAAATTCAGGAGATAAA‑AGT‑G‑GT‑GTAAAATTTTTTTTTC‑TT‑TC‑AA‑GGGA‑AAAG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTTCCCATTATC‑AA‑AGGGGAGGGCATAAATTTTCTTTCAC‑C‑TAAAAAAAATTTTTTATTTCTCT‑TTTCTCACCTTAATagaggaaat > 1:31791/1‑233 (MQ=255) aTAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACt < 1:1875003/216‑1 (MQ=255) ttCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTTATGGCGGT‑G‑TCC‑CGTGTTTTTT‑GGGGGG‑A‑AAA‑CAAAATTTTA‑TAGATAAA‑GGTGG‑TT‑T‑AAAATTTT‑TATTTGTGTTA‑AA‑GGGA‑AAGC‑C‑TTTCTTAT‑TTTTTTCCTAT‑TTT‑AA‑GGAGGGGGGATTAAATCTTTATTCAC‑C‑TTAAAAAATTTTTTCTTTACACG‑TTCATCATCGTAATAAAGATATTTATTTTTTTTAGTAAGtt > 2:581546/1‑239 (MQ=255) ttCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTGAGTAGATAAG‑TGT‑GTTT‑G‑AAAATTTT‑TTTTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTCCCCATGGTC‑CA‑GGAGGAGGGATTAAAATTTTATGCAC‑A‑TAAAAAAAATTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTACTGTTTTTCAGGAAGtt > 1:1267240/1‑239 (MQ=255) tcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGTG‑G‑AAA‑CCAAAATTTAGGAGATAAA‑TGT‑G‑GT‑G‑GAAATTTTTTTTTTGTG‑TT‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTT‑TTTTTTCCCATGCTC‑CA‑GGAGGAGGGATTAAAACTTTATTCAC‑A‑TAAAAAAATTTTTTTATTATTTG‑TTCATCACTGTTGTAGAGATATTTCTTTTTTTTATGaaagttgg > 1:185122/1‑233 (MQ=255) tcACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GGTTTTT‑TGGGTG‑G‑AAG‑CCAAATTTGGGTCGATAAA‑GGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTATTTGGG‑TC‑AA‑GGGA‑GACG‑C‑CTTCTTTT‑TTTTTTCCGCTGCTC‑AA‑GTGGGAGGCATTTAATTTTCTTGCAC‑A‑AAAAAAAATTTTTTCCTTACTCG‑TTTCTCACTGTAGTAGAAAAATTCCTGTTTTTTTTGAAGtttt > 1:766390/1‑236 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑TGGGTG‑G‑AAG‑CCAAAATTGAGGAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTATTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTCCCCATTCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAATTTTTTTATTACTCG‑TTTATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTTAGGAAGTTGCGCa > 1:337517/1‑239 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GGTTTTT‑TGGATG‑C‑CAG‑CCAAATTTGAGTAGATAAG‑GGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGG‑CACG‑C‑CTTTATTT‑TTTTTTCCGATGGTC‑CA‑GGGGGAGGGATTAAATCTTCATTCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCTTTACTCG‑TTCATCCCTGTAGTAGAGATATTCCTTTTTTTTATGAAATTGCGCa > 1:415470/1‑239 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑CG‑GGTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAG‑CCAAATTTTAGTATGTAAG‑GGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTATTTGTG‑TG‑TA‑AGGA‑GACGCC‑TTTCA‑TA‑TTTTTCCCTCTGTTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATTTTTATTCACAA‑TAAAAAAATTT‑TTTATTACTCG‑TTCATCAATGTAGTAGAGATATTTCTTTTTTTTATGAAGTTTCGCa > 1:1006665/1‑239 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑TG‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTGAGGGGGTAAG‑TGG‑G‑GT‑T‑GAAATTTTTTATTTGTG‑GC‑AA‑AGGG‑CACG‑C‑CTTTATTA‑TTTTTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGGATTAAATATTTATGCAC‑A‑TAAAAAAATTTCTTCATTACTCG‑TTTATCACTGTAGTAGGAATAATTCTGTTTTTTAGGGAGtttgcga > 1:1941855/1‑234 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑AAC‑TG‑GGTTTTT‑TGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATTGAGTAGATAAA‑GGG‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTTTTCGTG‑TC‑AA‑AGGA‑CACG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTCCCGCTGGTC‑AA‑GGAGGAGGGCTTAAATCTTCATTCCC‑A‑TAAAAAAAATTCTTTTTTTCTCG‑TTTATCACTTTAGTAGAGATATTCCTTTTTTTTAGGAAATTTCGCa > 1:452658/1‑239 (MQ=255) aCCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGG‑T‑ACC‑CT‑GTTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAAATCTAGGACATAAA‑GGT‑G‑TT‑T‑AAAATTTTTTTTTTGTG‑TC‑AA‑GGGG‑CACG‑C‑TTTTAATA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAAACTTCATTCAC‑A‑TTAAAAAATTTCTTCAATATTCT‑TTCATTACTGTAGTAGAGAAATTTCTGTTTTTTATGGAGTTGCGCa > 1:977469/1‑239 (MQ=255) ccATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCaa < 2:977469/239‑1 (MQ=255) ccATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑AC‑GTTTTTA‑TGGATG‑C‑GAGCCCAAACTTTAATA‑AAAAG‑TGG‑G‑TT‑G‑AAAAATTTTTATTTTTT‑GC‑CA‑CGGA‑AAAC‑C‑TTTACTTA‑TTTCACCCCATGGCC‑CA‑GGAGGGAGCATTAACACTTCATTAAA‑C‑TAAAAAAAATTTCTCCTTAATCGTTTCAT‑ACAGTCGTAACGATATTCATGTTTCTCATGAAATTggtca > 2:2143754/1‑234 (MQ=255) aTGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑CC‑GGTTTTG‑CGGAGG‑A‑AAA‑CCAAAATCGAGTAGATAAG‑TGG‑G‑TT‑G‑AAAAATTTTTTTTTGTG‑TT‑AA‑GGGA‑AACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTCCCGATGTTC‑TA‑GGAGGAGGCATTAAAACTTCATTTAC‑A‑CAAAAAAGATTCTTCATTATACG‑TTTATTACTTTATGATAGATATTTCTGTTTTTTTGGTAGTTGCGCacat > 1:1846426/1‑236 (MQ=255) gTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCatta‑tt < 1:189076/122‑1 (MQ=255) gTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGt < 1:1025586/173‑1 (MQ=255) gTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcatca < 1:1515041/194‑1 (MQ=255) gTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑Ttcatca < 1:1155541/194‑1 (MQ=255) gTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAgg < 1:858949/223‑1 (MQ=255) tAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCg < 1:1684350/238‑1 (MQ=255) tAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCg < 2:1422551/238‑1 (MQ=255) aaTGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑TTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCa < 1:1422114/239‑1 (MQ=255) aaTGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCa < 2:110280/239‑1 (MQ=255) tGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCa < 1:2206936/216‑1 (MQ=255) gAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATa < 2:1471859/238‑1 (MQ=255) aaTATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑GCC‑TG‑GGTTTTT‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAATTTGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTTTATTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CAAG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAAATTTTTCATTAATCG‑TTTATCACTGTAGTAGAGATATTTCTGTTTTTTAGGAAATTGCGCAACTATTGCAGAATaaa > 1:286007/1‑238 (MQ=255) aaTATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑GCC‑CG‑GTGTTTT‑CGGGGG‑C‑AAG‑CCAAATTTGAGGAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTATTTTTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTTATTT‑TTTTTTCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGGATTAAAACTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAAATTTTTCATTAATTC‑TTCATCACTGTTGTAGAGAAATTCCTGTTTTTTAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAg > 1:1501934/1‑239 (MQ=255) atCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAAt < 1:1076223/239‑1 (MQ=255) atCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAAt < 2:31791/239‑1 (MQ=255) gCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCtt < 1:189211/239‑1 (MQ=255) tATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCg < 1:2115623/239‑1 (MQ=255) tATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCg < 2:286007/239‑1 (MQ=255) tATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCg < 1:630271/239‑1 (MQ=255) tATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTGTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATGTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGGTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCg < 1:646713/239‑1 (MQ=255) aTTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCg < 1:376846/238‑1 (MQ=255) tttAATGGCGGT‑T‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTa < 2:373807/239‑1 (MQ=255) ttAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTT‑CGGATG‑C‑CAG‑CCAAATTTTAGGAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑GAAATTTTTTATTTGTG‑GT‑AA‑GGGG‑CACG‑C‑CTTCATTA‑TTTCTCCCCATGGTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTTTTCATTTCTCG‑TTCATCCCTGTTGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTTTGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTAt > 1:200941/1‑239 (MQ=255) tAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGCA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATg < 1:835989/239‑1 (MQ=255) gCGGA‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑GGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTTGATAAG‑AGG‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTTGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTTTCCCGATTCTC‑AA‑TGGGGAGGCCTTAAATCTTCATGCAA‑A‑TAAAAAAGGTTTTTCATTACTTG‑TTCATCACTGGTGTAGAGATATTCCTGTTTTTTAGGAAGTTTCGCACCTATCGCAGAATAAAAATCTTTGCTATGCAGaa > 1:1768070/1‑239 (MQ=255) t‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATg < 1:20174/238‑1 (MQ=255) ttgcc‑TG‑GGTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑ACAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATg < 2:529651/235‑1 (MQ=255) c‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACg < 2:452658/239‑1 (MQ=255) gTTTTTG‑CGGGTG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTaa > 2:1027581/1‑239 (MQ=255) gTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GG‑GGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTaaa > 2:2069813/1‑239 (MQ=255) | CCTGCCCGTAGAACATCACACATTATCATCCTGTTCTCCCGCTTCGTTTAAATTTATTTATCAATCAATTTGACTTAAGAGGGCGGCGTGCTACATTAATAAACAGTAATATGTTTATGTAATATTAAGTCAACTATGCAATCACTACATGGGAATTGTCTAATTGCGTATGCAAGACATAAATATATTCTCACCATGGTTAATGGTGAATATCGCTATTTTAATGGCGGT‑G‑ACC‑TG‑GTTTTTG‑CGGATG‑C‑AAG‑CCAAATTCGAGTAGATAAG‑TGT‑G‑TT‑G‑AAAATTTTGTATTCGTG‑TC‑AA‑GGGA‑CACG‑C‑TTTCATTA‑TTTCTCCCGATGCTC‑AA‑GGAGGAGGCATTAAATCTTCATGCAC‑A‑TAAAAAAGTTTCTTCATTACTCG‑TTCATCACTGTAGTAGAGATATTCCTGTTTTTCAGGAAGTTGCGCAACTATCGCAGAATAAGAATCTTCGCTATGCAGAAATGCTACGTAAA > NC_007779/3974470‑3974946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |