| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 4,067,833 | 0 | G | C | 7.1% | 396.3 / 2.1 | 130 | A307A (GCG→GCC) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (103/16); new base C (2/9); total (105/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACTGAAGAGCGCAAAAAAGCGAATCAGTTTGATGCGCCAATCTCTATTTATGAAGTTCACCTGGGTTCCTGGCGTCGCCACA‑CCGACAACAATTTCTGGTTGAGCTACC‑GCGAGCTGGCCGATCAACTGGTGCCTTATGCTAAATGGATGGGC‑TTTACCCACCTCGAACTACTGCCCATTAACGAGCAT‑CCCTTCGATGGCAGTTGGGG‑TTATCAGCCAACCGGCCT‑GTATGCGCCAA‑CCCGCCGTTTTGGTACTCGC‑GACGACTTCCGTTATTTCATTGATGCCGCACACGCAGCTGGTCTGAACGTGATTCTCGACTGGGTGCCAGGCCACTTCCCGACTGATGACTTTGCGCTTGCCGAATTTGATGGCACGAACTTGTATGAACACAGCGATCCGCGTGAAGGCTATCATCAGGACTGGAACACGCTGATCTACAACTATGGTCGCCGTGAAGTCAGTAACTTCCTCG > NC_007779/4067600‑4068071 | aCTGAAGAGCGCAAAAAAGCGAATCAGTTTGATGCGCCAATCTCTATTTATGAAGTTCACCTGGGTTCCTGGCGTCGCCACA‑CCGACAACAATTTCTGGTTGAGCTACC‑GCGAGCTGGCCGAGCAACTGGTGCCTTATGCTAAATGGATGGGC‑TTTACCCACCTCGAACTACTGCCCATTAACGAGCAT‑CCCTTCGATGGCAGTTGGGG‑TTATCAGCCAACCGGCCT‑GTATGCGCCaa > 1:1963372/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |