Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,084,516 | A→G | 8.4% | E317G (GAG→GGG) | rtcA → | RNA 3'‑terminal phosphate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,084,516 | 0 | A | G | 8.4% | 500.6 / 2.4 | 191 | E317G (GAG→GGG) | rtcA | RNA 3'‑terminal phosphate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/90); new base G (6/18); total (83/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.66e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
CTTGAAGTCGAAAGTGAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGATGGTGGTTGCCGCGACTTCCA > NC_007779/4084278‑4084753 | gAAGTCGAAAGTGAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCg < 1:97626/239‑1 (MQ=255) aGTCGAAAGTGAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGtt > 1:1704831/1‑239 (MQ=255) aaGTGAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGc < 1:1253309/239‑1 (MQ=255) gAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCGATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGt < 1:1114411/239‑1 (MQ=255) aaaaTATCTCCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGt < 1:864306/238‑1 (MQ=255) aCCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGGGCGGGGGAATTTTCGGGCGCCCATCCCCCCTGCCCTCTGCCGGCCCATATAGCGGGGGGGGGGGGTTTTTTTCCGGGTGCGGttgg > 2:1361318/1‑237 (MQ=255) aaCGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTg > 1:934860/1‑239 (MQ=255) aCGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGa < 1:2008150/239‑1 (MQ=255) aCGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGa < 1:823226/239‑1 (MQ=255) ttttttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGa < 1:1085237/239‑1 (MQ=255) ttttGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGaa > 1:382348/1‑238 (MQ=255) tGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAg < 1:245816/239‑1 (MQ=255) tcgGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATgg < 2:228270/238‑1 (MQ=255) tcgGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGGGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTTGGTTGATAGAAACAGATGGc > 1:1943433/1‑239 (MQ=255) ggTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGGTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGt > 1:1862468/1‑239 (MQ=255) gAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTaa < 2:1704831/238‑1 (MQ=255) aaaGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAAcgc < 1:1358000/239‑1 (MQ=255) cgcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCgggg > 1:1998170/1‑238 (MQ=255) gcgTGAGTGCCGAGGTGGTTGCGGAACAGTTGGTGAAATAGGTGAAACGCTACCTGGCCAGCGAGGCGGCGGTGGGGGCATATCTTGCTGACCCACTGGTGCTTCCGCTGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 2:111490/238‑1 (MQ=255) gcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGCATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCGATATCGCGGTGGGGGAGCGGTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATCGGAACAGATGGCGTAACGCGGGTg > 1:1638752/1‑239 (MQ=255) gcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 1:1023169/238‑1 (MQ=255) gcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 2:1009385/238‑1 (MQ=255) gcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 1:1619119/238‑1 (MQ=255) gcgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGC‑GGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 1:656355/237‑1 (MQ=255) cgTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGGGCGGGGGGATTTACGGTCGCCCATCCCCCATGCCCTCTGCTGGCCCACATCGCGGTGGCGGGGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGCTTTGTTTGATAGAAACACAAGGGGGAAAGCGGGTGa > 2:742407/1‑239 (MQ=255) tGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCAtt < 2:1381657/238‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTGCCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGaa < 1:210990/238‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGaa < 1:2180688/238‑1 (MQ=255) gggtTGCGGAGCAGGTGGTGAAATAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCACCTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAatgatg < 2:1839546/237‑1 (MQ=255) ggtTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCa < 1:1361318/239‑1 (MQ=255) gtTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCa‑g > 1:1436684/1‑239 (MQ=255) gtTGCGGCACAGTTGGGGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCa < 1:2061897/238‑1 (MQ=255) ttGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCg < 1:1564391/210‑1 (MQ=255) ggCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGAt < 1:399280/238‑1 (MQ=255) aGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGt < 1:2147538/211‑1 (MQ=255) aGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGGGGAGCGTTTCCTGCC‑GGGGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGGAACGCGGGGGGGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAg > 1:802042/1‑238 (MQ=255) agGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGGGCGGGGGGATTTTCGGTCGCCCCTCCCTCATGCCATCTGCCGGCCAATATCCCGGGGGGGGGGCGGTTCCTGCC‑GGGGCGGTTTAGTTTTATAGAAAAAGATGGGTGAACCCGGGGGAGCCTTTGATGGTGCAGGAGAT‑TAAGCCGGGACTGgcgg > 2:1800937/1‑238 (MQ=255) agGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGgggc > 1:229129/1‑239 (MQ=255) agGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGGGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGgcgc > 1:884712/1‑239 (MQ=255) gAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGGTCTGGCGCGGTa > 1:2016600/1‑239 (MQ=255) aaCGCTACCTCGGAATCAAGGCGGCGGTGGGGGAAGATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGGGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCTTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGGGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGACGGATCTGGCGGGTTAt < 2:1233309/238‑1 (MQ=255) tACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGc < 2:934860/238‑1 (MQ=255) gCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GGGATGTAAAGCGGGTCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTacac > 1:912050/1‑239 (MQ=255) cgtgggggggggggggAATATTTTGCTGACCAACTGGGCCTCCCGATGGGGCTGGCGGGGGCGGGGGAATTTACGTTCGCCAATCCCTCATGCCATCTGCTGACTAATATCGCGGTGGTGGAGGGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCTTTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGTGTTATCCGTCTAAACTTACACg < 2:1436684/227‑1 (MQ=255) gggggcggTGGGGGAATATTGTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGGTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGGCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGGGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGGGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGcc < 2:1943433/235‑1 (MQ=255) tGGGGGAATTCCTTGCTGACCACCGGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGGGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAGCGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCca < 2:199726/238‑1 (MQ=255) ggAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTCCCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTa < 1:321851/214‑1 (MQ=255) tatCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGttt < 1:1668466/131‑1 (MQ=255) atCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCAATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGAGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCa > 1:1814929/1‑238 (MQ=255) tCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCg > 2:1152735/1‑146 (MQ=255) tCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCg < 1:1152735/146‑1 (MQ=255) tCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGc > 1:661627/1‑239 (MQ=255) tCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAAATTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAAAGCGGGGGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAAATTTCACGCCGTACCCCCTCACCTTCAGc > 2:1908561/1‑239 (MQ=255) ttGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCaa > 1:372052/1‑239 (MQ=255) tGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAAt > 1:317928/1‑239 (MQ=255) aCCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAg > 1:1060373/1‑132 (MQ=255) aCCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAg < 2:1060373/132‑1 (MQ=255) ccAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGTTCGCCCATCCCTCAGGCCATCTGCTGACCAATATCGGGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTgg < 1:957496/239‑1 (MQ=255) cAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGGCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGCTTCTTGCC‑GGCGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGCGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAACCGGATCTGGCGCGTCTACCGGCTAAACTTACCCGCCCGACCCCTACCTCTTCCACAATTgggcg > 2:608052/1‑234 (MQ=255) cTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCCCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGGTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTTAGCAATTGCTGGGCgt > 1:1518500/1‑239 (MQ=255) tGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCgtg < 1:1416842/239‑1 (MQ=255) gCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGGGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGtgttgt > 1:1772376/1‑239 (MQ=255) cTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCgg < 2:33514/186‑1 (MQ=255) cTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGtgttgt > 1:241527/1‑238 (MQ=255) aCCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGAGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTAcc > 1:1406663/1‑239 (MQ=255) ccGAGGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTCCGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTGGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCg < 1:1303085/239‑1 (MQ=255) gATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGGCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGGTCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCa > 1:1003185/1‑239 (MQ=255) aTGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCCGCTGACCAATATCGCGGTGGGGGAGCGTTTCTTGCC‑GGCGCGGGTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGGGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGAGCTGGCGCGTTATCCGGCTAAAATTACACACCCAACCCCCTCATCTTCAGCCATAGCGGGGCGTGTTTTACCGCa > 2:857791/1‑238 (MQ=255) ggCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGtgttgtgcagcctc > 2:1416824/1‑230 (MQ=255) ggcgggcgCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGa > 1:1475990/1‑239 (MQ=255) ggggAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACg < 1:1638385/238‑1 (MQ=255) ggAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCAATCTGCGGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGTTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTACCGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATTTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCGAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGcc < 1:467872/238‑1 (MQ=255) atgtACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGGGGTGGTGGGGCTTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTAATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATGGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGt < 1:857791/236‑1 (MQ=255) aTTTACGGTCGCCCTTCCCTCAGGCCATCTGCTGACAAATAGGGCGGTGGGGGAGCGTTTCTTGCC‑GGGGCGTTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGt < 2:1781370/239‑1 (MQ=255) ttgcGGTCGCCCATCCCTAATGCCTTCTGCTGACAAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTACCGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGttt < 1:1800937/236‑1 (MQ=255) ttACGGTGGCCCTTCCCTCATGCCATCTGCTGACAAAGAGCGGGGTGGTGGGGCGTTTCTTGCC‑GGGGCGGTTTAGTTGGATAGAAACAGATGGGGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGttt < 2:128055/239‑1 (MQ=255) aCGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGtt > 1:567653/1‑236 (MQ=255) ggTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGa > 1:906714/1‑239 (MQ=255) tCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTaa < 1:1876288/126‑1 (MQ=255) tCGCCCATCCCTCAGGCCATCTGCTGACCAATATGGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGAt < 2:382348/238‑1 (MQ=255) cGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGGGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATTGGCCACGCCGAGTTTCTGATa < 1:1200065/238‑1 (MQ=255) cGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTaca < 1:152994/159‑1 (MQ=255) cGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTaca > 2:152994/1‑159 (MQ=255) gCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACa > 1:940993/1‑239 (MQ=255) cccATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGcc < 1:76227/224‑1 (MQ=255) cccATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGcc > 2:76227/1‑224 (MQ=255) cccgcccTGAGGCGATCTCCTGACCAAGATCGGGGGGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATTGAAACGGAGGGCGTAAGGGGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGGTGTAGGCTGGATTGGGCGCTTTATCCGGTTAAACTGACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCTCGCCGAGTTTCTGATACAGa < 2:2058140/235‑1 (MQ=255) ccATCCCTCGTGCCATCTGCTGACCAATAACGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGTTTTAGTTAGAAAGAAACGGATGGCGTACCGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGACGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGc < 2:550143/185‑1 (MQ=255) tGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGCGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGatat > 1:1690757/1‑239 (MQ=255) tGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGCGGCGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGACGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGtgtt > 1:550143/1‑185 (MQ=255) tgctgACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGtttt > 2:14996/1‑239 (MQ=255) ctgACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGAGATGCGTTTTGa > 1:510594/1‑239 (MQ=255) tgACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGAt > 1:449594/1‑239 (MQ=255) aCCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTa < 1:1205492/126‑1 (MQ=255) cAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATa > 2:1882372/1‑211 (MQ=255) cAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATa < 1:1882372/211‑1 (MQ=255) gtggAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGATGGTGGTTGCCGCGACt > 2:1875753/1‑238 (MQ=255) gtggAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGGTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGATGGTGGTTGCCGCGACt > 2:2042814/1‑238 (MQ=255) gAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGATGGTGGTTGCCGCGACTTCCa > 1:267696/1‑239 (MQ=255) aGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCg > 2:232954/1‑170 (MQ=255) | CTTGAAGTCGAAAGTGAAAATATCACCGAACGCTTTTTTGTCGTCGGTGAAAAGCGCGTCAGTGCCGAGGTGGTTGCGGCACAGTTGGTGAAAGAGGTGAAACGCTACCTGGCAAGCACGGCGGCGGTGGGGGAATATCTTGCTGACCAACTGGTGCTACCGATGGCGCTGGCGGGCGCGGGGGAATTTACGGTCGCCCATCCCTCATGCCATCTGCTGACCAATATCGCGGTGGTGGAGCGTTTCTTGCC‑GGTGCGGTTTAGTTTGATAGAAACAGATGGCGTAACGCGGGTGAGCATTGAATGATGCA‑GAGATGTAAGCCGGATCTGGCGCGTTATCCGGCTAAACTTACACGCCGTACCCCATCATCTTCAGCAATTGCTGGGCGTGTTGTACCGCATCCTGGCGATGGGCCACGCCGAGTTTCTGATACAGATTGCGGATATGCGTTTTGATGGTGGTTGCCGCGACTTCCA > NC_007779/4084278‑4084753 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |