Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,108,953 | T→G | 16.5% | V326G (GTG→GGG) | Y75_RS20260 → | DUF4153 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,108,953 | 0 | T | G | 16.5% | 496.7 / 14.2 | 177 | V326G (GTG→GGG) | Y75_RS20260 | DUF4153 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/123); new base G (33/2); total (52/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TCTCCGCCGCCGGGTTGCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACTATCTACATGCTCGAGCAGAGC > NC_007779/4108719‑4109191 | gccgccgGGTTGCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGGGCCGGCGGGGGTGGG‑GTGATTggg > 2:885217/1‑238 (MQ=255) tGCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCt < 1:1144528/238‑1 (MQ=255) ggCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGAGCGTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCt < 1:1167131/237‑1 (MQ=255) gCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑gg < 2:35465/239‑1 (MQ=255) gCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑gg < 1:2048537/239‑1 (MQ=255) ccTGGCC‑TTTTGCAATTGATCTTAATGGGTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCTTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGt < 2:1690565/238‑1 (MQ=255) tGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGt < 2:1491342/238‑1 (MQ=255) cTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCa < 1:1702689/239‑1 (MQ=255) tGCAATTGATCTTAGTGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTc < 1:2083265/239‑1 (MQ=255) tAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GTTACTTGGGGGGGCGCT‑GGGGTATTTTGTTAGGATCGTCT‑GGCGTAAAagg > 1:249317/1‑239 (MQ=255) tttGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGGCCCTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCGGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATcc < 1:615269/238‑1 (MQ=255) ttGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GTTACTGGTGGGGGCGGT‑GGGGGATTTTGTTAGCATCGGCT‑TGGGGAAAAGGGAAAAAccc > 1:522200/1‑239 (MQ=255) gcgATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCgttgtt < 1:113116/239‑1 (MQ=255) tCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGttcttc < 1:1582696/239‑1 (MQ=255) gCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGG‑GTTACTGGGGGGGGCGCT‑TGGGGATTTTTTTAGCATCGTCTCGGGGTAAA‑GGCAAAAACCCggtgtttcttagg > 1:2133050/1‑232 (MQ=255) caaaaGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑ggg < 1:815654/237‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTCACTTCACTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGCGGCGGT‑GTTTCTCGTGTGGGTGAT‑GGGGGGTTTGTTCAGGATCTGCT‑CGGGTGAAGGGCGAAATCCCgtggtttcttctcgg > 2:1824075/1‑230 (MQ=255) gTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTa < 2:1052317/203‑1 (MQ=255) gTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTa > 1:1052317/1‑203 (MQ=255) tCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTg < 1:934543/239‑1 (MQ=255) cccTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGc < 1:456790/183‑1 (MQ=255) tGGACCGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGt < 2:488657/239‑1 (MQ=255) tGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGt < 1:1245569/239‑1 (MQ=255) aCAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAGCCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGttt < 2:726137/238‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGGTGGTGGTTTCGGGTG‑GGCGGCC‑TGGGGGTTTTGTTAGCGTAGTCT‑GGCGGAAACGGGCCAATTCCGTTCTTCTTCA‑GGGGCAAAAGACCCTTGTGGGTTCggtt > 2:1562658/1‑236 (MQ=255) ggCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GTTACTGGTGTGGGCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGGAAAGGGGAAAATCCCGTTGTTTTTCT‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGGTTCG‑TTa > 1:1671275/1‑239 (MQ=255) ggCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGG‑GTTTATGGTGGGGTCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCCACTGCC‑GGGGTGAAGGGGCAAATCCCCTTTTTTTTTATGGGAAAAGGAAACCTTCGGGTTGCG‑tt > 2:422302/1‑239 (MQ=255) ggCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGATCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGG‑GGTACTGGTGGGGGCGCC‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGGAAAGGGCCAAATCGCGCTGTTCTTCT‑GGGCACAGTGGACCCTGCGGTTTTG‑TTa > 1:690243/1‑239 (MQ=255) gCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTa < 1:512136/238‑1 (MQ=255) ctgtggcgttgcCTAGTTAAAGCCGCTTAGCTTGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCTTCGCCGCCTGGTCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCTGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTGGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAAGCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGATCCTTGCGGTTTCG‑TTAt < 2:2060931/233‑1 (MQ=255) ccGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAt < 1:582871/238‑1 (MQ=255) ccGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAt < 1:753723/238‑1 (MQ=255) ccGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAt < 1:847375/238‑1 (MQ=255) cgttgcgttgCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTTGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttg < 1:1768092/239‑1 (MQ=255) ttgcgttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggt > 1:1738047/1‑239 (MQ=255) tgcgttgcCTGATTCAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggt < 2:118315/238‑1 (MQ=255) tgcgttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggtg < 1:1873193/239‑1 (MQ=255) gtgttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGGCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGGCCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGTCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggtgt < 1:1149655/237‑1 (MQ=255) gcgttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCGGCTGTAGTTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATTGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGATCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑TGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggtgt < 1:975754/239‑1 (MQ=255) gttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTAttggtgtt < 1:502957/238‑1 (MQ=255) ttgcCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGGTGGG‑GGTTCTGGGGGGGGCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATTGTCC‑CGGGTAAAAGGGGAAAACCCGTTGTTTTTCG‑GGGGACAGTGAACCTTTCGGTGTCT‑GTAttggtgtttg > 2:1711516/1‑237 (MQ=255) gATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑c < 1:1406564/239‑1 (MQ=255) actAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTAGGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGGTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTg < 1:1172675/209‑1 (MQ=255) aTTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GGTGATGGTGTGGTACCT‑GGGGGAATTTTTCTGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGGGAAATGCCCGTGTTGTTCC‑TGGCAAAGTGAACCCTGTGGGTTTG‑TTATTTGGGTTGGGGAt > 2:863323/1‑236 (MQ=255) aaaaCCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGt < 1:1625269/239‑1 (MQ=255) cTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGGTGGG‑GTTGCCGGGGGGGGGGCC‑GGGGGGGTTTGTGCGCCGCGGTG‑TGCGTGAAGGGGGAAATGCCGTTGGTTTTTC‑GGGCAAAGTGGACCTCGTGGGTTCG‑TTATTGGGGGTGGTGATT‑CTGGTGcttctt > 2:1282425/1‑239 (MQ=255) cTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGT‑GTTACTTGTGGGGGGGCTGGGGGTATTTGTTCGGCGT‑GTCT‑GGCGTAAAGGGGCAAAACCCGGTGTTTTTTC‑GGGCCAAGTGGACCTTGCGGGTTCGTTTATTGG‑GTTTGTGGTACCTGGGGctttt > 2:1396222/1‑237 (MQ=255) ggTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAGCCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 1:570008/239‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 1:371777/239‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 1:1353189/239‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 1:1556389/239‑1 (MQ=255) gattGGTCCCCTGTATGTGTTCGTCGCCGCGTGGGGGTTATGGCGGCGGGTCGCGCAGTAAGGCTTGAGCGTGGGCCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGGTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCGGGTTGTTCTTCA‑CGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTTG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 2:635398/237‑1 (MQ=255) gTTGCTCGGCGGTGTGTGTTCGTCGCCGCCTGGGGGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 2:1738047/238‑1 (MQ=255) gTTGCTCCGCGTTTTTTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCGGCGGGTCGCGCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 2:249317/238‑1 (MQ=255) gTTGCGCCGCTGTGTGTGTGCGTGCCGGCCTGGGCGTTTGGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGCCCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGc < 2:2185596/238‑1 (MQ=255) tGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCg < 1:1396222/238‑1 (MQ=255) tCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGc < 2:435162/239‑1 (MQ=255) gccGCTTGATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGGCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGATGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTg < 2:571908/237‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTTGCGACCGCTTGCAGGGCGGGCGGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:1053198/238‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGt < 1:94381/187‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:926520/238‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:1509688/238‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:1965086/238‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 2:1607200/238‑1 (MQ=255) tGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAATGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:1562658/238‑1 (MQ=255) tATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGttctt < 1:1324071/162‑1 (MQ=255) tATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGa < 1:290345/236‑1 (MQ=255) gtgtTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTAt < 1:893695/239‑1 (MQ=255) cgtcgCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTTCGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCa < 1:1108858/239‑1 (MQ=255) cgtcgCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCa < 1:1206144/239‑1 (MQ=255) tcgCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGGTGGT‑GTTACTTGTGTGGGCGCT‑GGGGGGTTTTTTCAGCCTCGCCC‑GGCGTAAAGGGCAAAAACCCGGTGTTTCTCT‑CGGGGAAGTGAACCCTGCGGGTTCC‑TCTTTTGGGTTTGTGGTA‑CTGGTGCGTCTTAATTCGTCGTGTG‑TGGACAGttgtcgcctt > 2:2031388/1‑230 (MQ=255) tcgCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGCGCTGGG‑GTTTCTGGTGTGGTCGCT‑GGGGGGTTTTGTCCGCATCGGCT‑GGCGGAAAGGGGGAAATCCCGGTGTTCTTTA‑GGGCCAAg > 2:1324071/1‑162 (MQ=255) ccTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCGCGGTTGGGCTGGACTGTGGACCGCTTGCAGGGGGTGCTGGCGGTGCTGTG‑GTTACTGGTGTGGTCTCT‑GGGGTATTTTGTCAGAACCGTCT‑GGCGTAAGGGGCAAAATCCCGTTTTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGTTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTg < 2:1658151/239‑1 (MQ=255) tGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GTGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGaa < 1:1120041/239‑1 (MQ=255) tGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGaa < 1:1915384/239‑1 (MQ=255) gTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGc < 1:422302/238‑1 (MQ=255) gACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GTTACTGGTGGGGGCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGGTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAac > 1:60324/1‑238 (MQ=255) gACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGGGCTGGG‑GTTTCTGGTGTGGGCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAAACCCGTTGTTTTTCA‑GGGGCAAGTGAACCTTGCGGGTTCG‑TTATTTGTGTTGGGGATA‑CTGGTGCTTCTTTATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATgcgc > 2:1941260/1‑193 (MQ=255) cTGTGGCCCGCTTTGAGGGATTGCTGGGGGTGCTGGT‑GTTAGTGGTGGGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCGGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAacac < 2:1308554/238‑1 (MQ=255) cTGTCGGCCGCTTGGAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTTAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACg < 2:514576/239‑1 (MQ=255) cTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGaa > 1:869193/1‑202 (MQ=255) cTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGG‑GGTACTGGTGTGGGCGCT‑GGGGGATTTTTTCAGCATCGTCT‑GGGGGAAAAGGCGAAAACCCGCTGTTTTTCA‑GGGCCAAGGGAACCTTGTGGGTTTG‑TTATTTGGGGTGGTGATA‑CTGGGGGTTCTTAATTCCCCC‑GGGGTGGGCAGGATGGGCATTAAGGTTGAAAGCCATATGGCGCCGTTTTCAG‑GGGGCAAAAacaa > 2:750316/1‑237 (MQ=255) cGACCGGTTGCAGTGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCAGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCa < 1:1731986/238‑1 (MQ=255) gACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTATCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAATTCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGa < 1:2031388/239‑1 (MQ=255) gACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGC‑GTTACTGGTGTGGGCGCT‑GGGGTATTTTGTCCGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑ATTGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACCGGATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTTTCTGAGCGGCAAAAACACGTCAg > 1:1308554/1‑238 (MQ=255) ccGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTGTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGAc < 1:1486089/238‑1 (MQ=255) ttGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGgcg < 2:1072831/204‑1 (MQ=255) ttGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGt < 1:1607709/239‑1 (MQ=255) gggCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTTTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTAATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACt < 2:522200/238‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTACTTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACt < 1:1817624/236‑1 (MQ=255) cGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCCCT‑GGGGTATTTTGTCAGGATCGTCT‑TGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAAGCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTTGTGATC‑CTGGTGCTTCTTTATTCTCCG‑GTGCTGGACAGTATGAGCCTTATCGTTGACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAACAACACGTCAGACCCGGTCACTATCt > 1:243118/1‑239 (MQ=255) gTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGaa < 2:1059696/182‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGGGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGaa > 1:1059696/1‑182 (MQ=255) tGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCaaaaa < 1:488157/214‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACTATCTAc > 1:1468374/1‑239 (MQ=255) tGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACTATCTAc > 1:72951/1‑239 (MQ=255) tGCTGGCGGTGCTGGG‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGGATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGGGCGGCAAAAAAACGCCAAAACAGGGAActacctac > 2:948359/1‑239 (MQ=255) ggCGGTGCTGGT‑TTTACTGGTGTGGTCGCG‑GGGGTATTTTGTCGGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAGAAGTCGGTTGTTCTGCA‑GGGCAAAGTGACCCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑TTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGGCCAGGTAACTATCTACATg < 2:690243/238‑1 (MQ=255) t‑gtTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCATCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGAc < 1:289085/146‑1 (MQ=255) t‑gtTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGAc > 2:289085/1‑146 (MQ=255) | TCTCCGCCGCCGGGTTGCTGTTGACGCTGGCCTTTTTGCAATTGATCTTAATGGCTATTGTCCGCGATCCGCAAAAAGCGTCACTTCCCTGGACAGGGCCGTTGCGTTGCCTGATTAAAACCGCTTTGCTGGTTGCTCCGCTGTATGTGTTCGTCGCCGCCTGGGCGTTATGGCTGCGGGTCGCTCAGTACGGCTGGACTGTCGACCGCTTGCAGGGCGTGCTGGCGGTGCTGGT‑GTTACTGGTGTGGTCGCT‑GGGGTATTTTGTCAGCATCGTCT‑GGCGTAAAGGGCAAAATCCCGTTGTTCTTCA‑GGGCAAAGTGAACCTTGCGGTTTCG‑TTATTGGTGTTGGTGATA‑CTGGTGCTTCTTAATTCGCCG‑GTGCTGGACAGTATGCGCATTAGCGTGAACAGCCATATGGCG‑CGTTATCAGAGCGGCAAAAACACGTCAGACCAGGTAACTATCTACATGCTCGAGCAGAGC > NC_007779/4108719‑4109191 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |