Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 4,217,867 | 0 | G | T | 9.9% | 597.7 / 3.2 | 184 | intergenic (‑154/‑3) | Y75_RS20915/metA | acetyltransferase/homoserine O‑succinyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (120/41); new base T (2/21); total (122/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-09 | |||||||||||
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Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
AGTGGCATCGACAGAACGACACCAAATCGCAACGAGTTCCTCCCCTTCCTCATGCCGTGAGCGGCGAATACTAATAACCATTTTCTCTCCTTTTAGTCATTCTTATATTCTAACGTAGTCTTTTCCTTGAAACTTTCTCACCTTCAACATGCAGGCTCGACATTGGCAAATTTTCTGGTTATCTTCAGCTATCTGGATGTCTAAACGTATAAGCGTATGTAGTGAGGTAATCAGGTTATGCCGATTCGTGTGCCGGACGAGCTACCCGCCGTCAATTTCTTGCGTGAAGAAAACGTCTTTGTGATGACAACTTCTCGTGCGTCTGGTCAGGAAATTCGTCCACTTAAGGTTCTGATCCTTAACCTGATGCCGAAGAAGATTGAAACTGAAAATCAGTTTCTGCGCCTGCTTTCAAACTCACCTTTGCAGGTCGATATTCAGCTGTTGCGCATCGATTCCCGTGAATCGCGCA > NC_007779/4217633‑4218104 | gACACCAAATCGCAACGAGTTCCTCCCCTTCCTTATGCCGTGAGCGGCGAATACTAATAACCATTTTCTCTCCTTTTAGTCATTCTTATATTCTAACGTAGTCTTTTCCTTGAAACTTTCTCACCTTCAACATGCAGGCTCGACATTGGCAAATTTTCTGGTTATCTTCAGCTATCTGGATGTCTAAACGTATAAGCGTATGTAGTGAGGTAATCAGGTTATGCCGATTCGTGTGCCgg < 1:1056970/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |