| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 4,283,269 | A→G | 6.4% | T401A (ACC→GCC) | Y75_RS21200 → | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,283,269 | 0 | A | G | 6.4% | 506.5 / 2.2 | 182 | T401A (ACC→GCC) | Y75_RS21200 | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/98); new base G (11/2); total (81/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GAGTCTGCGGCGGGTACGGCGGCGGGCGGTAAAACCGGTTTGACGGCTATCACCGTTGGCGTGCTGTTCCTCCTGATTCTGTTCCTCTCTCCGCTCTCTTACCTCGTTCCGGGGTATGCAACGGCTCCGGCGCTGATGTACGTTGGCCTGCTGATGCTGAGCAACGTGGCGAAAATCGACTTTGCTGATTTTGTTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGACCTGTAACATCGTAACAGGCATCATGATCGGCTTCGCGACTCT‑G‑GTGATTGGTC‑GTC‑T‑GGTTTCCGGCGAAT‑GGCGCAAGTTGAACATCGGT‑AC‑GGTCGTTATCGCCGTGGCGCTGGTGACCTTCTATGCGGGTGGCTGGGCTATCTAATCTTTCATCGGATTCTGAAAACGGGTGGCAATGGCTGCCCGTTTTTATTTTCTCCGCACATTGTGTGAGCTTTTGCGATATTCTGAAA > NC_007779/4283032‑4283506 | gAGTCTGCGGCGGGTACGGCGGCGGGCGGTAAATCCGGTTTGACGGCTATCACCGTTGGCGTGCTGTTCCTCCTGATTCTGTTCCTCTCTCCGCTCTCTTACCTCGTTCCGGGGTATGCAACGGCTCCGGCGCTGATGTACGTTGGCCTGCTGATGCTGAGCAACGTGGCGAAAATCGACTTTGCTGATTTTGTTGATGCGATGGCGGGTCTGGTTACGGCTGTATTCATCGTGCTGAc < 1:282830/239‑1 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |