| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,322,862 | T→C | 9.4% | E194G (GAG→GGG) | phnK ← | phosphonate C‑P lyase system protein PhnK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,322,862 | 0 | T | C | 9.4% | 388.4 / 4.0 | 139 | E194G (GAG→GGG) | phnK | phosphonate C‑P lyase system protein PhnK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (80/41); new base C (5/11); total (86/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ACCTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATG > NC_007779/4322625‑4323094 | gccTACGGGGAGCGCATTGGTCGGCCGGATAAGGCGGTTCGGCCGCATCC‑GGCAGCGGCGCAATTCTGCAAAGCCGATGACACCAGCCGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAAGCACCACCGCGAGGTTCAGCtg < 2:305533/238‑2 (MQ=255)aCCTACGGGGGGAGCTTTTGTGGGCCGGAGAAGGCGTTTACGCCGCGTCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGAGGACACCAGCAGCTGTGTATACGGGTGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGGCGGTTAACCCACCCTCCACCTCTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTc < 2:237987/239‑1 (MQ=255)aCCTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCt > 1:422743/1‑238 (MQ=255)aCCTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTAGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCt > 1:1331966/1‑238 (MQ=255) cttACGGGCAGCGGATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCCTCC‑GGCCCCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCCCTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTc < 2:204289/236‑1 (MQ=255) ccTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTc < 1:1288709/238‑1 (MQ=255) ccTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTc < 1:420538/238‑1 (MQ=255) ccTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCCAAATCATGGGGGACAATCACCACCGCCAGGGTCAGGTc > 2:511256/1‑238 (MQ=255) cGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCCTGGGGGACAATCACCACCGCGAGGGTCGGCCccacc > 2:1425372/1‑238 (MQ=255) aGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCCACCCCTAAACTCTGGGCGGCAATCAACACCGCGCGGGTCCGCCCCACCCCCAg > 2:810798/1‑238 (MQ=255) gctcATTTGTAGGACGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAGACCCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAAGCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAgg < 1:1723053/235‑1 (MQ=255) gcgcATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCGGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGATCAACCACCAgg > 1:2230941/1‑238 (MQ=255) gcgcATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCCCCACCAgg > 1:567960/1‑238 (MQ=255) ttGTAGGCGGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCgca < 1:1791224/239‑1 (MQ=255) ttGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCgca < 1:2094950/239‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTTACGCCGCAGCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGa < 2:1498263/239‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGTTGACGCCGGGTCC‑GGCAACGGTTCAATTCTGCAAAACCGATGCCACCAGCAGCTGGTTATACGGTTGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGTCCGGTTAACCCTTTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCATGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCGCCAGGCCGCGCTGCAGGTCGa < 2:1482338/239‑1 (MQ=255) gactAAGGCGTTT‑CCCCGGAGCCTGGCACGGGTTTAATGTTGAAAAACCGATGCAAACAGCTGCTGTGTACTGGGCTGATGCTGTTAGTCGAGCACGCGGTCGGTTATCCCACTCTCCCCCTCTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGCCCGCCAGTTGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGTTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCCCCAGCCCGCGCAGCAGGTCGa < 2:1807764/236‑1 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGa > 1:746414/1‑238 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGGCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGTCGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGAAGCAGGTCGa > 1:1980371/1‑238 (MQ=255) aTAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAg < 1:2200454/238‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCTTAAATCATGGGTGACAATCA‑CACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg < 1:401907/239‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg < 1:1923820/239‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg < 1:517339/239‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg < 1:1316521/239‑1 (MQ=255) ttACGCCGCATCC‑GGCCCCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGc < 1:349394/238‑1 (MQ=255) ttACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGcc < 1:1080051/239‑1 (MQ=255) ttACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCCCGAGGTTCAGCTCCACCACCCGGCCGCGCAGCAGGGCGAGCAGGCGGGc > 2:1675013/1‑238 (MQ=255) tACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCCACCCCCAAATCATGGGGGACAATCCCCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCCGGCCGCGCAGCAGGTCCAGCCGGGGGGcc > 2:1583720/1‑238 (MQ=255) gccgcATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCa < 1:1631820/239‑1 (MQ=255) cgcATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCAcc < 1:700531/239‑1 (MQ=255) cgcATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCAc > 1:80558/1‑238 (MQ=255) gcATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGCATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCCCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGcccc > 2:935587/1‑238 (MQ=255) ccATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGTTGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGCTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCGGCAAACGGACCGCCAGCAGGCGGGGCCCGGCCACATCCAGCGTGACAATAACCACCGCGAGTGTGGGCTACACCACCCGGCCCGCCAGCAGGGCTAGCCGGCGGGccgtgtccg > 2:802831/2‑232 (MQ=255) accc‑GGCACCGGCTCATTTCTGCAAAACCGATGACCCCGGCAGGTGGTTATACGGATGATGCGGGTCGGCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCCCCCCTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAAGCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGa < 2:161579/236‑1 (MQ=255) aTCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGa < 1:1425372/238‑1 (MQ=255) aTCC‑GGCACCGGCTCAATTCGGCAAAACCGATGGCACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCCCTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCGCCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGac < 1:111032/239‑1 (MQ=255) c‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACCCCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGAcaca < 1:1480870/239‑1 (MQ=255) c‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCTACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGAcaca < 1:1623578/239‑1 (MQ=255) ttCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCCACACATCCAGCCCGCcgg > 1:709382/1‑238 (MQ=255) tgaacaaCCGAGGCCCCCAGCGGCGGTGATAACGGATGCTGCGGGTCGTCGACCCCGCGGTCGGTAACCCCCCCCTCCACCACTGGCCCCTGCTAC‑ACCGCCACCAAGCGGTCCGCCAGCGGGCGGGCGACCCCAAAATCATGGGTGAAAATCACCACCGCGAGGTTCAGCCCCCCCCCCAGGCCGCGCGGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCcggtcgg < 2:422743/234‑1 (MQ=255) cAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCCGc > 1:187569/1‑226 (MQ=255) ccGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGGCGGTTCATc > 1:338771/1‑238 (MQ=255) acCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCAGGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAacac < 1:384471/239‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACAcc < 1:1413492/239‑1 (MQ=255) cagcagCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCCCTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAACCGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGCCCCTAAAATCATGGGTGACAATCACCCCCGCGAGGTTCAGCCCCCCCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCa < 1:980715/239‑1 (MQ=255) gtgtATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCgg > 1:1365516/1‑238 (MQ=255) gtATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTACCCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCCCCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCCCCACCGCGAGGTTCAGCTCCGCCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATg < 1:511256/239‑1 (MQ=255) tatcCGCATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTACCCCACTCCCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGCCGCCTAAATCATGGGTGCCAATCCCCACCGCGAGGTTCAGCTCCCCCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATg < 1:935587/238‑1 (MQ=255) ataCGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCCCCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑Cg < 1:478285/239‑1 (MQ=255) taCGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACAAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCCGCTTCGGCTG‑Cg > 1:410205/1‑238 (MQ=255) aCGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCCCCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCGACACCTCCAGCCCGCCGGTCGGTTCCTCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGt > 1:1713186/1‑238 (MQ=255) gatgatGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCAcc > 1:1934899/1‑239 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACATTCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATTAACACCCGCTTCGGATG‑CGTCACCAg > 1:1744760/1‑239 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCATCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCGCCACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCAcccg > 1:1576410/1‑237 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCCACACATCCCGCCCGCCGGGCGGTTCATCCCTAAACCCCAGCTTCGGCTG‑CGTCAcccg > 1:1986918/1‑237 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGCTG‑CGTCCCCAg > 1:824979/1‑239 (MQ=255) tgatgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAAGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCCACCCACCCAGCCCCCCGGTCGGTTCATCCACAAACACCCGCTTCCGactcctccccac > 2:601864/1‑228 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCCGCTTCGGACG‑CGTCACCAg > 1:754703/1‑237 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAggg > 1:1235971/1‑238 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCACCCATAAACCCCAGCTTCCGATG‑CGTCACCAg > 1:566383/1‑237 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCCACACATCCAGCCCGCCGGGCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGt > 1:485537/1‑239 (MQ=255) atgCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCCCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCCACACATCCAACCCCCCGGCCGGGTCATCCCTAAACACCAGCTTCCGATG‑CGGCACCCggg > 1:2109081/1‑238 (MQ=255) cgtcgAGCACGCGGTCGGTTACCCCACTCTCCACCACTTGCCCCTCCTCC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGTTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGc < 1:355731/238‑1 (MQ=255) cACGCGGTCGGTTACCCCACTCTCCCCCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCCCCCCCGCGAGGTTCAGCTCCACCCCCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCa < 1:1838898/239‑1 (MQ=255) cACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCACCCATAAACACCAGCTTCCGATG‑CGTCCCCAGGGTGCGGGCAATCTTCa > 2:1838898/1‑239 (MQ=255) gccggtcggtTGACCCAC‑CCCCCCCCCCTGCCCCTGCCTCAATCCCAGGCAAACGGCCCGCCAGCCGGCGGGCGAGGCCTAAACAAGGGGGGAAAATCCCTATCGCGAGGTTCAGCCCCCCGCCCAGGCCCGGCGGCAGTGCGAGAAGCCGGGCCTGCCCCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCaaa < 2:1576410/237‑1 (MQ=255) ctctCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGGCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑ccgcc > 1:431387/1‑239 (MQ=255) tctcCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg > 2:2040560/1‑131 (MQ=255) tctcCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAgg < 1:2040560/131‑1 (MQ=255) ctcCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCgg > 1:1208882/1‑239 (MQ=255) caccacTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCCACCCACCCACCCCCCCGGGCGGTTCACCCCTAAACCCCACCTTCCGATG‑CGCCACCAGGCTGCGGGCAATCTGCCAACCCTGCCGCCTA‑CCGCCGCaaa > 2:2150499/1‑239 (MQ=255) accacTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCCCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGacaa > 1:311866/1‑239 (MQ=255) accacTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCCACCCATCCAGCCCCCCGGTCGGCTCATCCCTAAACACCAGCCTCGGAGG‑CCTCCCCAGGGTGGGGGGAACCTGCAAAACCTGCTGCATA‑ccgcccgtaat > 2:689861/1‑233 (MQ=255) accacTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGACAAGGCGGGCCTGCACCGACACACCCAGCCCCCCGCGCGGGTCATCCCTAAACCCCACCCTCGGATG‑CCGCACCAGGTTGGCGGCAAACTGCACACGCTGCTGCATA‑CCGCCggggaa > 2:223647/1‑235 (MQ=255) cTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCGCCACATCCAGCCCGCCCGTCCGGTCCTCCATAAACACCCGCCTCGGATG‑CGTCACCCGGGTGCGGGCAAACTGCAAACCCCGCCGTCTA‑CCGCCGGAAAAgggg > 2:2164022/1‑237 (MQ=255) ttGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATCAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCCCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAggtgg > 1:1516843/1‑239 (MQ=255) gCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCTGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGCCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCGCCCCATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACCCCCACCTCGGAAG‑CGTCACCCGGGTGGGGGGAATCTGGACACCGTGCTGCCTA‑CCCCCGGAAAAggtgggg > 2:562851/1‑237 (MQ=255) gCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGGCGGTTCATCCCTAAACACCACCCTCGGCAG‑CGGCCCCCGGGTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCCGCAGA‑CCGCCGGAACAGCGGGTc > 2:2115367/1‑239 (MQ=255) gCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGGGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCCGCCCGCCCGTCGGGTAATCCATAAACCCCAACCTCGGATG‑CGCCCCCCGGGTGCGGGCAACACGCCAACGCTGGCGGCTA‑CCGCCGGGACAGGAGGTc > 2:827161/1‑239 (MQ=255) tcaCCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGCCGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCCCCGACCCATCCAGCCCCCCGGTCGGGTCCTCCCTAAAAACCACGCTCCGAGG‑CCCACCCACGGTGCGGGCCACCTTCCAAACCTGCTGCATACCCCCCGGCAAAGG‑GGTCGGCAGgtcgct > 2:1446454/1‑236 (MQ=255) tcaCCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGtcgtcg > 1:1502159/1‑239 (MQ=255) aGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCCGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGGGGTCGGCAGGCCGGCGATCCg > 1:1802757/1‑239 (MQ=255) aGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGCGGTCGGCCGGTCGTCGATCCg > 1:1704589/1‑239 (MQ=255) aGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCGGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCg > 1:575680/1‑239 (MQ=255) gCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCCGCACCCACACATCCAGCCCGCCGGGCGGGTCATCCATAAACACCCGCCTCGGGTGCCGTC‑CCCGGGTGCGGGCAAACCTCAAACCCTGCCGCATA‑CCCGCGGGAAAGGTGGGCGGGCGGGCGGCGCTCCgg > 2:1003353/1‑239 (MQ=255) tCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCCCCGCCACCTCCCGCCCCCCGGCCGGGTCATCCATAAACACCAACTTCGGATG‑CCCCACCAGGTTGCGGGCACACTGCAAAACCTGCTGCATC‑CCGCCGGAAAAGGGGGTGGGCAGGTCGTCTGTCCGCTT‑GCGGGa > 2:615136/1‑239 (MQ=255) cagcggGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCCCCACCGCGGGGTTCAGCTCCACCCCCAGGCCGCGCAGCGGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtct < 1:1583720/239‑1 (MQ=255) ccaaaaTCATGGGTGCCAACCCCCCCCGCGGGGTTCAGCCCCCCCCCCAGGCCGCGCAGCGGGTCGGGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCa < 1:1324265/236‑1 (MQ=255) gggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCa > 1:1376674/1‑132 (MQ=255) ggTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTAGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg > 1:1178365/1‑239 (MQ=255) aCAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGGTGCGGGCAATCTGCAAACGCGGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGCGGGCGGCAGGTCGTCGATCCGGGTGGGGGGGATCCCCCCCCCTCCCACCCCCTTCCTCGCGgggg > 2:1706547/1‑238 (MQ=255) aCAACCCCCCCCGCGGGTTTCACCCCCCCCCCCAGCCCGCGCAGCAGGGCGGGCAGGCGGGCCTGCCCCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGc < 1:1733499/239‑1 (MQ=255) cAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGGGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGCATCCCCACCTCTTCCAGCCACTTCTTCGCGGTGGc > 1:998731/1‑238 (MQ=255) accaccGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGGTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGCTCCGGTTGGGGGGGATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCCGGGGCACGaac > 2:419484/1‑238 (MQ=255) caccGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata > 1:1397233/1‑238 (MQ=255) caccGAGAGGTTCACCGCCCCCACCGGGCCGCGCGGCGGGGCGAGCAGGCGGCCCGGCCCCGACACTTCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 1:1003353/239‑1 (MQ=255) cgggggggtcaaGCCCCCCCCCCGGGCCGCGCGGCGGGCCGGGCAGGCGGGCCTCCCCCGACCCATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg < 1:995028/228‑1 (MQ=255) ttCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCTCCGTAATg > 1:831278/1‑239 (MQ=255) ttCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCCCCACCTCTTCCCGCCACCTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATg > 1:1912716/1‑239 (MQ=255) | ACCTACGGGGAGCGCATTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCC‑GGCACCGGCTCAATTCTGCAAAACCGATGACACCAGCAGCTGTGTATACGGATGATGCGGGTCGTCGAGCACGCGGTCGGTTAACCCACTCTCCACCACTTGCCCCTGCTTC‑ATCACCAGCAAACGGTCCGCCAGCAGGCGGGCGACGCCTAAATCATGGGTGACAATCACCACCGCGAGGTTCAGCTCCACCACCAGGCCGCGCAGCAGGTCGAGCAGGCGGGCCTGCACCGACACATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATG‑CGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATA‑CCGCCGGAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGTAATG > NC_007779/4322625‑4323094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |