| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 630,516 | A→G | 6.4% | D467G (GAT→GGT) | cstA → | carbon starvation protein CstA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 630,516 | 0 | A | G | 6.4% | 638.9 / 2.6 | 213 | D467G (GAT→GGT) | cstA | carbon starvation protein CstA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/122); new base G (16/2); total (88/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
GTGTATTTTGCCATGAACAGCCCGATGGCGGTGCTGGCTCCGGCAGGGACGGCGGATGTGGTCGCTTCTGCCGCGCAGGTGGTGAGTAGCTGGGGCTTTAGCATTACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGAT‑GGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGATGTGGCGTTCTGGTATCACTTCGCCATTTTGTTTGAAGCACTGTTTATTCTGACGGCGGTGGATGCAGGTACGCGTGCTGCGCGCTTTATGTTGCAGGATCTGCTGGGCGTGGTGTCTCCTGGCCTGAAGCGGACCGATTCACTGCCTGCT‑AACCTGCTGGCAACAGCGCTGTGCGTACTGGCGTGGGGCTACTTCCTCCATCAGGGCGTGGTCGATCCGCTGGGCGGCATTAAC > NC_007779/630281‑630751 | gtgtATTTTGCCATGAACAGCCCGATGGCGGTGCTGGCTCCGGCAGGGACGGCGGATGTGGTCGCTTCTGCCGCGCAGGTGGTGAGTAGCTGGGGCTTTAGCATTACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGAT‑GGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATgatggatg < 1:415130/238‑1 (MQ=255) tgtATTTTGCCATGAACAGCCCGATGGCGGTGCTGGCTCCGGCAGGGACGGCGGATGTGGTCGCTTCTGCCGCGCAGGTGGTGAGTAGCTGGGGCTTTAGCATTACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGAA‑GGCCTACATTCTGCACGGCGCGCTGGGCGGCATGATGGGtgtg > 1:1644300/1‑239 (MQ=255) tATTTTGCCATGAACAGCCCGATGGCGGTGCTGGCTCCGGCAGGGACGGCGGATGTGGTCGCTTCTGCCGCGCAGGTGGTGAGTAGCTGGGGCTTTAGCATTACACCAGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGTGCGCCGACGCTGGCGGTGGGGAT‑GGCCTACCTTCCGCACGGCGCCCCGGGCGGGATGGTGGGTGGGGc > 1:854862/1‑239 (MQ=255) tATTTTGCCATGAACAGCCCGATGGCGGTGCTGGCTCCGGCAGGGACGGCGGATGTGGTCGCTTCTGCCGCGCAGGTGGGGAGTAGCTGGGGCTTTAGCATTACACCCGATACGCTAAACCAGATTGCCAGCGAAGTGGGTGAACAGTCGATCATTTCCCGTGCGGGCGGGGCGCCGACGCTGGCGGGGGGGAT‑GGCCTACATTTTGCCCGGCCCGCTGGGGGGGCGGATGGGTGTggg > 2:1298208/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |