Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 864,182 | A→G | 11.1% | D40G (GAT→GGT) | fsa → | fructose‑6‑phosphate aldolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 864,182 | 0 | A | G | 11.1% | 494.3 / 10.7 | 206 | D40G (GAT→GGT) | fsa | fructose‑6‑phosphate aldolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/96); new base G (22/3); total (102/104) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
TTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTG > NC_007779/863947‑864417 | cGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTTACCAATAACCCCAGCATTATCGCCCCGGGGAAAAAAACGTGGGGtgttgt > 2:2013004/1‑239 (MQ=255) tCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCt > 1:1431582/1‑239 (MQ=255) tCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAAACCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTtgtg > 1:1936534/1‑237 (MQ=255) tCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTTACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTTGATGTTGTGCt > 1:1740576/1‑239 (MQ=255) tCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGGACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGTT‑GTGACCACTAACCCAAGGATTATCGCGGGAGGGAAAAAAACGGTGGGGGTTGTTCt > 1:1610105/1‑239 (MQ=255) aTTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCa < 1:2024364/239‑1 (MQ=255) cTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAAACCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAtta > 1:764379/1‑237 (MQ=255) tttCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGGCCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGGTGGATGTTGGTCTTCCGCAACTTccagga > 2:662115/1‑234 (MQ=255) tCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCCAGCATAATCGCCGCGGGGAAAAAAACGCTGGGTGTTGTGCTTCTGCCACtttctcaagc > 2:2090689/1‑231 (MQ=255) tCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGc > 1:1204500/1‑239 (MQ=255) tCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGc > 1:279953/1‑239 (MQ=255) tCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGGCCACTAAACCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCACATTCAT‑GAAGc > 1:1715583/1‑239 (MQ=255) tGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATgg < 1:1572628/239‑1 (MQ=255) tGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATgg < 1:1182153/239‑1 (MQ=255) tGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATgg < 1:1118117/239‑1 (MQ=255) tGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGc < 2:68066/239‑1 (MQ=255) aTGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGGCCACTAAACCAAGCATTATCCCCGCGGGGAAAAAACCGCCGGATGTTGTGCCTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCg > 1:2186405/1‑238 (MQ=255) aTGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCg > 1:980619/1‑238 (MQ=255) aTGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCCT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCg > 1:1084080/1‑238 (MQ=255) gtgCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAAACCAAGCATTAACGCCGCGGGGAAAAAACCCCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGAAGGGCGGTC‑AGGGGcc > 1:167310/1‑235 (MQ=255) gtgCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACCAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCg > 1:1539968/1‑236 (MQ=255) gCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑t < 1:1649593/239‑1 (MQ=255) cAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGc < 1:584791/239‑1 (MQ=255) cAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGc < 2:1936534/239‑1 (MQ=255) cAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGc < 2:1949814/239‑1 (MQ=255) tCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTa < 1:1784107/239‑1 (MQ=255) cAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGACCTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGACCACGAACCCAAGCATTATTGCCGCGGGTATAAAACCGCTGGAAGTTGTGCTTCCGCCACTTCCT‑TTAGAGATGGGTGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTaa > 1:1293198/1‑239 (MQ=255) agagTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGGC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGGAATgg > 1:100448/1‑239 (MQ=255) tttCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGTCCAATAACCCACGCATTATCGCCGCGGGGTAAAAACCGCTGGGTGGTTTGCCTCCCTCACCTCAT‑GAAGCGATGGGCGGGCGAGGGGTG‑CT‑G‑GTTGGCCAGGTAAAGGGTA‑c > 2:177570/1‑238 (MQ=255) tttCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGAACCCTAAACCCACCATTTTTACCCCGGGGAAAAAAACAGCGGGGGTTTTGCTTTCCCAACTTCATCAAAGGGATGGGCGG‑C‑AGGGGGGTCTCG‑TTTGTCC‑GGGCATGGCTaa > 2:1325083/1‑237 (MQ=255) aTAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGGCCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGCAAAAAACGCCGGGTGTTGTTGTTCCGCCACTTCCT‑TAAGCGGTGGGCGGTC‑CGGGGGGGCC‑G‑GTTTCCCCGGGAAAGGCTACCCCCTGCCGa > 2:596512/1‑239 (MQ=255) tCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑a > 1:461392/1‑195 (MQ=255) cTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAggg < 1:787159/237‑1 (MQ=255) cTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAggg < 1:662115/237‑1 (MQ=255) tACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGAtgt > 1:1451212/1‑157 (MQ=255) gACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGCGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGGTAATg > 1:39470/1‑238 (MQ=255) gACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGGTGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGGCT‑GTTTTGCCCAGGGAATGGCTA‑CCCCTGGCGAAGGGGGGGCTAATg > 1:800143/1‑239 (MQ=255) cAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGAcg < 2:278776/239‑1 (MQ=255) aCATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAg < 1:842521/239‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt < 2:1285792/239‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTg < 2:1431582/239‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCg < 1:883968/239‑1 (MQ=255) tGAGGAAGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCCAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCGC‑CCACTCCCGCAGGGGGGGTTAATGGCGCGCTTAAGCTGCGt > 1:622440/1‑239 (MQ=255) gAGGATGGTTATGGAACTGTATCTAGATACTTCAGACTTTGTTGCGGTTAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGtt < 2:159404/239‑1 (MQ=255) ggATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTc < 1:2210873/238‑1 (MQ=255) ggATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGGCCCCTAAACCAAGCATTATCGCCGCGGGGCCAAAAACGCTGGATGTTTTTCCTCCCCAACTTCAT‑CAAGCGATGGGGAGGC‑CGGGGCGTTT‑G‑TTTGCCCCGGTCAAGGCCT‑CCACCTGCGCAGGGGCGGGTAATGGCGCGCTTCAGATggctgct > 2:1668387/1‑233 (MQ=255) ttATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTattatt < 2:23219/239‑1 (MQ=255) cTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAAACCAAGCATTATAGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGGTGTTGTGCTTCCGCAACTTCCT‑GAAGCGATGGGCGGGC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTTCCCAGGGAATGGCCA‑CCACCGCCGAAGGGGTGGTTTATGACGCGCTTAAGCTTCGTGCTATTTTTTCgggaaa > 2:864317/1‑235 (MQ=255) tGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCCAGCCTTATCGCCCAGGGTAAAAAACCGCTGGGTGGTTTGGTTCCGCAACTTCCT‑GGAGCGATGGGCGGGC‑CGGGGCGTGT‑G‑TTTGACCCGGTAATTGCTA‑CCACTGCCGCAGGGGTGGGTAATGACGGGCCTAAGCTGCGTTCTATCCTTTCGGATTTc > 2:1278620/1‑239 (MQ=255) tGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATc < 1:1596748/239‑1 (MQ=255) gTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGGTGTTTTGCTTCCGCCACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTTCCCCGGTAATGGCTA‑CCCCTGCCGAAGGGGAGGGGAATGACGCGCTTTAGCTGCTGTCtcttatacacaaccga > 2:1089980/1‑228 (MQ=255) gTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAAACCCTGGAGGGTGTGCTTCCCCAACTTCAT‑GAAACGAAGGGCGGGC‑AGGGGGGTCT‑G‑TTTTCCCCGGGAATTGCTA‑CCCATGGCGGAGGGGTGGGTAAATGCGCGGCTAAGATGGGGTCTATTATTTCgggggatc > 2:163787/1‑233 (MQ=255) taatgcagcctttgttgCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTGCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGTTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGTTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGaaa < 2:1293198/227‑1 (MQ=255) cTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAAACCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGGTGTGCTTCCCCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑CGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGGAATGGCTC‑ACCCTGCCGAAGGGGTGGTTTATGACGGGCTTAAGCTGGGGTCCATTATTGCGGGCATGGT‑GGTGTAAGtt > 2:1928533/1‑239 (MQ=255) cTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGGCCACTAACCCAAACATTATCGCCGCGGGGAAAAAAACGCTGGAGGTTGTGCTTCCCCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGGC‑AGGGGGGTCT‑G‑GTTGCCCAGGTACAGGGTC‑ACACTGGCGGAGGGGTGGGTAATGGCGCGCTTAAGCTGCGTTGTATTATTGCGGGTCTCGG‑GGGTAAAgat > 2:1875308/1‑237 (MQ=255) cTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGACCCCTAACCCACGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGCTGGGCGGTC‑AGGGGCGGCT‑G‑TTTGCCCCGGGAATGGCTC‑CCCCTGCCGGAGGGATGGGTTATGCCGCGGCTTAGCTGCGGTCTTTTATTTCGGGTTTCGG‑TGTGGAAgct > 2:889036/1‑237 (MQ=255) aCGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTg > 1:132730/1‑239 (MQ=255) gttgttGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGGCCAATAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGGAAAAAACCGCTGGAGGTTGTGTTTCCGCCACTTCAT‑GAAGAGGTGGGCGGGC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACCGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTGAGCTGCGTTCTATTATTGAGGGTGTTGT‑GGGGAAAGTTCCGGGGa > 2:949227/1‑238 (MQ=255) gttgCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCCT‑GAAGCGATGGGCGGGC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGGAGGGATGGGTAATGACGCGCGTAAGCTGCGGTCTattatt > 1:368246/1‑207 (MQ=255) gttgCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGG‑GTGACCCCTAACCCAAGCATTATCCCCGCGGGTAAAAAAACGCTGGGTGTTGTGCTTCCGCAACCTCAT‑GCAGCGATGGGCGGGC‑CGGGGCGTCT‑G‑GTTTCCCCGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGCAGGGGTGGGTTATTACGCGCCTAAGCTGCGTTTCATTATTGTGGGCATCGTGGGTGAAGGTT‑CGGGGAccg > 2:1552982/1‑238 (MQ=255) ggTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGCCCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGCTATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAg < 1:1875308/238‑1 (MQ=255) gTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGGTGTTGTTCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑ACACTGCCGGAGGGGTGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGATCCGGTGACCGCCGAggg > 1:289733/1‑239 (MQ=255) gggcTGTAAGGTTTTTTTCCGCTGGGGGGG‑GGGCCCACTACCCCAAGCATTTTCGCGGCGGGTAAAAACCCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAG‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAAGGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTgg < 2:1298749/236‑1 (MQ=255) cccgttatccGTTTTTTCCTGCTGGGGGGG‑GTGGTCACGACCCCGATCTTTATAGCCGCGGGTAAAAACCCGCTTGTTGTGATTCTTCCGCGACTTCAT‑GAAGCTGTTGGCGGTG‑AGGTGCTCCT‑G‑TTTGCCCTGTTAATGTTTA‑CACCGGCCGAAGAGGTGTTTAATACCCGGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATGTCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTgg < 2:785057/229‑1 (MQ=255) cgcTTTCACGTTTTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGGCCACACACCCAACCATTATCGCCGCGGGTAAAAACCCGCGGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGGGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAGGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGc < 2:2098403/238‑1 (MQ=255) gttgtccgtttttttcCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTACCCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAg < 2:100448/228‑1 (MQ=255) tCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGtt < 1:2109936/181‑1 (MQ=255) cACTTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTCCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTAtt < 1:226371/239‑1 (MQ=255) cACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTAtt < 1:177570/239‑1 (MQ=255) cACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTAtt < 1:507261/239‑1 (MQ=255) gTATTTTTCCGCGGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAg < 1:1552982/239‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGCAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCCACTTCCT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGGCT‑G‑TTTGCCCAGGGAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTaaa > 1:505483/1‑239 (MQ=255) ggCGGGTGGTGACCACTACCCCAACCATTATCGCGGCGGGTAAAAAACCGCTGGAGGTTGTGTTTCCGCAATTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTG‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCGGCGTTTTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGc < 2:1051787/238‑1 (MQ=255) gACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTc < 1:891911/239‑1 (MQ=255) ccACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑c < 1:48544/112‑1 (MQ=255) ccACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑c > 2:48544/1‑112 (MQ=255) ccACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGtt > 2:602742/1‑220 (MQ=255) ccACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGtt < 1:602742/220‑1 (MQ=255) tAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGAc > 1:1975208/1‑237 (MQ=255) aaCCCAACAATTATCGCGGGGGGTAAAAAACCGCTGGTGTTTGTGTTTCCCCAATTTAAT‑GAAGCGTGGGGCGGTC‑GGGGGCGTCT‑T‑TTTCCCCAGGTAATGGCTA‑CCACGGCCGAGGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTTTTTTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTCCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCt < 2:843456/239‑1 (MQ=255) ccAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAGCCGCTGGATTTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTggg < 2:1781872/239‑1 (MQ=255) ccAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTggg < 1:1312518/239‑1 (MQ=255) aaGCATTTTCGCCGGGGGAAAAAACCCGCTGGGTGTTGTGTTCCCGCAATTTCAG‑GAAGCGATGGGCGGTC‑GGGGGCGTCT‑T‑TTTGCCCAGGTAAGGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCGGGGTTCTATTATGGCGGATAGCGG‑GGTGAAAGTTCCGGGGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGaa < 2:33477/239‑1 (MQ=255) aaGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGaa < 1:163787/239‑1 (MQ=255) ttATCGCCGCGGGTAAAAAACGGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGGGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGCTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACcgcg < 1:1843422/239‑1 (MQ=255) ttATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACcgcg < 1:1278620/239‑1 (MQ=255) ttATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACcgcg < 1:533815/239‑1 (MQ=255) tATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCgg > 2:215066/1‑239 (MQ=255) aTCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGGTAAAAGCGGAAGGGATTCCGGCGCCGGGAACCGCGGt > 2:170225/1‑239 (MQ=255) aTCGCCGCGGATAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGAtt > 1:1281849/1‑219 (MQ=255) cgcgGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATg > 2:289840/1‑239 (MQ=255) gggTAAAAACCCGCTGGGTATGGTTCTTCCGCATTTTGAG‑GTAGCGTTGGGTGGTC‑AGGGGGGTCG‑GTTTTGCCCAGGTAATGCCTA‑CCGCTGCGGAAGGGATGGTTAATGCCGCGCTTAAGTTGCGTTCTAGTATTGCGGAGATCGT‑GGTGAAAGTCCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACGGCGGTATATgg < 2:800143/238‑1 (MQ=255) gttAAAAACCCGCTGGATTTTTTCTTCCCGCAACTGCTT‑GAAGCGTTGGGCGTTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTC‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTTTTATGGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGgcg < 2:770318/236‑1 (MQ=255) ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGACGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGgcgc > 2:157044/1‑239 (MQ=255) ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGgcgc > 1:664773/1‑239 (MQ=255) ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGgcg < 1:215066/238‑1 (MQ=255) ggTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGGGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGgcgc > 1:960466/1‑239 (MQ=255) gCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt < 2:50921/111‑1 (MQ=255) tGGATGTTGTGCTTCCGCAGCTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGGTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGGGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGgctg < 1:219384/239‑1 (MQ=255) tGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGGTGGGCGTTC‑TGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAGGGGATGGTTAATGACGGGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGGGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGgctg < 1:2096961/239‑1 (MQ=255) | TTTCGTTCAAGCATTAAAATACTTTCGAATGAAAGTTAGATTGATGTGCGTCAACTGTTCAGAGAGTTTTCCCGTGATAGTCTACATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGT‑GTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCCGCGGGTAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCAT‑GAAGCGATGGGCGGTC‑AGGGGCGTCT‑G‑TTTGCCCAGGTAATGGCTA‑CCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGT‑GGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTG > NC_007779/863947‑864417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |