| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 959,491 | 0 | T | G | 14.6% | 247.3 / 4.5 | 95 | G86G (GGT→GGG) | aroA | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/59); new base G (14/2); total (34/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCCATCGCTCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCTGGAGTTGTTCCTCGGTAACGCCGGAACGGCAATGCGTCCGCTGGCGGCAGCTCTTTGTCTGGGTAGCAATGATATTGTGCTGACCGGTGAGCCGCGTATGAAAGAACGCCC‑GATT‑GGTCATCTGGTGGATGCGCTGCGCCTGGGCGGGGCGAAGATC‑ACTTACCTGGAACAAG‑AAAATTATCCGCCGTTGCGTTTACAGGGCGGCTTTACTGGCGGCAACGTTGACGTTGA > NC_007779/959254‑959727 | aCCCATCGGTCGGTTTGATGCGACTATTAAGCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTAGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATCCGCTTTCAGCCGATCGTTCGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGGGGTCCATTACACGCAGAAGGTg < 2:1380425/239‑1 (MQ=255) 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cGCTCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGGGCCCTgg > 1:1250909/1‑239 (MQ=255) tCGTGTCGATGGCACTATTAATCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCTGGAgt < 1:2216093/239‑1 (MQ=255) ggATGGCACTAGTAAGCTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTATCCTCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCGGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGGCTTGGAGTTGTTc < 2:1221036/237‑1 (MQ=255) cTGCCCGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCCGAAAGTGCCCTGGAGTTGTTCCTCCGGAACGCCgggaa > 1:1934528/1‑236 (MQ=255) cccGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCATTACACGCAGAAGGTGCCCTGGAGTTGTTCCTCGGTAACGCCGGAACGGc > 1:1892160/1‑239 (MQ=255) cccGGTTCCAAGAGCGTTTCTAACCGCGCTTTATTGCTGGCGGCATTAGCACACGGCAAAACAGTATTAACCAATCTGCTGGATAGCGATGACGTGCGCCATATGCTGAATGCATTAACAGCGTTAGGGGTAAGCTATACGCTTTCAGCCGATCGTACGCGTTGCGAAATTATCGGTAACGGCGGTCCAATACACCCCGAAGGTGCCCTGGGGGTGTTCCTCGGGaaaccccgcacgg > 1:536592/1‑227 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |