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TACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACC > 1:655374/1‑239 ATTGTAGATCCAAGCAAATTTCGGCCTAACGCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACG < 2:1788576/239‑1 ATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCAC > 1:1076053/1‑238 TAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGG > 2:1504190/1‑238 TAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGG > 1:797056/1‑238 TAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGC > 1:72796/1‑153 AGATACGCGCAAATATCTGCCTAACTCCCGTGCAGCCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGAC < 2:146896/239‑1 AGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGAC < 1:775130/239‑1 AGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGA > 2:777803/1‑238 TACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCAC < 2:158089/239‑1 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ACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACCCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGCAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCAC > 2:1121056/1‑238 CAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGA > 1:375829/1‑239 CAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGA > 1:323493/1‑239 CAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGCCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAACTCTCAATGATCATGCCGATGGTCGCCAGTTCCTGTTTGGTGTCGCTACGGCAGGCAACGCCCAGCCCGTCCACCTTCCCGTTGGCGAGAACGACCGTGATATCACGTCACCACCCACTCCGACCATAAGCAACCACGACGACCACCAGCca > 2:1626197/1‑237 AAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGA < 2:912301/238‑1 GGCCTAACCCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGGTAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGG < 2:810645/239‑1 AACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAG < 2:1076053/239‑1 CGTGCACGCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTC < 2:190238/239‑1 CGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGTACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAGCCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTC < 1:890710/239‑1 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CCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAAAGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCAATACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACTAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTAACCCC > 1:1731802/1‑239 GCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACC > 1:1721407/1‑239 CATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAAT > 2:226033/1‑238 CGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGT > 1:1579468/1‑238 GGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTC < 1:233762/239‑1 GGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTC < 1:1584707/239‑1 ACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGCCCACCAGCGACTATCCGGCGGGGTAGCCCTCCCCCCATACCGCGTCAACGATGCGTTCcg > 2:465001/1‑236 AGTTTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATT < 2:1344895/155‑1 TTACCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAG < 1:1539580/237‑1 CCCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCCGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCAAGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGGGATATCACGTAACAACCCACTACGCTCACTAGCTACCCCGCGGACCACCAGCGAACATCCGGCGGCGGAGCTGTCACCACCACCCGCGCCAACAATGCGTTCTGGCGCACGGACGCGCA > 2:271442/1‑238 CCAGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGG < 2:1331661/180‑1 CACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAG > 1:1095094/1‑181 CACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAG < 2:1095094/181‑1 AATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/2909891‑2910135‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccagcacTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCACGTAACAACCCACTACGATCATTAGCTACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCATACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCC > NC_007779/2910148‑2910382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |