New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_007779 | 3024216 = | 150 (0.890) | 9 (0.050) | 9/434 | NT | 5.7% | coding (1210/1401 nt) | xanQ | xanthine/proton symporter XanQ |
? | NC_007779 | = 3129996 | NA (NA) | intergenic (+146/+1) | Y75_RS15530/Y75_RS15535 | IS5‑like element IS5 family transposase/lipopolysaccharide biosynthesis protein |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATG‑ACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATT‑ATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCG > NC_007779/3023979‑3024451 | tgaaaaacgataaccaactggcgatgttattcacgctggccaacctgtttcgggcggaccaaatgatacgtcagtgggagagatctcactaaaaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttcct > 2:930438‑M1/239‑239 (MQ=255) 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aTTGTCGCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTTACATTGTTTTTTTTAAATATT‑ATCCTCCCTGGGGGCTACCCACAGGGAAAAGGTCTTCCTGGCATTAACTCACCGGAAGAAATGGAATAAAAATAAAAGAGTCAATGATGTCAGGAGAaaac > 1:1102109/1‑239 (MQ=255) cGCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATT‑ATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGtt < 1:1204210/239‑1 (MQ=255) gCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATT‑TTCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGAtt > 1:664785/1‑199 (MQ=255) gCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATT‑ATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGAtt < 2:664785/199‑1 (MQ=255) 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AATAATGGGGTTATTCAGATGACTGGCGTCGCTTCACGTTATGTCGGGCGAACCATCGCGGTAATGCTGGTTATCCTCGGCTTATTTCCGATGATTGGCGGCTTCTTCACGACCATTCCCTCGGCAGTTCTGGGAGGCGCAATG‑ACGTTGATGTTTTCCATGATTGCCATCGCAGGGATTCGCATCATCATCACCAACGGTTTAAAGCGCCGTGAAACACTTATTGTCGCCACTTCTTTA‑GGTTTAGGGCTTGGCGTCTCCTACGATCCCGAAATTTTTAAAATATTGCCAGCCTCTATTTATGTATTAGTTGAAAACCCTATTTGTGCTGGC‑GGGTTAACTGCGATTTTATTAAATATT‑ATCCTCCCTGGTGGCTACCGACAGGAAAACGTTCTGCCTGGTATTACCTCAGCGGAAGAGATGGATTAACAGTAAAGGAGTCAATGATGTCAGGAGAACACACGTTAAAAGCG > NC_007779/3023979‑3024451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |