| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_007779 | 3592355 = | 1 (0.010) | 147 (0.880) | 78/434 | NT | 99.3% | coding (128/1431 nt) | Y75_RS17825 | YdgA family protein |
| ? | NC_007779 | 3746911 = | NA (NA) | intergenic (‑3/‑32) | Y75_RS18580/Y75_RS18585 | tryptophan permease/IS5‑like element IS5 family transposase | |||||
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< 2:286797‑M1/1‑1 (MQ=255) aCTAAGTTCACTTTTGCCGCTGCCAGTGCTGGGATGACATTACCATGCATTAACATTGTGATGGGCAACGGACCGTGCTCCACATCCACATCAAATACAACTTTCTGGCATGGCTTGATCTTGAGATCGGGTGCACCGTTATCGAATGTCTATTGCATTTGAAAACGGGAAGTAACAAAGCCTTTGTCAAACTGTTGATAACTTAACGCCAGATCGTAGGCATGTTCACTTTTCttttt > 2:1677542/1‑239 (MQ=255) cggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTa < 1:789905‑M1/3‑1 (MQ=255) ggataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcct > 2:407495‑M1/236‑236 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |