| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 4056221 = | NA (NA) | 181 (1.080) | 97/432 | NT | 97.3% | intergenic (‑210/+14) | Y75_RS25055/Y75_RS20055 | hypothetical protein/IS1‑like element IS1A family transposase |
| ? | NC_007779 | 4370787 = | 5 (0.030) | pseudogene (667/1304 nt) | Y75_RS21600 | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter | |||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
AGTGTAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATG‑ACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/4055984‑4056454 | tgtAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTaa > 2:1333148/1‑239 (MQ=255) 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gtAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTa < 2:1692877/237‑1 (MQ=255) tAGTTCCGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATg > 2:1173449/1‑239 (MQ=255) ccGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATG‑ACTcc < 1:522676/239‑1 (MQ=255) ccGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATG‑ACTcc < 1:146243/239‑1 (MQ=255) cGTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATCTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATG‑ACTCCa > 2:365917/1‑239 (MQ=255) gTTGTAAGTTTTTCCATAGCTTGCACTGCTAAATTTCGAACAAGGAATTTTCTGCTGGTAATCTCTAAAAAGATGGCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAAGTTACTTTTAATGTCGGTAATG‑ACTCCaa < 1:372427/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |