Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 160,542 | T→C | 100% | E21E (GAA→GAG) | Y75_RS00735 ← | RNA polymerase‑binding protein DksA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 160,542 | 0 | T | C | 100.0% | 857.9 / ‑6.7 | 242 | E21E (GAA→GAG) | Y75_RS00735 | RNA polymerase‑binding protein DksA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (115/126); minor base G (0/1); total (115/127) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
ATCTTTTTGATCAGCTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGTTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGCAATTATCTAAACGTAACACTTGACAACTGTGTGAGGAAAAGCGTATTTGCGCACGCGACCAGAATGTAAATTAACCAGTTACT > NC_007779/160309‑160774 | aTCTTTTTGATCAGCTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCa > 2:1282980/1‑238 (MQ=255) cAGCTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATgg < 1:565657/239‑1 (MQ=255) cAGCTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATgg < 2:1456099/239‑1 (MQ=255) gCTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGATGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGAt > 2:542287/1‑235 (MQ=255) cTTACGCTCGCGATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCga > 2:1901075/1‑239 (MQ=255) tagtctcggcaTCGCGGTGACGCAGTTCGCGGCTGTGCTCTTCTTCCGCGGCTACGCGGCGTACGTGGTGCGCGAAGGTGGCTGGTGCATCCTGCGTGTGTGTGACAGTGCGATGGACTTCATCCCTGAGGTGATTACGTCATGCTTCCAGAATACTACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCGTTCATGTACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACATCAGCGATGGCggga < 2:1395437/229‑1 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTc > 2:1766020/1‑212 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTc < 1:1766020/212‑1 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCCCCCCATCGATGGCGCGAATAccccg > 2:1114492/1‑235 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAg > 1:867414/1‑239 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAg > 1:1509510/1‑239 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAg > 1:156717/1‑239 (MQ=255) cgATCGCGGTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCCTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAg > 2:375270/1‑239 (MQ=255) gcgGTTACGCAGGTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCTCCCCAGCGATGGCGAGAGTACTCAGGGACg < 2:699420/239‑1 (MQ=255) ggTTACGCAGTTCGAGGCTGAACTCTTCTTCCTGGGCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGa < 2:945636/238‑1 (MQ=255) 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gggCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCt > 2:526997/1‑238 (MQ=255) gCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTtc > 2:1275157/1‑238 (MQ=255) gCTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTtc > 2:958770/1‑238 (MQ=255) cTGCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATCCTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTtct < 2:867414/238‑1 (MQ=255) gCACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCt > 1:1553168/1‑239 (MQ=255) cACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCtt > 1:630237/1‑239 (MQ=255) cACGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCtt > 1:1099524/1‑239 (MQ=255) aCGGTCTACCGGGTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTa > 2:1075633/1‑239 (MQ=255) gTCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATc > 1:281582/1‑239 (MQ=255) tCCGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATc < 1:685469/238‑1 (MQ=255) ccGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGa > 1:1045370/1‑239 (MQ=255) ccGGGAAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGa > 1:360061/1‑239 (MQ=255) cagggCAGTTGGCTGCTTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCATCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCAGTCAGATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGACTACTCATGCACGATGTTTGACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATc > 2:1497193/3‑237 (MQ=255) gctTCATCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCggg < 2:503677/239‑1 (MQ=255) ttaaTCCTGCATATGTGTAACGGTGCGATCGACTTCAACCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCGCCCCAGCGGTGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCggggg < 1:607936/236‑1 (MQ=255) gCATATGTGTAACGGTGCTATCTACTTCAACCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATTGCGAGAATACTCAGGGACGATGGTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGa < 2:1759135/239‑1 (MQ=255) atgtgtgTAACGGTGCGATCGACTTCATGCCTGAGTTGATTACGCCATGGTTCCAGAATACGGCGGAAGTGCGGCAGCTGGGCGTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAgg < 2:754911/236‑1 (MQ=255) atatGTGTAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAgg < 2:281582/239‑1 (MQ=255) tgtgGAACGGTGCGAGCGGATTCATCCCTCAGTTTATTAGTCCAGGCTTCCAGAAAAGGACGGGAGGGCGCCAGCTGGGCTTGATTGCTGTACTCTTCGCTCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCGCCCCAGCGATGGAGAGAATACTCATGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTAGCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCg < 2:1647480/239‑1 (MQ=255) tAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCtat > 1:219595/1‑239 (MQ=255) tAACGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCtat > 1:691481/1‑239 (MQ=255) aCGGTGCGATCGACTTCATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGGTTTGCCCTTCTTGCATGTTGc > 1:1706374/1‑181 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tCATCCCTGAATTGATTACCCCATTCTTCCAGAATACGCCGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCtttt < 2:28644/239‑1 (MQ=255) cATCCCTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTc < 1:203602/239‑1 (MQ=255) cccTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCgg > 1:840841/1‑239 (MQ=255) cccTGAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCgg > 1:315064/1‑239 (MQ=255) gAGTTGATTATGCCATTCTTCAAGAATACGACGGTAGTGCACCAGCTGCAGTTTGTTCATATACTCATCGCCCGGCTTCTACTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAACACTCAGGGACGAGGCTTTACGGTTGTGGCCTTCATGAATGTTGCCTCTCCTGAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGTGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGTGTTTGCGTATAg > 2:677192/1‑239 (MQ=255) gAGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGtt > 1:1018721/1‑191 (MQ=255) aGTTGATTACGCCATGCTTCCAGAATACGACGGAAGTGCGCCAGCTGGGCTTCATTCATATACTCTTCGCCCGGCTTCTCCTGATATGGCTCCACCCCAGCGATGGCGAGAATACTCAGGGACGATGTTTTACGGTTTTGCCCTTCTTGCATGTTGCTTCTCCTTAACACGCACTATCGATCCCCATGTTCGGGGGAAAAATGAGGCCGCTATAAATAGCAGATGCTTTTCCGGATAGc > 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |