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ttGTCGCGTCCTACCTCGGTCTGCTGATTATGTTTGCAGTGCATGGCATTCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGtgctgc > 1:557485/1‑142 (MQ=255) ttGTCGCGGCATACCTCGGTCTGCTGATTATGATTGCAGTGCATGGCATTCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTACGATGAAGTACTTCCGTTAGGGAT‑GGCCTGGAACGACCTTTGGCCTTACTATCCGTTCCAGCGGTGGGTCTCTCCCAATGAATGTGGAAGCACAAAAGCGTGGGCTGGGCGTTCCATACTCAATAGCCAGGTTCGCCGGCTCTTTCGGTTCAAACCTTGGCCAg > 2:1163231/1‑239 (MQ=255) tGTCGCGTCCTACCTCGGTCTGCTGATTATGTTTGCAGTGCATGGCATTCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAg < 1:747856/238‑1 (MQ=255) gcgTCCTCCCTCGGTCTGCTGATTATGTTTGCAGTGCATGGCATTCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGGCGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACgg < 1:1198705/239‑1 (MQ=255) 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tCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑gggggggggtgcg > 1:1766183/1‑227 (MQ=255) tCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGAACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGCATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGGTTGTATCCGGCAAAGCTGGC‑gggtaggggtcgg > 2:679190/1‑227 (MQ=255) tgctgGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTGCTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGACTGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTTGGCGCTCCTGAATCCATCGCCAGTTTTGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGACAGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCCATGCTGGC‑GGTGAA‑GGGTgtg > 1:105453/1‑234 (MQ=255) 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cATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTTGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCCATGCTGGC‑GGGGCG‑GGTTGGTCCTCCGGGTg > 2:1143724/1‑239 (MQ=255) aTTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGTGAT‑GGt < 1:1538033/224‑1 (MQ=255) aGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAACCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGGTTCGCCGCCTCTTTTGGTGCAACCCTTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGCTTGTATCCCGCAACTCTGGC‑GGGGGTGGGTTGGCCCCCCGGTTGGTCTTAAccca > 2:1598784/1‑237 (MQ=255) 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tCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGTGGT‑GGTTGCGCCCACGGTTGGCATTAACCCGCCGGACCCGATGGGGGtt > 1:430249/1‑239 (MQ=255) ccGTAAGGTAT‑GGCCTGTACTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGGGAT‑GGTTGGGCCTACGGGTGGCATTAACCCGCTGGGCCCGATGGGGGTTg > 1:114668/1‑239 (MQ=255) aGGTAT‑GGCCTGTACAGACGTTTCCCTTTTCCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGTGAT‑GGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACg < 1:1557171/239‑1 (MQ=255) 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tgtaCTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGTGAT‑GGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:490722/239‑1 (MQ=255) | TACAAAGCTGGGTGATGAAACTGGTTCGCCTGGTCATGCAGTTGACCCCTTACGGCGTTCTGGCTCTAATG‑ACCAAAGTGGTTGCAGGTTCTAACTTGCAAGACATCATCAAACTGGGAAGTTTCGTTGTCGCGTCCTACCTCGGTCTGCTGATTATGTTTGCAGTGCATGGCATTCTGCTGGGCATTAATGGCGTGAGTCCGCTGAAGTACTTCCGTAAGGTAT‑GGCCTGTGCTGACGTTTGCCTTTACCAGCCGTTCCAGTGCTGCGTCTATCCCACTGAATGTGGAAGCACAAACGCGTCGTCTGGGCGTTCCTGAATCCATCGCCAGTTTCGCCGCCTCTTTCGGTGCAACCATTGGTCAGAACGGCTG‑CGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGC‑GGTGAT‑GGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTA > NC_007779/1813312‑1813779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |