Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,878,196 | A→T | 11.6% | L270F (TTA→TTT) | nimT → | 2‑nitroimidazole transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,878,196 | 0 | A | T | 11.6% | 361.8 / 9.3 | 122 | L270F (TTA→TTT) | nimT | 2‑nitroimidazole transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/78); new base T (13/2); total (41/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AACAACATGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCA > NC_007779/1877958‑1878430 | aacaacATGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTa < 1:1285184/239‑1 (MQ=255) caacaTGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTAca < 1:1695669/239‑1 (MQ=255) aacaTGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTAcat < 1:114199/239‑1 (MQ=255) aacaGGCAAATTTGAGTTCCTCGGGCGCCTTCCATACCCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGGGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTAcat < 2:1195455/239‑1 (MQ=255) caTGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTAcatca < 1:1908689/239‑1 (MQ=255) tGCAAATTTGAGTCCCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑tg < 2:1196936/239‑1 (MQ=255) gCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTTACTGCCTGGGTTGCTGCAACTAGCCACAACAGCACCCGGGTTGGTGATCCCCCTTTTTTTTCATCC‑tgt > 1:1150845/1‑239 (MQ=255) aaaTTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGa < 1:914154/239‑1 (MQ=255) aaaTTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGa < 1:16255/239‑1 (MQ=255) aaaTTTGAGTACCTCCCGCGCCTTCCATACTCTGGGTATCTTGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGCCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTCCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑tgtg < 2:1272645/238‑1 (MQ=255) atgtGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGaaa < 1:422640/236‑1 (MQ=255) tGAGTACCTCTCGGGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTGCCCCGCTTGCCTGGCGGGTCACATTGTTTCTTTGGATCAACTCACTGGTCTATGACGTGATTATCGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACAGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGAt < 2:711101/239‑1 (MQ=255) tGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGAt < 1:945724/239‑1 (MQ=255) tGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGCCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGAt < 1:880403/239‑1 (MQ=255) aCCTCGCGCGGCTTACATACTCGGGGTATCTGGCTTTCACCGCTTGCCTTGCAGGTCACATTGTTTGTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGTTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCg < 2:905923/239‑1 (MQ=255) aCCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCCCATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCg < 1:1216645/239‑1 (MQ=255) aCCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCg < 1:1748152/239‑1 (MQ=255) aCCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCg < 2:1557906/239‑1 (MQ=255) aCCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCg < 2:73846/239‑1 (MQ=255) gccctcccccTTACCTACGCGGGGTGTCGTGCTGTCACCGCTTCCCTGGCAGGTCACATTGCTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTCTTGGCTTGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTGTAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCATCTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTg < 2:226821/231‑1 (MQ=255) cgcgcgCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCCGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCAATACACGGGTTTCTGCCACCAGCCCCAACAGCACCCCGGTAGGTGGTCCCCCTTTTCTTTAATCA‑TGTTAAAAAtaaccgctgt > 2:1543565/1‑230 (MQ=255) cgcgcgCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTTACTGCCTTGGTTGCTGCAACTAGCCACCACCACACCCGGTTTTCTGGTCCCCCTTTTTTTTCATCATTGTG‑AAGAACAGCGGGGt > 1:831447/1‑239 (MQ=255) gcgcCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTAtt < 1:1222521/239‑1 (MQ=255) tACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGcgttcg < 1:461013/239‑1 (MQ=255) tACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGcgttcg < 1:1338170/239‑1 (MQ=255) gggTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCCCTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACCACAGCCACCGCGTTGCTGCGCCCACTTTTCTTTCATCC‑TGTGAAAGAGCAGCGTGGTTTTTCAGCGTGTGTTGCCt > 2:1449737/1‑239 (MQ=255) gggTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCCCACCATAGTTTGCTAACCCTCGCCACCCCAGCACCCCGCTTTCTGATCCCCCTTTTTTTTCACCC‑TATGCAAGAACCCCGTGGTCTTTTCGCGCTCGTTGc > 1:1512826/1‑237 (MQ=255) aTCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTTGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAATATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGa < 1:1093338/238‑1 (MQ=255) cACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCACTGCCTGGGTTTCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCCGGTTGGTGGTCCCACTTTTTTTTCATCA‑TGTGAAAGATCAGCGGGGGATTTCAGCGTTCGTTTCCTTGATGTGC‑GCAggg > 1:682200/1‑237 (MQ=255) ccGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTggg < 2:804542/239‑1 (MQ=255) gCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGgcg < 1:1449737/239‑1 (MQ=255) gCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGgcg < 1:816768/239‑1 (MQ=255) gCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCgg < 1:647084/238‑1 (MQ=255) cTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTTCTGCAACTAGCCACAGCAGCCCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAAATCAGCGTGGGATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGT‑GCAGTGGGGGCGGTTg > 1:538678/1‑239 (MQ=255) cTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCGATAGCGAAGCACAGGCGTGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTTGTTGCCTTGATGTGA‑GCAGTGGGCGCGGtt < 1:1134089/238‑1 (MQ=255) aGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGTTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGct < 1:1098800/238‑1 (MQ=255) tCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGctc < 1:391258/236‑1 (MQ=255) tCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCCCTTCCTTGGTTTTTGCCACTAACCACAGCCGCACCCGGGTTGCTGTTCCCCCTTTTTTTTCATCA‑TGTGAAAAATCAGCGTGGTATTGCCGCGTTCGTTGCCTTTTTTTGG‑GCAGTGGGGGGGGGTGGGcgttg > 2:647084/1‑234 (MQ=255) ccacaTTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCGCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGctc < 1:1176193/235‑1 (MQ=255) ccacaTTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGctc < 1:1836045/235‑1 (MQ=255) acaTTGTTTCTTGGGATCAACTCCCTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCCCAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCCCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCt < 1:1757045/238‑1 (MQ=255) ttCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCACTGCATGGGTTTCTGCAACTAGCCAAAGCAGCACCCCGGTTGCTTGTCCCACTTTTTTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGGGGGATTTCAGCGTTCGTTTCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGGTGGGCCCTGCTTTATGCCa > 1:1861340/1‑239 (MQ=255) gggATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCACTGCATGGTTTTCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTTCTGATCCCACTTTTCTTTCATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGGATTTCAGCGTTCGTTGCCTTTATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGGTGGGGTCTGCTTTATGCCAgcgc > 1:1291619/1‑238 (MQ=255) gATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCtt < 1:186661/192‑1 (MQ=255) aTCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCGCAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCAcg < 2:1716485/238‑1 (MQ=255) tCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCAcgcg < 1:1164731/239‑1 (MQ=255) gcgaCTCACTGGTCTATATCGGTATTATGGGCGGGCTTCCTGCGGTCCTCGTCGGTCGCTGCTATATCGAAACACAGGCGAGTGCACTGCAGGGTTTGCTGCAACTAGCCACATCAGCTCCCGTGTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTTAGAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGGTGTGC‑GCAGTGGGCTCTCTTGGGCTTTGCTTTATGTTAgcgcgctcg < 2:1671173/236‑6 (MQ=255) cTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGc < 1:492238/171‑1 (MQ=255) gTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCAcgcg < 1:904027/228‑1 (MQ=255) tCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGGTTTCTGATCCCACTTTTCTTACATCC‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTTATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATTCCAGCGCACGCGATCACCTGGAc > 1:813041/1‑238 (MQ=255) cttACGGGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGCTCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCGCAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTg < 2:22529/238‑1 (MQ=255) cGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCACTGCATGGTTTTCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGGTTGCTGGTCCCACTTTTTTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGGGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCCGGACTCTGCttt > 1:1297447/1‑239 (MQ=255) gTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCtttt < 1:1734697/239‑1 (MQ=255) gATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTc < 1:1917492/238‑1 (MQ=255) gATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTc < 1:1357513/238‑1 (MQ=255) attGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCACTGCATGGTTTGCTTCAACCAACCACAGCAGCACCCCGGTTGCTGGTTCCACTTTTTTTTCATTA‑TGTTAAAGATCAGCGGGGGATTGCAGCGGTCGTTTCCCTTTTGTGG‑GGCGGGGGCGCGGGTGGGGTCTGCTTTTTGCGCGCGCACGCGGTCCCCTGGGCTCTGCTTTTCGGtgt > 2:444645/1‑237 (MQ=255) gctggctTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGGTTGCTGCCACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGAGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGt > 1:1552960/1‑239 (MQ=255) tggctTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCCACTAGCCACAGCCGCACCCCGTTTGCTGATCCCACTTTTTTTTCATCC‑TGTGAAAGATCAGCGTGGGATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGGTGTGC‑GCCGTGGGCGCGGGTGGGGTCTGCTTTTTGCCCGCGCACGCGCTCACCCGGGCTCTGCTTTttggttttggtt > 1:1684345/1‑238 (MQ=255) tgcaggCGGTTCTCATCAGTCACTGCTATAGCGAAGGACAGGCGGGTTCACTGCCTGATTTGCTGCAACTAGCGACAGCGACCCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGTTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCCGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCgg < 2:1785464/234‑1 (MQ=255) ccGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGgcgc < 1:1543565/239‑1 (MQ=255) ggCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGcaa < 2:297661/239‑1 (MQ=255) ggCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGcaa < 2:848088/239‑1 (MQ=255) aTCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCCTCGTTTTCTGCAACTAGCCCCAGCAGCACCCCGGTTGCTTTTCCCAATTTTTTTATATCA‑TGTGAAAAATCAAAGTGGGATTGCAGCGTTCGTTGTCTTTATGTGCGGCAG‑GGGGGCGGGTGGGGTCTGCTTTTTGCCCGCCGACCCGCCCCACCGGCCTGCGCTTTTCGGGTTTTGTTCCGGCGCACCAAt > 2:244894/1‑239 (MQ=255) aTCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTTTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGGTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCCGCGCAACAAt > 1:1275540/1‑239 (MQ=255) tCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAAt < 1:244894/238‑1 (MQ=255) ccTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCCGGTTTCTGATCCCACCTTTTTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGGTCGTTGCCTTTATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGGTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGGTCACCTGGGCTCTGCTTTTCGGGTTTTGTTCCGTCGCAACAATgg > 1:1893806/1‑238 (MQ=255) tCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGGTCAACGCATGGGTTTCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGGTTGCTGATCCCACCTTTCTTTCATCC‑TGTGAAAGATCAGCGTGGGATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTTGTTCCGGCGCAACCATGATACTGGGGt > 1:1024566/1‑239 (MQ=255) aCGGATATAGCGAAGCACGGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTg < 2:1273883/239‑1 (MQ=255) ggCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCTCCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGAc < 1:1176975/239‑1 (MQ=255) aGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCAt < 1:1109918/239‑1 (MQ=255) acaGGTGGGTTCCCGGGATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCGGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTTGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGCCTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTg < 2:1269649/238‑1 (MQ=255) acaGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTg < 1:1706965/238‑1 (MQ=255) caGGCGGGTTCACTGCATGGGTTGCTGCAACTAGCCACAGCAACACCCGGGTTGCTGATCCCCCTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGGGGGATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGGTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCg > 1:782207/1‑239 (MQ=255) cGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCg < 1:647076/235‑1 (MQ=255) cGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGc < 2:13138/238‑1 (MQ=255) tCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTc < 1:1839337/239‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCt < 1:187429/239‑1 (MQ=255) cACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTGTGCTGATCCCGCTTTTCTGACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGGGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCt < 2:1512826/239‑1 (MQ=255) aCTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTc < 2:472972/224‑1 (MQ=255) cATGGTTTGCTGCAACGAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATGGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCa > 2:1025555/1‑239 (MQ=255) tGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATc > 1:804925/1‑239 (MQ=255) gctgcAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAggcg > 1:652105/1‑238 (MQ=255) gcAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCGCTTTTCTTACAGCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGGTTTGCAGCGTTCGTTGCCGTGATGTGC‑GCCGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAggcggcgg < 2:1554052/239‑1 (MQ=255) gcAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAggcggcgg < 1:1709683/239‑1 (MQ=255) aaCTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCa < 2:1150845/239‑1 (MQ=255) cagcagCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCgggg < 2:1684345/239‑1 (MQ=255) agcaCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGa < 1:1145961/236‑1 (MQ=255) caCCCGGTTTGCTGATCCTACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGc > 2:507098/1‑238 (MQ=255) caCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGc > 1:1009168/1‑238 (MQ=255) caCCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGc > 2:1397125/1‑238 (MQ=255) ccGATTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCATTCGTTGCCTTGCTGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACaa < 2:61211/239‑1 (MQ=255) ggTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAAt > 2:1499267/1‑238 (MQ=255) ttGCTGCTCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGt < 1:861693/239‑1 (MQ=255) tGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTc < 2:1861340/239‑1 (MQ=255) tCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTAt > 1:567360/1‑239 (MQ=255) tCCCACTTTGCTTTCATCA‑TGTGAAAGATCGGCGTGGTATTGCAGCGGTCGTTGCCTTGGTGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTGTATGCCAGCGCACGCGATCGCCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTa < 2:1802350/238‑1 (MQ=255) cccACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCAcgcg > 1:581106/1‑106 (MQ=255) cccACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTAtt > 2:772298/1‑239 (MQ=255) ttCTTTCAGCA‑TGGGAAAGATCGGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGc < 2:36773/239‑1 (MQ=255) tCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCa > 2:1944232/1‑239 (MQ=255) | AACAACATGCAAATTTGAGTACCTCGCGCGCCTTACATACTCGGGGTATCTGGCGTTCACCGCTTGCCTGGCAGGTCACATTGTTTCTTGGGATCAACTCACTGGTCTATTACGTGATTATTGGCTGGCTTCCGGCGATCCTCATCAGTCACGGCTATAGCGAAGCACAGGCGGGTTCACTGCATGGTTTGCTGCAACTAGCCACAGCAGCACCCGGTTTGCTGATCCCACTTTTCTTACATCA‑TGTGAAAGATCAGCGTGGTATTGCAGCGTTCGTTGCCTTGATGTGC‑GCAGTGGGCGCGGTTGGGCTCTGCTTTATGCCAGCGCACGCGATCACCTGGACTCTGCTTTTCGGTTTTGGTTCCGGCGCAACAATGATACTGGGGTTGACGTTCATTGGTCTGCGGGCTAGTTCTGCGCATCAGGCGGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCA > NC_007779/1877958‑1878430 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |