| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 267,754 | T→C | 100% | Y144C (TAC→TGC) | Y75_RS01295 ← | GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 267,754 | 0 | T | C | 100.0% | 722.4 / ‑6.7 | 211 | Y144C (TAC→TGC) | Y75_RS01295 | GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (109/100); minor base G (1/1); total (110/101) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
ACCGGGCTGGTGGCCTCACGTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTCGCGGTACAGCGCAGCATACTCGGTATCGCGAGCGCCACTTTCGCCCACGCCGGGCAGATCCATCAGCGTTATATAGCGGTCGCCGACTTGCAGGCGAAAGCGCAGTGGCTCACGTGTACAGGCCGCCACATC > NC_007779/267520‑267989 | cGGGCTGGTGGCCTCACTTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGCCGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACct < 2:1288332/239‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGCCTCACGTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACctc > 1:867298/1‑238 (MQ=255) cTCACGTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCt < 1:1914320/239‑1 (MQ=255) aCGTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCGCCtgat < 1:211442/239‑1 (MQ=255) tcatcCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATcc < 2:1334679/239‑1 (MQ=255) aCCTGAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACATCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTc < 1:1193840/239‑1 (MQ=255) cTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCAt < 1:891902/239‑1 (MQ=255) aaGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCCCTCCAATCACCTGATTATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATcc > 2:638790/1‑237 (MQ=255) ccccATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCt < 1:509088/238‑1 (MQ=255) ccATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCCTACCTCCCCAATCCCCTGATGATAAAAATGTTCATCCCCCGTCAGCGCCCTGTctcttaacca > 2:506815/1‑228 (MQ=25) ccACTGTAGCCGGACCGACACAGCACACCCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACACCTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCTCCGTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTaa < 2:1000792/239‑1 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATc < 2:1677129/230‑1 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATc > 1:1677129/1‑230 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTaa > 1:1071781/1‑238 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTaa > 2:1213073/1‑238 (MQ=255) cATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAAt > 2:215728/1‑239 (MQ=255) ttGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGc < 1:829641/231‑1 (MQ=255) aGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCca < 1:1707069/239‑1 (MQ=255) aGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGACGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCca < 1:1243963/239‑1 (MQ=255) gACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCca < 2:867298/238‑1 (MQ=255) cGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCGCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCcac < 1:391923/237‑1 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCCCCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa > 2:725206/1‑238 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa > 2:246812/1‑238 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa < 1:1432908/238‑1 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa > 1:924006/1‑238 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa > 1:655041/1‑238 (MQ=255) aCCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTa > 1:1862888/1‑238 (MQ=255) gccacaGCCCACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGTTATTCTGGTTCTGCGACGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGATCGGCCTTACTCGACTGGCTGATAACAAACAACCCCTTATGCCGGCATACCTCTCCCATCGCCTGACGATAAAAATGTTCAACCCACGTCAGGCCCCCGTCATCCGCCCTAAt > 2:1518875/3‑224 (MQ=21) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgag > 1:854025/1‑238 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgag > 1:706158/1‑238 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgag > 1:435688/1‑238 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTCATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgag > 1:494828/1‑238 (MQ=255) cacacaCCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGACATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGACAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgag > 1:538868/1‑238 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATaaa > 1:1405404/1‑172 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATaaa < 2:1405404/172‑1 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgaggcgagg > 1:1017693/1‑239 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgaggcgagg > 2:1779426/1‑239 (MQ=255) acCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTcgaggcgagg > 1:1867461/1‑239 (MQ=255) ccGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGa > 1:161842/1‑239 (MQ=255) gaaggACGGGCTGGAACAGCCCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCGTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGGAGGCTCGGCCTTAGCCGACGGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCACCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACACGGTccaggcgaggga > 2:559443/4‑235 (MQ=25) aTGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCAACCGGACCAAGTCCAGGCGAGGaa > 2:768536/1‑236 (MQ=255) 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cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTcg < 1:235446/239‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTcg < 1:246812/239‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTcg < 1:1481505/239‑1 (MQ=255) cGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTc > 1:1059166/1‑238 (MQ=255) tGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTCGCGGTa < 1:1307308/239‑1 (MQ=255) aaCAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGCATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTCGCGGTACAg < 2:1017693/239‑1 (MQ=255) 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ACCGGGCTGGTGGCCTCACGTGGCAGGCACTTAATCATCCGCTCGGCCATCACCTTAAGCCCCCATTGTAGACGGACCGACACAGCACACACCGGATGGACGGGCTGGAACAGCTCATGCAGCAGGCAGATTTTGCGGCTGATATTCTGCTTCTGCGCCGTGGACAACTGTCCCCCACCGCTGGTAGGTTCGGCCTTATCCGACTGGCTGATAACAAACAGCACCTTATGCCGGTATACCTCTCCAATCACCTGATGATAAAAATGTTCATCCACCGTCAGCGCCCGGTCATCGGCCTTAATCAGCCACAGTACCAGGTCGAGGCGAGGAAGCTGTTCGCGGTACAGCGCAGCATACTCGGTATCGCGAGCGCCACTTTCGCCCACGCCGGGCAGATCCATCAGCGTTATATAGCGGTCGCCGACTTGCAGGCGAAAGCGCAGTGGCTCACGTGTACAGGCCGCCACATC > NC_007779/267520‑267989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |