| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,292,756 | 0 | T | C | 8.9% | 392.0 / 18.6 | 131 | L145L (TTA→TTG) | rsmI | 16S rRNA (cytidine(1402)‑2'‑O)‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (63/53); new base C (5/7); total (70/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCGACGGTTTTCATCTTCCTTTACCCACGCCAGCAGCTCGCCAACGGGCGCGCCGTGAATGGTTTCCCAGGTTTTGGTCAGCTCACGCGCCAGAACCACGTAGCGGGATTCGCCTAATACCGCAACGATATCTTCCAGGCTATCTAACAGACGGTGGGTAGATTCATAAAAAATCAGCGTGCGCGGCTCCGCTTCAATGGCTTTTAGCGCATCACGGCGGCCTTTTGATTTGGCAGGTAAAAAGCCTTCGTAACAGAAACGGTCAGAGGGTAAACCCGCTGCGCTTAACGCAGTGATAGCAGCACACGGCCCGGGTAGCGGCACCACGCGGATCCCCGCTTCACGGCAGGTACGCACCAGATGGTAGCCAGGATCGTTAATTAGCGGCGTTCCGG‑CATCGGAAACCA‑GCGCAATGTTTTGCCCCTCTTGCAGCTTCGCCAGCAGCGTTTCAGCTTTTTGTTGTTCGTTATG > NC_007779/3292519‑3292989 | gCGACGGTTTTCATCTTCCTTTACCCACGCCAGCAGCTCGCCAACGGGCGCGCCGTGAATGGTTTCCCAGGTTTTGGTCAGCTCACGCGCCAGAACCACGTAGCGGGATTCGCCTAATACCGCAACGATATCTTCCAGGCTATCTAACAGACGGTGGGTAGATTCATAAAAAATCAGCGTGCGCGGCTCCGCTTCAATGGCTTTTAGCGCATCACGGCGGCCTTTTGATTTGGCAGGTa > 2:71653/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |