Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 392,802 | 0 | A | G | 6.9% | 637.4 / 26.2 | 202 | pseudogene (603/1443 nt) | Y75_RS01915 | autotransporter outer membrane beta‑barrel domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (74/112); new base G (4/10); total (79/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.08e-01 |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CAACGCAACTGGCGCTGGCGCTATCGCTGATTACAAAGATAAAGAAATTATCTACGTAAACGACGTCAACAGCAACGCGACCTTCTCTGCTGCTAACAAAGCTGACCTGGGTGCATACACCTATCAGGCTGAACAGCGCGGTAACACCGTTGTTCTGCAACAGATGGAGCTGACCGACTACGCTAACATGGCGCTGAGCATCCCGTCTGCGAACACCAATATCTGGAACCTGGAACAAGACACCGTTGGTACTCGTCTGACCAACTCTCGTCATGGCCTGGCTGATAACGGCGGCGCATGGGTAAGCTACTTCGGTGGTAACTTCAACGGCGACAACGGCACCATCAACTATGATCAGGATGTTAACGGCATCATGGTCGGTGTTGATACCAAAATTGACGGTAACAACGCTAAGTGGATCGTCGGTGCGGCTGCAGGCTTCGCTAAAGGTGACATGAATGACCGTTCTGG > NC_007779/392568‑393038 | cAACGCAACTGGCGCTGGCGCTATCGCTGATTACAAAGATAAAGAAATTATCTACGTAAACGACGTCAACAGCAACGCGACCTTCTCTGCTGCTAACAAAGCTGACCTGGGTGCATACACCTATCAGGCTGAACAGCGCGGTAACACCGTTGTTCTGCAACAGATGGAGCTGACCGACTACGCTAACATGGCGCTGAGCATCCCGTCTGCGAACACCAATATCTGGAACCTGGAACAAg > 1:365597/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |