Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 432,873 | T→G | 33.8% | G65G (GGT→GGG) | ribD → | bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase RibD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 432,873 | 0 | T | G | 33.8% | 103.2 / 25.7 | 109 | G65G (GGT→GGG) | ribD | bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase RibD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/52); new base G (31/6); total (49/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.90e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.15e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCGCA > NC_007779/432639‑433108 | aGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCGTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑Ga < 1:870957/239‑1 (MQ=255) aTTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GCAAAAACC‑AAATGGGC‑Gaac > 1:1614504/1‑236 (MQ=255) aTTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GAcc < 1:425699/238‑1 (MQ=255) aTTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GAcc < 1:34988/238‑1 (MQ=255) tttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTAGGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGc < 1:58402/239‑1 (MQ=255) tttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCg > 1:865566/1‑238 (MQ=255) tttGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAACC‑AAAGGGGC‑GACCg > 1:750084/1‑238 (MQ=255) tGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCTTTGCGTATGGCGGGG‑GGGAAAGCC‑AAAACGGC‑Ggccgcc > 2:838638/1‑238 (MQ=255) cgcgcgCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCg < 1:806758/239‑1 (MQ=255) cgcgcgCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCCCCTATGTCACACTCg > 1:252208/1‑239 (MQ=255) cgcgcgCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑CAAAGGGC‑GAACCCCCATGTCacacccc > 1:1724536/1‑236 (MQ=255) gcCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTCCACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AAcc < 1:1761563/238‑1 (MQ=255) gcCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AAcc < 1:106383/238‑1 (MQ=255) ccTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑CAAAGGGC‑GACCGCCCATGTCACACCCG‑AAccc > 1:349070/1‑238 (MQ=255) cTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCGGGCGCAACGAGGACGTTTTCCCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTg < 1:1868840/239‑1 (MQ=255) cTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCg < 1:444629/224‑1 (MQ=255) tgaGCGGTGCAGGCCGTGTATTAAATGGAGCGGGCGCTAAAGCGAGCCGAAGGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCGGAAGGTCGGGTGGGTCTTTGTAAAA‑GAGGGCGAAATTGGTGGTGAAGGTTACCCCCGA‑CGTGGGGGTGAACCACATGCCGAAGTACCCGTGTTGCGAATGGGGGGT‑GAAAACGCA‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCcatca < 2:93323/237‑1 (MQ=255) aaGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAACC‑AAAAGGGCGGACCCCCTTTGACAC‑CCCG‑CACCCCGTAGCcatcat > 1:625665/1‑239 (MQ=255) aaGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCGCCTCTTTCACACTCG‑AACCCCGTAGCcctcat > 1:1383544/1‑239 (MQ=255) gACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAAGGGG‑GACCGCCCATGTCACCCCCG‑AACCCTGTAGCCCTCATGGTCGTACGc > 1:543802/1‑238 (MQ=255) gACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCCCCCATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCCTCATGGTCGTACGc > 1:1292855/1‑238 (MQ=255) cGATTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑AAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCa < 2:738119/238‑1 (MQ=255) cGAGTATTACAGGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCTTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCa < 1:1020845/238‑1 (MQ=255) gTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGt > 1:1067218/1‑239 (MQ=255) gTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAGGTGC‑GACCGCCGATGTCACACTCG‑AAACCTGTAGCCATCACGGGCGTACGCCACCgg > 1:918448/1‑238 (MQ=255) tATTACATGGCGCGGGCGCAAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCAAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGTGGGGGTGAACCACATGCCGAAGTACCCGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATgg < 1:1841166/224‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCGCCTATTGCACACTCG‑AAACCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGAc > 1:538302/1‑238 (MQ=255) ggCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCGCCCATGTCACACTCC‑AACCCCGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGGGCCGTGAc > 1:1109581/1‑238 (MQ=255) gcgcGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGCCGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GGTGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGGGCGGGTGAACCACATGCCAAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACg < 1:379086/238‑1 (MQ=255) gcgcGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACg < 1:1655238/238‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCGA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCCGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGc > 1:729884/1‑238 (MQ=255) cgcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GGAAAAGCC‑CAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCCCCGTGCTGTGACGc > 1:544007/1‑238 (MQ=255) cgcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAGCC‑CAAAGTGG‑GACCGCCCTTTTCACAACCC‑AAACCCGTAGCCCTCAAGGTCGTACGCCCCCGGGCTGTGACGc > 1:1002239/1‑238 (MQ=255) cgcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAAGGGC‑GACCGCCCATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGc > 1:1658678/1‑238 (MQ=255) cgcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑CAAGGGGC‑GACCGCCCATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGCGCTGTGACGc > 1:1858547/1‑238 (MQ=255) gcgGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTCCACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCA‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCa < 1:477655/238‑1 (MQ=255) ggCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCC‑AACCCCGTAGCCATCATGGGCGTACGTCACCGGGCTGTGACGCAcc > 1:261660/1‑236 (MQ=255) cgcTAAAGCGGGCGCACCGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTGGGTGAAGGTTACCGCCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCAAAGTACCCGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCAt < 1:1747218/238‑1 (MQ=255) gctaaggtgggCGAAAGGGGGACTTTTTACCACGCACCCCACCCCGAATGTCGGGGGCGTCATTGTAAAA‑GAGGGCGAAATGGGCGGGGAAGGTTACCACCAG‑CGTGCGGGTAACCCACATGCCGAAGTCCCCGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATc < 2:543802/229‑1 (MQ=255) aaggcgggagcAACACGGAAGTTTCCCCGCGCATCACAACCGGAATGGCGGGGGGCTGAGTGGCAAG‑GTGGTGGAAGTTGACGATGAAGCTCACCGCGAG‑CGCGGGGGCGCACCAGCTGCCAAAGCACACGCTTTGGGTTTGGCGGGC‑GAGAAAGCC‑AAAGGTCC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑ATCCCTGTAGCCATCATGATCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATcggcg < 2:364644/230‑1 (MQ=255) aaaGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCCCGCACCCCACCCGGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTCCACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATcgccg < 1:1603147/239‑1 (MQ=255) gcgcAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GAACGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCCTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGt > 1:102904/1‑239 (MQ=255) gcgcAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAGGTGC‑GACCGCCCATGTCACCCTCG‑AACCCCGTAGCCATCATGGTCGGACGCCACCGGGCTGTGACGCCCTCATCGCCGCTGGCGt > 1:516011/1‑239 (MQ=255) gTTTTACCACGCATCCCACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTa < 1:565325/174‑1 (MQ=255) tgcctcgtctCCCAACCGGAATGTGGGGGGTTTCTTTGTAAAG‑TATGGCGAAATGTTGGGTGAAGTTTCCCCCCAA‑GGGGCGGTGGAACACCATGCGGATGTCCCCGCTTTGCGTATGGGGGGT‑AAAAAAGCA‑AAAGGTGC‑GTCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCt < 2:1300693/230‑1 (MQ=255) tACCCCGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTAGGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCt < 1:1472426/239‑1 (MQ=255) tACCACGCATCCCACCCCGAATGTCGGGGGCGTCATTGTAAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGGGCGGGTGACCCCCATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCt < 1:1921062/239‑1 (MQ=255) gccACGCACCCCAGCCGGAGTGTCGGAGGCGTAATTGTCAAA‑GGTGGCGAAATTGT‑GGGGGAGGGTACCCCCAACCGGGCGGGGAACCCAAATCCGGAAGTACCGGCGTTCGTTGTGGCGGGT‑AAAAAGGCC‑AAGGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTc < 2:252208/238‑1 (MQ=255) aCCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTc < 1:838638/239‑1 (MQ=255) ccACGCAGCCAACCCGGAAGGGCGGGTGCGT‑ATGTACAAAGGAGGGCAAAATTGTCGGTGAGGGTTCCCACCAA‑CGTGAGTGTGAACCCCATTCAGAACTCCCCGCGTGGCGTAGGGCGTGG‑AAAAACGCC‑AAAGGTGG‑CACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGGAGCG‑CGCGTGGTTGCCtgg < 2:782413/239‑3 (MQ=255) cGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGGAAAAACCC‑AAAGG‑GC‑GACCGCCCATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACCCATcgc > 1:1608288/1‑208 (MQ=255) gCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATTTCCCACTCG‑AACCCTGTAGCCATCCTGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCCCCGCCGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGc > 1:1885945/1‑239 (MQ=255) gatcacgaCCCGAATGTGGGGTGCGTCTGTGTGAAA‑GGGCGCGAATTTGTGGGTGAAGGTGACCACCAG‑CGGGCGGGTGAGCCAACTGCGCACGTACACGCTGGGGGTGGGGCGTGG‑GAAAAAGCA‑AAAGGTGA‑GGCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 2:872103/232‑1 (MQ=255) cATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCA‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 1:267394/239‑1 (MQ=255) cATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGAGAATTGGTGGGTGAAGGTACCCCCCAC‑CGTGCGGGTGAACCACATGCGGAAGTACACGCGTTGCGTAGGGCGGGT‑AAAAAAGCC‑AAGGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 2:1858547/239‑1 (MQ=255) accccACCCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTGGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 1:670794/236‑1 (MQ=255) aTCCCACCCCGAATGTGGGGTGCGTCATTGTAAAA‑GAGGGCGAAATGGTCGGTGAAGGTTCCCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 1:1766977/238‑1 (MQ=255) aTCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATGGTCAAA‑GATGGTGAAATTGTGGGTGAAGGTTACCCCCAA‑CGTGCGGGGGAACCCCATGCCGAAGTCCCCGCGTTGCGTATGGGGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCa < 1:973396/238‑1 (MQ=255) cAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAACC‑CAAGGAGG‑GACCCCCCAATTCACACCCGCACCCCTGT‑GCCATCCCGCTCGTACGCCACCCCGCCGTGAAGCACCCCTCCCCCCCGGCCTAGCGCCGCGGGGTTGCCCCgcgcgagat > 2:1274804/1‑230 (MQ=255) aTGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCCGGCGTAGCG‑CGCGGGGTTGCCTCGATGCAAGa > 1:989009/1‑229 (MQ=255) ggTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAACC‑AAAAGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCCCCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAAc > 1:1699391/1‑230 (MQ=255) cGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTCCCCCCAC‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCt < 1:166799/238‑1 (MQ=255) ttGTAAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATCCCGAAGTACACGCGTGGCGTAGGGGGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGt < 1:144984/239‑1 (MQ=255) ttGTAAAA‑GATGGCGAAATTGGCGGTGAAGGTTCCCGCCGA‑GGGGGGGGAGAACCACAGGCCGAAGTACGCGTGTTGCGTAGGGGGGGT‑GAAAAAGCC‑AAGGGGGC‑GCCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGt < 2:729884/239‑1 (MQ=255) tGTAAAA‑GATGGCGAAATGGTGGGTGAAGGTTCCCCCCAC‑CGTGGGGGTGAACCACATGCGGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTg < 1:1256268/239‑1 (MQ=255) ggCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAAGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCg > 1:830609/1‑239 (MQ=255) ggCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAAGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCCGGGGGTGGACCTTACCg > 1:1642342/1‑239 (MQ=255) cGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAGCC‑AAAAGGGC‑GCACGCCCATTTCACACCCG‑AACCCCGTAGCCATCATGGGCGTACGCCACCCTGCTGTGACGCACCCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGGGGGTGCCCCGATGCAAGATCCTAACCCCCAGGGCGCGGGGGGTGGGGTTTAccct > 2:1747373/1‑236 (MQ=255) ttGTCGGTGAAGGTTACCGCCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCcatca < 1:1498858/124‑1 (MQ=255) aggtggTGAGGGTTGCCACAAG‑GGGGGGGGTAAACCAGATGCAGTGGTACACGTGTGGCAGTGGGCGTG‑‑AAAAAAGCCAAAAGGCGC‑TCCCGCCTATGTCACACTCG‑ACCCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCaa < 2:1708769/234‑1 (MQ=255) gTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCAAATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGc < 1:1784333/238‑1 (MQ=255) aGGTTACCGCCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GGAAAAACC‑AAAGGGGC‑GACCGCCCATTTCACACCCG‑AACCCTGTAGCCATCCTGGTCGGACg > 2:1498858/1‑124 (MQ=255) gTTACCACCAC‑CGTGGGGGTGAACCACATGCCGAAGTACCCGCGTTGCGTAGGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCcatca < 1:1894335/112‑1 (MQ=255) ttACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCTTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTa < 1:1166772/188‑1 (MQ=255) ttACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAGGCGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTg > 1:423721/1‑239 (MQ=255) ccaccaA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCCCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACg > 1:461056/1‑239 (MQ=255) cGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGcc > 1:390646/1‑238 (MQ=255) cGTGCGGGTGAACAACAGGCCGAAGTACACGCGTTGCGTAGGGGGGGT‑GAAAAAGCC‑AAGGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCa < 1:1102286/239‑1 (MQ=255) ggCGGGTGACCCACATGCCGAAGTACGCGCTTTGCGTATGGCGGGT‑AAAAAAGCC‑AAGGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCa < 1:364098/236‑1 (MQ=255) aaCCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCtgatg > 1:690042/1‑239 (MQ=255) acccgcgTGGCGTAGGGGGGGG‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGG‑GCCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAg < 1:719619/235‑1 (MQ=255) acacGCGTGGCGTGGGGGGGGT‑AAAAAACCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGGCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCT‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAg < 1:1391985/238‑1 (MQ=255) cgcgTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAGGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAAt < 1:1730058/239‑1 (MQ=255) cgcgTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAGCCC‑AAGGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTACCCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAAt < 1:1414704/239‑1 (MQ=255) cgcgTTGCGTAGGGCGGGT‑GAAAAAGCA‑AAGGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAAt < 1:1851891/239‑1 (MQ=255) gcgTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAAtt > 1:1946928/1‑239 (MQ=255) ttGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAACCGAGCAATTGaa > 1:1001937/1‑239 (MQ=255) ttGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGGGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGGCGCTGGGCGGGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGaa > 1:851022/1‑239 (MQ=255) gCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATa > 1:443369/1‑239 (MQ=255) gCGTATGGCGGGT‑AAAAAAGCA‑AAGGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATa < 1:1225053/239‑1 (MQ=255) cGTATGGCGGGT‑AAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GCCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATa < 1:1274804/238‑1 (MQ=255) gT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTtctc > 1:563662/1‑239 (MQ=255) gT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGGTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTtctc > 1:1451186/1‑239 (MQ=255) gT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCCCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGGTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTtctc > 1:1291765/1‑239 (MQ=255) ccc‑AAGGGCGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGAt < 2:568067/238‑1 (MQ=255) cc‑AAGGGTGC‑GCCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGa < 2:1764962/237‑1 (MQ=255) aagggTCC‑GCCCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCAGCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGCGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATgcg < 2:958595/236‑1 (MQ=255) aGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCaa > 2:1620504/1‑208 (MQ=255) aGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCaa < 1:1620504/208‑1 (MQ=255) aGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGAACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGCAGCG‑CGCGAGGTTGCCTCGATCCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGCGCGTGGACTTTACCGTCGGCAACAGGCTGGCATTGACGGCAGCCAAGGCCTGATGCTGAGTGAAGCAGAGCACTTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCGCa > 2:1568298/1‑239 (MQ=255) | AGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAACGAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAA‑GATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAA‑CGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGT‑GAAAAAGCC‑AAAGGTGC‑GACCGCCTATGTCACACTCG‑AACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGCGCA > NC_007779/432639‑433108 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |