| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 3,632,590 | A→T | 10.9% | I30F (ATT→TTT) | rarD → | EamA family transporter RarD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 3,632,590 | 0 | A | T | 10.9% | 418.2 / 6.1 | 142 | I30F (ATT→TTT) | rarD | EamA family transporter RarD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (108/14); new base T (2/15); total (111/31) | |||||||||||
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TTGCGTGCAGGCAATAAAGTCGCCGTCGCCCGCGTTGAATTACACAATGAAGAACAGCTTTATATTGCCAGTGCCACCGCCACCTATATGGTAGGTTGAAGACATAAAAGCAGGTAAACTGCTGTTACCAATTAAAAATGAGTATTCCCGATGGATGCAAAACAAA‑CGCGGCAGGGCGTATTACTCGCTCTTGCCGCTTATTTTATTTGGGGTA‑TAGCGCCAGCGTACTTCAAGTTGATTTACTACGTGCCCGCCGATGAAATCCTGACGCATCGCG‑TGATCTGGTCGTTTTTCTTTATGGTGGTGCTGATGAGCATTTGCCGCCAGTGGTCCTATTTAAAAACGCTGATTCAGACGCCACAGAAAATTTTTATGCTGGCAGTCTCTGCCGTGCTGATTGGTGGCAACTGGCTACTGTTTATCTGGGCGGTGAACAATCACCATATGCTGGAAGCGAGCCTTGGTTACTTTATTA > NC_007779/3632353‑3632827 | ttGCGTGCAGGCAATAAAGTCGCCGTCGCCCGCGTTGAATTACACAATGAAGAACAGCTTTATATTGCCAGTGCCACCGCCACCTATATGGTAGGTTGAAGACATAAAAGCAGGTAAACTGCTGTTACCAATTAAAAATGAGTATTCCCGATGGATGCAAAACAAA‑CGCGGCAGGGCGTATTACTCGCTCTTGCCGCTTATTTTATTTGGGGTA‑TAGCGCCAGCGTACTTCAAGTTGAt > 1:933283/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |