| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,858,449 | T→G | 17.0% | G199G (GGT→GGG) | cysE → | serine O‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,858,449 | 0 | T | G | 17.0% | 229.9 / 3.4 | 110 | G199G (GGT→GGG) | cysE | serine O‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/58); new base G (20/3); total (49/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.88e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGT > NC_007779/3858213‑3858677 | tgGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGGTTGAAAAAGACCGATCGATTTTGCAAGCTGTTTAGCTCGGCGGGAGGGGGAAATATGGTGGGGTGCCTCT‑CCC‑CCACATTCGTGGCGgtgt > 2:523863/1‑239 (MQ=255)tgGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTTAAAAAGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGgggt > 1:1910379/1‑239 (MQ=255)tgGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCAGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGgtgt < 2:312587/239‑1 (MQ=255) ggAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGgtgt < 1:811602/238‑1 (MQ=255) cAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGAGTAAATCTGGGGGTGACCGTCA‑CCC‑CAAAATTCGTGAAGGGGTgatgat > 1:1779296/1‑239 (MQ=255) aGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAAAGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGGGACCGTCA‑CCC‑GCAAATTCGGGAAGGGGTGATGAtt > 1:1620204/1‑239 (MQ=255) cGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAAACTGGGGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGGAGGTGGGGTGATTggggc > 1:1318267/1‑239 (MQ=255) gTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTggcgc < 2:1765407/238‑1 (MQ=255) cgcgCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTggcgcggg < 2:1755568/239‑1 (MQ=255) cgcgCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTggcgcggg < 2:1613539/239‑1 (MQ=255) gCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGGTTGAAAAAGCCGTATCGATTCTGGAATCTGTGACGCCCTGGGGGCCGGGGAAATCTGGGGGGGGCCGTCG‑CCC‑GAAAATTCGCGTAGGGGTGATGATATGCGCGGGGGCG‑gaaa > 2:506314/1‑238 (MQ=255) aTCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCt < 2:1717409/239‑1 (MQ=255) tCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTc < 1:555589/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCgg < 1:1194471/239‑1 (MQ=255) tttCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCgg < 1:356891/239‑1 (MQ=255) tCTGCAAACCCAGGTTGCTGTTACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCGTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCa < 2:1330689/239‑1 (MQ=255) tCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATAGATTCTGCAATCTGTGAGGCGTGGCGGTACGGGTAAAACTGGGGGGGACCGTCA‑CCC‑GGAAGTTCGGGTAGGGGTGATGATTGGCGCCGGCGCG‑GAAATCCTCGGCa > 2:1406282/1‑239 (MQ=255) tCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTATGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGggcg < 2:1025251/239‑1 (MQ=255) tCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGggcg < 1:1329623/239‑1 (MQ=255) cggtgACGTTCCAGGTAGATATTCTCCCGGCAGCAAAAAGTGGTCGCGGTATCATGCGTGACCACGCGGCAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCGGGTGGTGGCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGggcgc < 2:240149/237‑1 (MQ=255) cGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGgcgcggcgcg > 1:1892051/1‑239 (MQ=255) ccAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGGGACCGTCA‑CCC‑GAAAAATCGTGAAGGGGGGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTTAAGTTGGGGGCGGCGCGA‑AGa > 1:1074832/1‑239 (MQ=255) tCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGGGGGGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGAGTGGGGCGGGGGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTTAAGTTGGGCGCGGGGCGA‑AGAT‑TGgc > 1:191303/1‑239 (MQ=255) cGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcg < 1:636856/239‑1 (MQ=255) cGATATTCACCCGGCAGCAAAAAGTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGGAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGGCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcg < 2:1150839/239‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcgc < 1:1546061/239‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcgc < 1:149976/239‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcgc < 1:1660969/239‑1 (MQ=255) atatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGGATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGGGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTTAAGGTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCa > 1:1684983/1‑239 (MQ=255) tatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCa < 1:599497/238‑1 (MQ=255) tatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGGGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTTAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGAT‑TGGCGCAg > 1:1304773/1‑239 (MQ=255) cGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCgtg < 1:1443987/239‑1 (MQ=255) cGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCgtg < 1:601597/239‑1 (MQ=255) gcagcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGGGGGGACCGTCA‑CCC‑GGAAAATTGTGTAGGGGGGATGATTGGCGCGGGGGCG‑AGAAAACCCGGCAATATTGAGGGTTGGGGCGGGGCGG‑AGATGTGGGGCAGGTTGCgggg > 2:1370498/1‑239 (MQ=255) gcagcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGGGCGGGGCGA‑AGAT‑TGGGGCAGGTTCCggggt > 1:944865/1‑239 (MQ=255) agcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCgtggtg < 1:1366640/238‑1 (MQ=255) gcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCgtggt > 1:1079792/1‑236 (MQ=255) aaaaaTTGGTCGCCGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTAGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGtgct < 1:1679535/237‑1 (MQ=255) gcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTgccg < 1:1253151/239‑1 (MQ=255) gcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTgccg < 1:275424/239‑1 (MQ=255) tGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGGTTGAAAAAGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCCCATacc > 1:939369/1‑239 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGGGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGGAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGGTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCAccg > 1:1007041/1‑238 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCAccg > 1:1364218/1‑238 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGGGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGGGAAGGGGTGGGGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAAACCCACGCCATATTTAAGGTGGGGGCGGGGCGG‑AGAA‑TTGCGCAGGGTCCCTGGGGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCGGaccaccc > 2:1515094/1‑237 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACCCCGCATCGCTTCTGCCATCTGTGACGCTTGGCGGGTCGGGGGAATCTGGTGGTGGCCCTCC‑CCC‑GAAAAATTGTGGAGGGGTGATGGTTGGCGCGGGGGCGAAAAACCCTCGGCCA‑ATTGACGTTGGGTGCGGCCGGG‑AGAA‑TGGGGGCGCGTCCGGGGTGCTGTCAACG‑GGCgccccccccaccaccc > 2:63993/1‑228 (MQ=255) ccACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCATACCAccgcc > 1:1919657/1‑238 (MQ=255) cgcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcgc > 1:1589362/1‑192 (MQ=255) cgcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGgcgc < 2:1589362/192‑1 (MQ=255) gcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGGTCCGTGGGGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCCTACCACCGCCGCTg > 1:707577/1‑238 (MQ=255) gtTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAGGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCA‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTAt < 1:1114021/239‑1 (MQ=255) ttgTGAAAGCGGTGTTGATTGAGAACGACGTATCGGTTCGCCACTTTGGGAGGCTGGGCGGTGGGGGTAAATCGGTGGGTGACCGCAA‑CCG‑AAAAATTCGGGAAGGGGTGATGTGTGGCGCGGGCACG‑AAAATCCTGGGCAATTTTGAAGTTGGGCGCGGGTCGA‑GGTT‑GTGCGCAGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACG‑GGTGCCGCGGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTAt < 2:1242707/236‑1 (MQ=255) gcaa‑CGGGGGTGATTAAAAAGGCCTTATGGTTTCGGCAATTTGGGACGCTTGGGGGTACGGGTAATTGTGGTGGTCACCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGTTGGGGGGGGGGGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑GGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACG‑GGTGCCGCCGCACCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCg < 2:1074832/236‑1 (MQ=255) aa‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGCTTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGGGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCggga > 1:1164977/1‑237 (MQ=255) aa‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATATGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGGTCCGGCTCGCATTGTCGGTa > 1:185603/1‑239 (MQ=255) aa‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGGGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTa > 1:1203868/1‑239 (MQ=255) gTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCCTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGGGGGGTGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGTAGATGGGCGCGGCGGGG‑AGAG‑TGGCGGCGGTTCCGTGGGGCTG‑CAAAC‑GGTGCCGCCGCCTACCCCCCCCGCCGGGGTTGCGGGCCGGATTGTCGGGGAACCCGa > 2:1322902/1‑239 (MQ=255) aaaCGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCGGGTGGTGCCCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCA‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATa < 1:281203/239‑1 (MQ=255) cgacgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCCCATACCACCGCCGCTGGCGTGCGGGCTCCACTTTTCGGTAACCCAgcactcgcaact > 2:1743711/1‑227 (MQ=255) acgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGggcg < 1:1270891/130‑1 (MQ=255) ggttgtttCTGAAATGTGTGAGGCTGGGGGGTACGGCTACATGTGGTGGTGGCGCTAC‑CCC‑AAAAATTCGGGAAGGTGTGCTGATTGGCGCGGGAGCG‑AAAGTCCTGTGAATGATGGAGGTGGGGCGGGGGGGGA‑GAGT‑GGGCGCGGTTGCCGTGTTG‑TG‑CGACCGGGTCCGGCCGTACACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCa < 2:1731247/233‑1 (MQ=255) aTCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCaa < 1:764381/239‑1 (MQ=255) gtgATTATGAAATGTGTGAGGTTGGGGGGTAGGGGTAAA‑GTGGGGGGGGCCCTGACCCC‑AAAAATTGGTGAGGGTGTGATGATGGGCGCGGGCGCA‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTGGGGCGGGGCGAGA‑AGTT‑GGGCGCGGTTTCCGTGGTGCTG‑CAACG‑GGTGCCCCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAAt < 2:1079792/237‑1 (MQ=255) tGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAACTCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGGACTGTCGGTACACCCGACAGCGATAAGCCATCAATGGataag > 2:1293868/1‑237 (MQ=255) ttCTGTGACGCTTGGGGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCG‑GAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 1:854679/238‑1 (MQ=255) ctggtccgtttGGGGGTTCTGGTAAATCCGGGGGGGCCCCTCA‑CCC‑GAAAATTCTTGTGGGTGTGCTGATGGGCGCGGGCTCG‑AAACCCCTCGGCAGATTTGGATGGGGGCGCGGCGCAA‑AAAT‑GGGCGCGGGTTCCGTGGCGCGG‑CACCG‑GGTGCCCCCTCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 2:272759/228‑1 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGc > 1:1861891/1‑239 (MQ=255) gttGGGGGGACGGGAAAGCGTGGTGGGGGCCGACC‑CCC‑GAAATTTCAGGAGTGTGTGAGGTGTGGCGGGGGCGGA‑AAAACCCTCGGGAATATAGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑ATAT‑GGGCGCGGTTGCCGGGGGGCTG‑CAGCG‑GGTGCCGCCGCATACCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 2:336788/238‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTAAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCCGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCCCCTATTGTTGGGAAACGACAAAGCGGTAGGCCCTCAATGGCTAAGGACCAgacttcta > 2:537679/1‑231 (MQ=255) ttGGGGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGCCCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 1:1646288/238‑1 (MQ=255) tgggCGGTCGGGGTAATTCGGGGGAGGACCGTCC‑CCC‑AAAAATTCGTGGAGGTGTAATGGTGGGCGGGGGCGCA‑AAAACCCGGGGCAATATTGAGGTGGGGGGGGGGGGGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGGGTTGCTG‑CACCC‑GGGCCCCCCACACCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 2:918232/236‑1 (MQ=255) tgggCGGTAGGGGTAAATGGGGGGGTG‑CCGACA‑CCCGGAAAATTGGGGAGGGGGTGATGATTGGGGCGGGCGCG‑AAAATCGTCGGCAATATGTAGGTGGGGGGGGGCGCGA‑GGAT‑GGGCGCCGGTCCCGGGGGGCTG‑CAACG‑GGGCCCGCCTCACCCCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 2:1861891/236‑1 (MQ=255) tgggCGGTAGGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCC‑CCC‑AAAAATCCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTCCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 1:384885/236‑1 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGCAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAg > 1:855251/1‑207 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGCTATGGACCAGCATTTCAACgg > 2:245384/1‑239 (MQ=255) ggCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACgg > 1:918232/1‑239 (MQ=255) cGGTGCGGGTAAATGTGGGGGGGACCGTAA‑CCG‑AAAAATTCGTGAGGGTGGGATGATGGGCGCGGGCGCG‑AAAACCCGCGGAAATATTGAGGTGGGGCGGGGCGCGA‑AGAT‑GGGCGCGGGTCCGGTGGTGCTC‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATGAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGt < 2:334196/238‑1 (MQ=255) gTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTGGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTAt < 1:523863/238‑1 (MQ=255) aggggTAAATCGGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTaa < 1:130377/237‑1 (MQ=255) gggTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGGAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGCTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCCTACCACCGCCGCTGGCGATCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAACCCATCAATGGACCTGGTACAGCATTTCAACGGCAtgtac > 2:1019428/1‑234 (MQ=255) ggTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGAGGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGGGA‑AGAT‑TGGCGCGGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGAATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc < 1:619875/238‑1 (MQ=255) tgaaaTCGGGGGGTGACCGCCA‑CCC‑GAAAATGCGTGAGGGTGGGATGATGGGCGCGGGGGCA‑AAAATCCGCGGAAATATGGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑GGGCGCGGGTTCGGTGGTGCTG‑AAACC‑GGTGCGGCCCAACACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCGATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 2:314771/236‑1 (MQ=255) gTAAATCTGGTGGTGACCGTCC‑CCC‑GAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGGGA‑AGAT‑TGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 1:1515094/238‑1 (MQ=255) gTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCA‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 1:1322902/238‑1 (MQ=255) atgtgggggGGACCGACA‑CCA‑GAAATTTGGGGAAGGTGGGGTGAGTGGCGGGGGCGCG‑AAATTCCTCGGCAATATGGAAGGTGGGGGCGGGGCGA‑AGAT‑GGGCGCAGTTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGGGCCCCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAt < 2:1684983/236‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGGG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCG‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAtt < 1:63993/239‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGCTAGTGACCAGCCTTTCAACGGAATCAACCATACAtt > 2:1093242/1‑239 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAtt > 2:821205/1‑239 (MQ=255) gtgggtggACCGCCA‑CCC‑GAAATTTCGGGAGGGTGTGAGTATTGGGGCGGGCGCT‑AAAATCCTCGTAATTATTCAGGTGCGGCGCGG‑GCGAGAGAG‑GGTCGCAGTTTCGGGGTTTCGC‑CAGCG‑GGTGCCGCCCCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAttt < 2:385479/231‑1 (MQ=255) tggtgACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc > 2:210706/1‑227 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc > 2:139160/1‑201 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 1:139160/201‑1 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:1721632/1‑239 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:385479/1‑239 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:758160/1‑239 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 2:589704/1‑239 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGACTTTCAACGGGATTAACCATACATTTGAGTATggg > 2:283937/1‑239 (MQ=255) aCCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACACCGATACACAATCAATGGATATGGACCAGCCTTTCAACGGTTTTAACCATACATTTGAGTATggg > 2:1877674/1‑239 (MQ=255) cA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGgggatgg > 1:1080002/1‑239 (MQ=255) aaaaTTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTa < 1:283937/239‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGGAAACCAGACCGCGAAAAGCCCTCAATGGGAATGGACCAGCCTTTCAACGGCATTAACCCTACCTTTGAGGATGGGGACTGGAACTAATGt > 2:1377854/1‑236 (MQ=255) | TGGAATCAGGGGCGTCGCGCACTGGCAATCTTTCTGCAAAACCAGGTTTCTGTGACGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAA‑CGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCA‑CCC‑GAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGAT‑TGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGT > NC_007779/3858213‑3858677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |