| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,858,503 | C→G | 11.6% | G217G (GGC→GGG) | cysE → | serine O‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,858,503 | 0 | C | G | 11.6% | 281.9 / 3.1 | 128 | G217G (GGC→GGG) | cysE | serine O‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/55); new base G (4/13); total (59/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAATCTCTCAATA > NC_007779/3858268‑3858740 | cGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGgcgcggcgcg > 1:1892051/1‑239 (MQ=255) ccAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGGTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGa < 2:485480/239‑1 (MQ=255) cGATATTCACCCGGCAGCAAAAAGTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGGAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGGCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGgcg < 2:1150839/239‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGgcgc < 1:1546061/239‑1 (MQ=255) gATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGgcgc < 1:1660969/239‑1 (MQ=255) atatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGGATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGGGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTTAAGGTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCa > 1:1684983/1‑239 (MQ=255) tatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCa < 1:599497/238‑1 (MQ=255) tatTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGGGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTTAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGATTGGCGCAg > 1:1304773/1‑239 (MQ=255) atTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAgg < 1:1757594/239‑1 (MQ=255) cGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCgtg < 1:1443987/239‑1 (MQ=255) gcagcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGGGCGGGGCGA‑AGATTGGGGCAGGTTCCggggt > 1:944865/1‑239 (MQ=255) agcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCgtggtg < 1:1366640/238‑1 (MQ=255) gcaAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCgtggt > 1:1079792/1‑236 (MQ=255) gcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTgccg < 1:275424/239‑1 (MQ=255) gcgGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTgccg < 1:1253151/239‑1 (MQ=255) tGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGGTTGAAAAAGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGATTGGCGCAGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCCCATacc > 1:939369/1‑239 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGGAAATCTGGGGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGGAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGGTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCAccg > 1:1007041/1‑238 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCAccg > 1:1364218/1‑238 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGGTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCAccg > 1:529984/1‑238 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGGGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGGGAAGGGGTGGGGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAAACCCACGCCATATTTAAGGTGGGGGCGGGGCGG‑AGAATTGCGCAGGGTCCCTGGGGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCGGaccaccc > 2:1515094/1‑237 (MQ=255) gACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACCCCGCATCGCTTCTGCCATCTGTGACGCTTGGCGGGTCGGGGGAATCTGGTGGTGGCCCTCCCCCGAAAAATTGTGGAGGGGTGATGGTTGGCGCGGGGGCGAAAAACCCTCGGCCA‑ATTGACGTTGGGTGCGGCCGGG‑AGAATGGGGGCGCGTCCGGGGTGCTGTCAACG‑GGCgccccccccaccaccc > 2:63993/1‑228 (MQ=255) ccACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGG‑AGATTGGCGCAGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCATACCAccgcc > 1:1919657/1‑238 (MQ=255) cgcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGgcgc > 1:1589362/1‑192 (MQ=255) gcgACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGGTCCGTGGGGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCCTACCACCGCCGCTg > 1:707577/1‑238 (MQ=255) gtTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAGGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCA‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTAt < 1:1114021/239‑1 (MQ=255) gcaaCGGGGGTGATTAAAAAGGCCTTATGGTTTCGGCAATTTGGGACGCTTGGGGGTACGGGTAATTGTGGTGGTCACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGTTGGGGGGGGGGGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATGGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACG‑GGTGCCGCCGCACCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCg < 2:1074832/236‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGCTTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGGGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCggga > 1:1164977/1‑237 (MQ=255) aaCGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATATGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGGTCCGGCTCGCATTGTCGGTa > 1:185603/1‑239 (MQ=255) aaCGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGGACGGGTAAATCTGGTGGGGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGGGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTa > 1:1203868/1‑239 (MQ=255) gTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCCTGGCGGGACGGGGAAATCTGGTGGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGGGGGGTGATTGGCGCGGGGGCG‑GAAATCCTCGGCAATATTGTAGATGGGCGCGGCGGGG‑AGAGTGGCGGCGGTTCCGTGGGGCTG‑CAAAC‑GGTGCCGCCGCCTACCCCCCCCGCCGGGGTTGCGGGCCGGATTGTCGGGGAACCCGa > 2:1322902/1‑239 (MQ=255) aaaaCTACTTATCGTTTCGCCATTCGGTGACGTTGGTCGTTCGGGGTAATTTGGGTGGGGCCCGTCCCCCAAAAATTCGTGAAGGTGTGATGTTGGGGGGGGGCGCG‑AAATTCCTCGGCAATATGGAGGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACG‑GGGGCCGCCGCCTACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGAt < 2:939369/239‑1 (MQ=255) cgacgTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCCCATACCACCGCCGCTGGCGTGCGGGCTCCACTTTTCGGTAACCCAgcactcgcaact > 2:1743711/1‑227 (MQ=255) ggttgtttCTGAAATGTGTGAGGCTGGGGGGTACGGCTACATGTGGTGGTGGCGCTACCCCAAAAATTCGGGAAGGTGTGCTGATTGGCGCGGGAGCG‑AAAGTCCTGTGAATGATGGAGGTGGGGCGGGGGGGGA‑GAGTGGGCGCGGTTGCCGTGTTG‑TG‑CGACCGGGTCCGGCCGTACACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCa < 2:1731247/233‑1 (MQ=255) aTCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCaa < 1:764381/239‑1 (MQ=255) gagtttCGGCAATCTGAGACGTGTGGCGTGGGGGGTAACTCGGGTGGGGACCGTCCCCAGAAATTTGGTAAGGGTGGGATGATGGGGGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATTTTGAGGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCGGGTCCCGTGGTGCTG‑CAGCC‑GGTGCCGCCGCATCCCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAAt < 2:246563/235‑1 (MQ=255) tGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAACTCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGGACTGTCGGTACACCCGACAGCGATAAGCCATCAATGGataag > 2:1293868/1‑237 (MQ=255) ttCTGTGACGCTTGGGGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCGGAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 1:854679/238‑1 (MQ=255) ctggtccgtttGGGGGTTCTGGTAAATCCGGGGGGGCCCCTCACCCGAAAATTCTTGTGGGTGTGCTGATGGGCGCGGGCTCG‑AAACCCCTCGGCAGATTTGGATGGGGGCGCGGCGCAA‑AAATGGGCGCGGGTTCCGTGGCGCGG‑CACCG‑GGTGCCCCCTCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 2:272759/228‑1 (MQ=255) tgtgACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGc > 1:1861891/1‑239 (MQ=255) gttGGGGGGACGGGAAAGCGTGGTGGGGGCCGACCCCCGAAATTTCAGGAGTGTGTGAGGTGTGGCGGGGGCGGA‑AAAACCCTCGGGAATATAGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑ATATGGGCGCGGTTGCCGGGGGGCTG‑CAGCG‑GGTGCCGCCGCATACCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 2:336788/238‑1 (MQ=255) ttGGGGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGCCCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCaa < 1:1646288/238‑1 (MQ=255) cGGTGCGGGTAAATGTGGGGGGGACCGTAACCGAAAAATTCGTGAGGGTGGGATGATGGGCGCGGGCGCG‑AAAACCCGCGGAAATATTGAGGTGGGGCGGGGCGCGA‑AGATGGGCGCGGGTCCGGTGGTGCTC‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATGAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGt < 2:334196/238‑1 (MQ=255) tACGGGTAATTCTGGGGGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAACCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTAtt < 1:1350927/238‑1 (MQ=255) aggggTAAATCGGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTaa < 1:130377/237‑1 (MQ=255) gggTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGGAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGCTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCCTACCACCGCCGCTGGCGATCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAACCCATCAATGGACCTGGTACAGCATTTCAACGGCAtgtac > 2:1019428/1‑234 (MQ=255) ggTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGAGGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGGGA‑AGATTGGCGCGGGTTCCGGGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGAATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc < 1:619875/238‑1 (MQ=255) tgaaaTCGGGGGGTGACCGCCACCCGAAAATGCGTGAGGGTGGGATGATGGGCGCGGGGGCA‑AAAATCCGCGGAAATATGGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATGGGCGCGGGTTCGGTGGTGCTG‑AAACC‑GGTGCGGCCCAACACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCGATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 2:314771/236‑1 (MQ=255) gTAAATCTGGTGGTGACCGTCCCCCGAAAATTCGTGAGGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGCG‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGGGA‑AGATTGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 1:1515094/238‑1 (MQ=255) gTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCA‑AAAATCCTCGGAAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCa < 1:1322902/238‑1 (MQ=255) atgtgggggGGACCGACACCAGAAATTTGGGGAAGGTGGGGTGAGTGGCGGGGGCGCG‑AAATTCCTCGGCAATATGGAAGGTGGGGGCGGGGCGA‑AGATGGGCGCAGTTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGGGCCCCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAt < 2:1684983/236‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGGGGGCGGG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCG‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAtt < 1:63993/239‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGCTAGTGACCAGCCTTTCAACGGAATCAACCATACAtt > 2:1093242/1‑239 (MQ=255) tCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAtt > 2:821205/1‑239 (MQ=255) gtgggtggACCGCCACCCGAAATTTCGGGAGGGTGTGAGTATTGGGGCGGGCGCT‑AAAATCCTCGTAATTATTCAGGTGCGGCGCGG‑GCGAGAGAGGGTCGCAGTTTCGGGGTTTCGC‑CAGCG‑GGTGCCGCCCCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACAttt < 2:385479/231‑1 (MQ=255) tggtgACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc < 1:210706/227‑1 (MQ=255) tggtgACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAAcc > 2:210706/1‑227 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc > 2:139160/1‑201 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 1:139160/201‑1 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:385479/1‑239 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:1721632/1‑239 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 1:758160/1‑239 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATggg > 2:589704/1‑239 (MQ=255) aCCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACACCGATACACAATCAATGGATATGGACCAGCCTTTCAACGGTTTTAACCATACATTTGAGTATggg > 2:1877674/1‑239 (MQ=255) cACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGgggatgg > 1:1080002/1‑239 (MQ=255) aaaaTTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTa < 1:283937/239‑1 (MQ=255) gTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGGAAACCAGACCGCGAAAAGCCCTCAATGGGAATGGACCAGCCTTTCAACGGCATTAACCCTACCTTTGAGGATGGGGACTGGAACTAATGt > 2:1377854/1‑236 (MQ=255) atgatTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGCTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGcc > 1:1036546/1‑239 (MQ=255) tGGCGCGGGCGCG‑ACAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATCGGCGCAGGTCCCGTGGTTCTG‑CAACC‑GCTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGGATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCCTTTCAACGGTATTAACCACACCGTTGAGATTGGGGAAGGGCTCTAATGTCCTGACATCGTGCAGGaac > 2:1020718/1‑237 (MQ=255) tGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGAt > 2:1011941/1‑238 (MQ=255) tGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGAt > 1:1079346/1‑238 (MQ=255) tGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGCATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGCGATCGTGCCGGAt > 2:123552/1‑238 (MQ=255) ggcgcgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGc > 2:188635/1‑239 (MQ=255) ggcgcgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGc > 1:337225/1‑239 (MQ=255) ggggggcgaa‑AAAATCCTGGGCAATATGGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGGGGGTCCGGTGGTGCTG‑CAACG‑GGTGCCCCCGCAAACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCg < 1:1284393/235‑1 (MQ=255) cgcgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGa > 1:1048441/1‑239 (MQ=255) cgcgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATGGAAGTGGGGCGCGGGGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCG‑GGTGCCGCCGAATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCg < 1:910739/238‑1 (MQ=255) cgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCaa < 1:1515671/150‑1 (MQ=255) cgggcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCaa > 2:1515671/1‑150 (MQ=255) gggcg‑AAAACCCGCGGCAATATGGAAGTGGGGCGCGGCGCGA‑AGATGGGCGCAGTTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GTGCCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTa < 1:880285/236‑1 (MQ=255) gcgcg‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAACAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCTTGTTATCCGGCCGGATGCgcattaa > 2:1048279/1‑233 (MQ=255) aaaTCCGGGGCATTATTGAGGTGGGGCGCGGGGAGA‑AGTTGGGGGCGGGTGCCGTGGTGCGG‑CAGCG‑GGTGCCGCCCCAACCCCCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAatcat < 2:944865/237‑1 (MQ=255) acccTCGGAAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGGGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCG‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTAt < 1:872509/237‑1 (MQ=255) aTCCTCGGCATAATGGAGGTTGGGCGGGGCGCGA‑GGATTGGCGCAGTTTCGGTGGTGCGG‑CACCG‑GTTCCCGCCGAATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTAt < 1:934943/239‑1 (MQ=255) cGGAAATATTGAAGTGGGGGGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCGGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGc < 1:431621/239‑1 (MQ=255) gacAATATGGATGTTGGCCGCGGGGGGA‑AAATCGGCGCGGGTCCCGTGGGGCCG‑CATCC‑GGTGCCGCCCCATCCCTCCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGcc < 1:1062065/237‑1 (MQ=255) aaTGTTGAGGTGGGGCGCGGCGAGA‑GGTTGGGCGCGGTTTCGGTGGTGCTA‑CACCG‑GGCACCGCAGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTAc < 2:13961/239‑1 (MQ=255) tatTAAAGCTGGGCGCGGCGCGA‑AGTTTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCG‑GGTGCCGCCGCATACCAACGCCGCGGGCGTTCCGACTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATCAGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGGATGGGGATGGGATCTCATGTTCTGTGAACGTGCCGGATGCGAAGAAGTCATCGAACAGGCCt > 2:148365/1‑235 (MQ=255) tatGGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGAcc < 1:1030241/140‑1 (MQ=255) tgggggcgggcgcgA‑AGATGGGGGCGGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGGGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTaa < 1:1406282/230‑1 (MQ=255) tggggCGGGGGGCGA‑GGACGGGCGTCGGTTCCGTGGCGCTG‑CTACG‑GGTGCCGCCACATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTaa < 2:1079346/236‑1 (MQ=255) tggggCGCGGCGCGA‑AGGTGGGCGCAGGTCCCGGGGGGCTG‑CACCC‑GGTGCCGCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTaa < 1:537679/236‑1 (MQ=255) gggCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGgggatggg < 1:443272/174‑1 (MQ=255) gggCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGgggatggg > 2:443272/1‑174 (MQ=255) gggCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAAtc > 2:271824/1‑238 (MQ=255) gggCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAAtc > 1:1286130/1‑238 (MQ=255) gggCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGAATTTCaa > 1:741444/1‑140 (MQ=255) ggcggggcgaGA‑ATTTTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CACCC‑GGTGCCCCCGCATCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAAtct < 1:369782/238‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAAtc > 1:617067/1‑237 (MQ=255) cgcgA‑AGTTTGGCGCAGGTCCCGGGGTGCGG‑GACCC‑GGTCCCCCCCCACCCCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAATCTCTCAATa < 1:1057633/238‑1 (MQ=255) cgcgA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGCTATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAATCTCTCAATa > 2:1323893/1‑238 (MQ=255) | CGTTCCAGGTCGATATTCACCCGGCAGCAAAAATTGGTCGCGGTATCATGCTTGACCACGCGACAGGCATCGTCGTTGGTGAAACGGCGGTGATTGAAAACGACGTATCGATTCTGCAATCTGTGACGCTTGGCGGTACGGGTAAATCTGGTGGTGACCGTCACCCGAAAATTCGTGAAGGTGTGATGATTGGCGCGGGCGCG‑AAAATCCTCGGCAATATTGAAGTTGGGCGCGGCGCGA‑AGATTGGCGCAGGTTCCGTGGTGCTG‑CAACC‑GGTGCCGCCGCATACCACCGCCGCTGGCGTTCCGGCTCGTATTGTCGGTAAACCAGACAGCGATAAGCCATCAATGGATATGGACCAGCATTTCAACGGTATTAACCATACATTTGAGTATGGGGATGGGATCTAATGTCCTGTGATCGTGCCGGATGCGATGTAATCATCTATCCGGCCTACAGTAACTAATCTCTCAATA > NC_007779/3858268‑3858740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |