Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,908,726 | G→T | 9.2% | Q187K (CAA→AAA) | Y75_RS19370 ← | D‑xylose ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,908,726 | 0 | G | T | 9.2% | 370.2 / 3.2 | 132 | Q187K (CAA→AAA) | Y75_RS19370 | D‑xylose ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/79); new base T (12/2); total (51/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.47e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTAATACTTTA > NC_007779/3908489‑3908964 | gTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAT‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTTCGG‑TAACCCGCCCAC‑AACCCATTgg > 2:1074840/1‑239 (MQ=255) ttATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTA‑CG‑CGTTTTTCCTAATTTTTTATTCGTTTTTCGGTTAACCA‑CCTCC‑AACCCACTgg > 2:1803928/1‑237 (MQ=255) ttATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGCTTG‑AG‑CGGTTTTCATAATTTTTAAAACGCTTTTCTG‑TTACCAGCCCTC‑AAACCCTTTGtt > 1:987832/1‑238 (MQ=255) tataCACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGGTTTTCATAATTTTCAATTCGTTTTTCCG‑TAACCAACCATC‑AACCCATTGGtt > 1:55457/1‑237 (MQ=255) ataCACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGTTTTTCATAATTTTCAATGTGTTTTCCGT‑TAACCAGCCCTA‑ACCCCCTTgtgca > 2:1318548/1‑234 (MQ=255) ataCACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑GG‑CGTTTTTCCTAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCa > 1:1154583/1‑238 (MQ=255) cacCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCaa < 1:398954/239‑1 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCGCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGGTTTCCATAATTTTTTATTCGGTTTTCGG‑GAACCAGCCATC‑AACCCGTTTGGCACCAACg > 1:1402400/1‑238 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCCCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑GGCCGTTTTTCAT‑ATTTTCTATGCGTTTTCTGT‑TTGCCAACCATC‑AACACCTTTGTCAACAACg > 2:1473187/1‑238 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTCCAGCATCAATTTTGTTATTATTGGCGGGTTGGCCG‑CTTTTTCCTATATTTT‑‑ATGCGTTTTCTGT‑TGACCAGCCAAC‑AACCCCTTTGTCACCaata > 2:1684245/1‑236 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGCTTTTCATAATTTTCTATTCTTTTTTCTG‑TGACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCTCCacca > 1:692393/1‑235 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTA‑TG‑GGGTTTTCATAATTTTCAATTCGTTTTCCTG‑TAACCAGCCATA‑AACACATTGTTCACCAACGa > 2:389534/1‑239 (MQ=255) cGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑GG‑GGTTTTCCCTAAATTTCAAATCGTTTTTCGG‑TAAACAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACg > 1:800049/1‑238 (MQ=255) gTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGCGTTCCATAATTTTTAATGCGTTTTTCGG‑GAACCAGCCATC‑AAACCATTGGTCACCAACg > 1:1459916/1‑237 (MQ=255) tAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CTTGTTTCATAATTTTTAATTCTTTTTTCTG‑TAACATGACATC‑CACCCCTTTGTCACCTACCACt‑ttt > 2:194718/1‑238 (MQ=255) ttGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGAATGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAAt < 1:1040408/237‑1 (MQ=255) aaTACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGt < 1:1670450/239‑1 (MQ=255) aaTACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATGTTCAATGCGTTTTCCTG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGt < 2:972491/239‑1 (MQ=255) aTACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGCTTTCCACTATTTTCAATGCGTTTTTCCG‑TAAACCGCCATC‑AACCCACTGGTCCCCAACGACC‑TTAATTTTTTCGGAATCAACGTa > 1:728259/1‑239 (MQ=255) aTACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTa < 1:406670/239‑1 (MQ=255) tACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTGCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTaa < 1:747153/239‑1 (MQ=255) tACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTaa < 1:317956/239‑1 (MQ=255) aCGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTTCCTAATTTTTTATGCGTTTTTCGG‑GAAACAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACC‑TTTATTTTTCCGGAAAAAACGTAAg > 1:1841294/1‑239 (MQ=255) tttAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑AG‑CGGTTTTCATAATTTTTAATGAGTTTTTCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTTACCAAAGCCA‑TTAATTTTTTCGGAAACAACGTAAgggt > 1:1648141/1‑237 (MQ=255) ttAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTTCCTAATTTTTAATGCGTTTTCCGG‑TAAACAGCCCTC‑AACCCAGTTGTCACCAACGCCT‑TTAATTTTTCCCGAATCAACATaaaggtt > 1:1907894/1‑234 (MQ=255) aTACCTGCGTGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCGTCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTGAG‑CG‑CGTTGTCCATAATTTTCGATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AAGCCATTGGTCACCAACGACG‑TTAATTTTGCCGGAAGCAACGTAAGGTTTGaa < 2:1692463/239‑1 (MQ=255) tACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAac < 1:468695/239‑1 (MQ=255) cTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACt < 1:451830/239‑1 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGGTTTTCCTCAGTTTCTATGGGTTTTCCGG‑TAACCCGCCATG‑AACCCCATGGGCTCCCAAGGCT‑TTAATTTTTTCGGAATCAACGCAAGGTTTTAACACttt > 1:602763/1‑239 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑GG‑CGGTTTTCATAATTTTTAATGCGTTTTTCGG‑TAACCAGCCAAC‑CAACCATTCGTCACCGACGACT‑TTAATTTTTTCCGAATCAAAGTACGGTTTTAATACtt > 1:679968/1‑238 (MQ=255) gCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGGTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCCTTGGTCACCAACGACT‑TTTATTTTTCCGGAATCAAAGTAAGGGTTTAACACttt > 1:981837/1‑239 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCCTAATTTTCAATGCGTTTTTCCG‑TAACCAGCCATC‑AACCCCTTGGTTACCAACGCCT‑TTAATTTTTTCCGAATCAACGTAAGGTTTTAACACttt > 1:1701801/1‑238 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGGTTTTCATAATTTTCAATTCGGTTTTCCG‑TTACCCGGCATC‑AACCCCTTTGGCACCAACGACT‑TTAATTTTTTCTGAATCAACGTAAGGGTTTTACACttt > 1:865331/1‑238 (MQ=255) cGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCAACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAT‑CG‑CGGTTTTTTTAATTTTTTCTGTGGTTTTCGT‑TATCCAGCCCGC‑CACCCATTGGTTACCCAACACTGTTTTTTTTATGGGACACTACGTATGGTGTTAACACttt > 2:544625/1‑239 (MQ=255) cGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTc < 1:1165713/239‑1 (MQ=255) cGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTc < 1:201634/239‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGgcg < 1:871922/239‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGgcg < 1:1473187/239‑1 (MQ=255) ggCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTTAATGCGGTTTCCGG‑TAACCCACCACC‑AAACCCCTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTTCCGAATCAAACTAAAGGTTTAACACTTTCATTTTTCCGGCGCgg > 1:1269150/1‑239 (MQ=255) gCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGGTTTTCATAATTTTCAATTCGTTTTTCGG‑TTAACCGCCCTC‑CAACCATTGTTCACCAACGCCT‑TTAATTTTTTTGGAATCAACGTAAGGTTTTTACACTTTCATTTTTCCGGCGCggc > 2:1038742/1‑238 (MQ=255) ttGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCt < 1:26339/237‑1 (MQ=255) ttGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTg < 2:626509/239‑1 (MQ=255) tGCTACTTTCCCTGATAAAACTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTGTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTgg < 2:1003156/239‑1 (MQ=255) tACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCg < 1:1288240/238‑1 (MQ=255) tACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCg < 1:647447/238‑1 (MQ=255) tACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCg < 1:1676959/238‑1 (MQ=255) tACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTGTCCGAAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCgt < 2:1121628/239‑1 (MQ=255) ttCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAT‑CG‑CGGTTTTCATAATTTTCAATGTGTTTT‑CGG‑TAACCAGACATC‑AACCCATTGGTGACCAACAACT‑TTAATTTTTCCGTAAACAAAGTAAGGTTTTATCACTTTCTTTTTTTTGGCGCGGAACTGCTTTGCgttgttt > 2:693816/1‑238 (MQ=255) aaaCCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGCTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTTCGG‑TAAACCGCCATC‑AAACCCTTGGTCACCCACCAAC‑TTACTTTTTTCCGAATCAACGTAAGGCTTTAAAACCTTCCTTTTTTCGGCGGGGGAACGCCTGGCGTTTTTAttcaacg > 2:537911/1‑232 (MQ=255) ttGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAgc < 1:1560389/239‑1 (MQ=255) cgcgcTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑GG‑CGGTTTTCCTAAATTTTAATGCGGTTTTCGG‑TTAACAACCATCAAACCCTTTGGTC‑CCCACAACT‑TTTATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTTTTCGGCGCTGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGCCGAgccg > 1:897120/1‑238 (MQ=255) cgcgcTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑ATCCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTCTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTCCCGGCGAgccg < 2:106276/238‑1 (MQ=255) gcgcTTTATGCCTGAATTGCCCCCCCTGCGGTCGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTAATGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTACATAATTCTCAATGCGTTTTCCGG‑TACCCAGCCATC‑AACCCATTGGTCGCCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGGTTTAACACGTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGTGTTGTTATCTACCGGCGAgccgcc < 2:1354454/239‑1 (MQ=255) gcgcTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGTTGGCATCGTTTGCGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAgccgcc < 2:434524/239‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATc < 1:1034446/239‑1 (MQ=255) aTGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATGGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAgg < 1:1864452/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGTAAGTAATTTCCTTg < 2:15816/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:91122/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 1:1038742/239‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAA‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGGTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTg < 2:282685/239‑1 (MQ=255) aCCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAGTCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTgg < 1:1553722/191‑1 (MQ=255) ccTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑GG‑CGGTTTTCATAATTTTTAATGCGTTTTTCGG‑TAACCAGCCACC‑AACCCCTTTGTCACCAAAGACT‑TTTATTTTTTCGGAAACAAAGTAAGGATTTAAAAATTTTATTTTTTCGGCGCGGGACAGATTTGCGTTGTTTTCTTCCGGCGAGCCGTCCCTCACGGAGGAAATACCTTGCgg > 2:1583081/1‑239 (MQ=255) gCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGGTTG‑AG‑CGGTTTCCATAATTTTCACTATGTCTTTTTG‑CACCCAGCCATC‑CAACCCCTGGTGACCCAACACT‑TTAATTTTTTCGGCATCAAAGTAACGTGTTAATACCTTCATTTGTCACGCGGGGAAAAAGTTAGCGTTGTTATTCAACAGCGGCCCCACCGCCAAGAAGTAATTAACTTGCTGGACaaacaa > 2:208692/1‑235 (MQ=255) tCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGAc < 1:1505957/239‑1 (MQ=255) tCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGAc < 1:1507193/239‑1 (MQ=255) tCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTAGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGAc < 1:1318548/239‑1 (MQ=255) gTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCa < 1:1645018/239‑1 (MQ=255) tGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATATCCAATGTGTTTACCGG‑TAACCAGCCCGC‑AACCCATTTGTCACCAACGCCT‑TTAATTTTTCCGGATTCAACGTAAGGTTTTACCACTTACATTTGTCAGGCGCGGAACATCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCAGCCCATCATGAATTAATTACCTTGCGGAGCAATATCGACCAggg < 2:897120/239‑1 (MQ=255) aGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGGTTTTCCTAAATTTTAATTCGTTTTTCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGTTCACCCACGACT‑TTAATTTTTTCTGAATCAACGTAAAGTTTTAACACTTTCATTTTTCCTGCGCGGAACAACTTGTCGGTGTTTTCTACCTGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAAATACCTTGCGGGACAATATCGAACAGGGcg > 2:464709/1‑238 (MQ=255) aGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTTCATAAATTTTAATTCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑CACCCATTTGTCCCCAACGACT‑TTAATTTTTTCCGAATCAACGGAAGGTTTTAACAATTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTTTCTTCCCGCGAGCCGCCCCTCAGGGAACAATTACCTTTCGGAAAAAAATCGACCAGGGCt > 1:505162/1‑239 (MQ=255) ggCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCt < 1:431615/238‑1 (MQ=255) cATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTTG‑CG‑CGTTTTCCCTAATTTTTAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAACCATC‑AACCCCTTTGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGGTTTAACACTTTCATTTTTCCGGCGCGGGAAAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGGAGTAATTACCTTTCGGGACAATATTCACCAGGGCTTTTTCCTGCAgg > 1:513887/1‑238 (MQ=255) tattGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCg < 1:537911/239‑1 (MQ=255) tattGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCg < 1:3363/239‑1 (MQ=255) tattGGC‑GCTTAG‑CC‑CATTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTTGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATGTGTCCGTCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCg < 2:513887/239‑1 (MQ=255) c‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCg > 1:308884/1‑239 (MQ=255) ggTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCga < 1:617832/239‑1 (MQ=255) ggTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCga < 2:1402400/239‑1 (MQ=255) tCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATcc > 1:1370046/1‑239 (MQ=255) cactGCGTTTTCCGG‑TACCCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGGCT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCg < 2:1841294/236‑1 (MQ=255) cAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCg < 1:1074840/239‑1 (MQ=255) aTGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCa < 1:1589359/239‑1 (MQ=255) aTGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCa > 1:617814/1‑239 (MQ=255) tttCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGtt < 1:1845378/238‑1 (MQ=255) tatccAGCAATC‑AGCCCATTGAGCTCGAAAGACT‑TTAATTTTTGCGGAATCAACGTCAGGTTTTAACACTTTCGTTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGACCAGCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACATTATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 2:1481014/235‑1 (MQ=255) tAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCGCCAACGACT‑TTAATTATTCCGGAATGAACGTAAGGTTTTAACGCTTTCATTTGTCCGGCGCGGATCAGCTTGTCGTTGTTATCTACCTGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGATCATGGCTTTTGCCTGCATTTCACCGACTTTTTCGTTGTCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 2:717053/238‑1 (MQ=255) tAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 1:381723/238‑1 (MQ=255) tAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 1:464709/238‑1 (MQ=255) tAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 1:604940/238‑1 (MQ=255) tAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 1:1111229/238‑1 (MQ=255) tAACCAGACATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATa < 2:1701801/238‑1 (MQ=255) cagc‑AATCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATGTTTCCGGAATCAACGTAAGTTTTTAACACTTTCATCTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGGCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGGCTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAAGCATACTGTCg < 2:78601/233‑1 (MQ=255) cATC‑AACCCATTGGTCACCGACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCg < 2:972233/236‑1 (MQ=255) cATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCg < 1:194718/236‑1 (MQ=255) cATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAAGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCg < 1:1492034/236‑1 (MQ=255) aCCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTaa < 1:1077958/239‑1 (MQ=255) aCCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTaa < 1:738974/239‑1 (MQ=255) aTTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTAATACt > 2:809860/1‑239 (MQ=255) tGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTAATACttt > 1:1136148/1‑239 (MQ=255) ggTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTAATACTTTa < 1:1233640/239‑1 (MQ=255) | GTTTATACACCGTCATAGTTTGCGTACCGGCAGCAATACGTTTAATACCTGCGAGATCCGCATCCTGGCCGGAGATTGCTACTTTCCCTGATAAACCTTGCGCGCTTAATGCCTGAATTGCCCCACCTGCGGTGGCATCGTTTGAGGCAACTACAGCATCAATTTTGTTATTATTGGC‑GGTTAG‑CG‑CGTTTTCCATAATTTTCAATGCGTTTTCCGG‑TAACCAGCCATC‑AACCCATTGGTCACCAACGACT‑TTAATTTTTCCGGAATCAACGTAAGGTTTTAACACTTTCATTTGTCCGGCGCGGAACAGCTTGGCGTTGTTATCTACCGGCGAGCCGCCCATCAGGAAGTAATTACCTTGCGGAACAATATCGACCAGGGCTTTTGCCTGCAGTTCACCGACTTTTTCGTTATCGAAAGAAATATAAAAATCGATATCCGCATCGTTAATCATACGGTCGTAAGCTAATACTTTA > NC_007779/3908489‑3908964 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |