| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 4,045,020 | 0 | A | G | 16.7% | 184.7 / 4.6 | 80 | E29G (GAG→GGG) | Y75_RS19995 | branched chain amino acid ABC transporter permease LivM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/42); new base G (12/3); total (35/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-03 | |||||||||||
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ATGATTGGCGGCCTGATTCTGGGGATTGCGGAGGCGCTCTCTTCTGCCTATCTGAGTACGGAATATAAAGATGTGGTCTCATTCGCCCTGCTGATTCTGGTGCTGCTGGTGATGCCGACCGGTATTCTGGGTCGCCCGGAGGTAGAGAAAGTATGAAACCGATGCATATTGCAATGGCGCTGCTCTCTGCCGCGATGTTCTTTGTGCTGGCGGGCGTCTTTATGGGCGT‑GCAACTGGAGCTGGATGGCACCAAACTGGTGGTCGACACGGCTTCGGATGTCCGTTGGCAGTGGGTGTTTATCGGCACGGC‑‑GGTGGTC‑TTTTTCTTCCAGCTTTTGCGACCGGC‑TTTCCAGAAAGGGTTGAAAAGC‑GTTTCCGGACCGAAGTTTATTCTGCCCGCCATTGATGGCTCCACGGTGAAGCAGAAACTGTTCCTCGTGGCGCTGTTGGTGCTTGCGGTGGCGTGG‑CCGTTTATGGTTTC > NC_007779/4044783‑4045257 | atgatTGGCGGCCTGATTCTGGGGATTGCGGAGGCGCTCTCTTCTGCCTATCTGAGTACGGAATATAAAGATGTGGTCTCATTCGCCCTGCTGATTCTGGTGCTGCTGGTGATGCCGACCGGTATTCTGGGTCGCCCGGAGGTAGAGAAAGTATGAAACCGATGCATATTGCAATGGCGCTGCTCTCTGCCGCGATGTTCTTTGTGCTGGCGGGCGGCTTTATGGGCGT‑GCAACTGGAg > 1:68496/1‑239 (MQ=255) 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gctgctCTCTGCCGCGATGTTCTTTGTGCTGGCGGGCGTCTTTATGGGCGT‑GCAACTGGAGCTGGATGGCACCAAACTGGTGGTCGACACGGCTTCGGATGTCCGTTGGCAGTGGGTGTTTATCTGCACGGC‑‑GGTGGTC‑TTTTTCTTCCAGCTTTTGCGACCGGC‑TTTCCAGAAAGGGTTGAAAAGC‑GTTTCCGGACCGAAGTTTATTCTGCCCGCCATTGATGGCTCCACGGTGAAGc < 1:1405011/239‑1 (MQ=255) gctgctCTCTGCCGCGATGTTCTTTGTGCTGGCGGGCGTCTTTATGGGCGT‑GCAACTGGAGCTGGATGGCACCAAACTGGTGGTCGACACGGCTTCGGATGTCCGTTGGCAGTGGGTGTTTATCGGCACGGC‑‑GGTGGTC‑TTTTTCTTCCAGCTTTTGCGACCGGC‑TTTCCAGAAAGGGTTGAAAAGC‑GTTTCCGGACCGAAGTTTATTCTGCCCGCCATTGATGGCTCCACGGTGAAGc < 1:104559/239‑1 (MQ=255) ctgctCTCTGCCGCGATGTTCTTTGTGCTGGCGGGCGTCTTTATTGGCGT‑GCAACTGGGGCTGGGTGGCACCCAACTGGGGGGCGGCACGGCTTCGGGTGTCCGTTGGGAGGGGGTGGTTTTCGGCACGGCGGGGGGGTT‑TTTTTTTTCGCCTTTTTGCG‑CCGGC‑TTTCCTGAAAGGGGGGAAAAAG‑TTTTTCGGCCGGACGTTATTTTTTCCCGCCCTTTGTGGCTCCCCgtgtagac > 2:522282/1‑232 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |