Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 19,427 | A→G | 30.0% | N236S (AAT→AGT) | nhaR → | transcriptional activator NhaR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 19,427 | 0 | A | G | 30.0% | 243.5 / 129.7 | 164 | N236S (AAT→AGT) | nhaR | transcriptional activator NhaR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/65); new base G (21/28); total (71/93) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.36e-01 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
AGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAG > NC_007779/19190‑19661 | tggCCTGTTCTCCGTGAGAATTTGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGATCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATGCTCGGCGAGGGTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCa < 2:93615/237‑1 (MQ=255) aGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCaa > 2:801519/1‑239 (MQ=255) aGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCaa > 1:1917873/1‑239 (MQ=255) aGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCaa > 1:883667/1‑239 (MQ=255) aGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCaa > 1:1893943/1‑239 (MQ=255) aGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCa < 1:1440843/238‑1 (MQ=255) tGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTc > 1:1892376/1‑239 (MQ=255) ttCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGt > 1:167801/1‑239 (MQ=255) tctcCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGt < 2:676305/238‑1 (MQ=255) cGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGcc > 1:846060/1‑238 (MQ=255) gTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGcccc < 1:103686/239‑1 (MQ=255) gTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGcccc < 2:1042655/239‑1 (MQ=255) gggaATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCa < 2:1137204/236‑1 (MQ=255) gagaATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCa < 1:304206/238‑1 (MQ=255) gagaATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCa < 2:236136/238‑1 (MQ=255) gagaATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCa < 2:238909/238‑1 (MQ=255) aTTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCt < 1:670922/239‑1 (MQ=255) tGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCttt < 1:989624/239‑1 (MQ=255) tGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCttt < 1:828195/239‑1 (MQ=255) gAATGTGGGGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATg < 2:1770535/238‑1 (MQ=255) tgtgGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGGTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCCGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATTATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTTGTGCGATGGACAAAGCAATCTTCGTTGCCCAAAAGCTTTTTGCata > 2:989624/1‑239 (MQ=255) gtgGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCatat < 2:957184/239‑1 (MQ=255) gtgGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCatat < 1:1816876/239‑1 (MQ=255) tttCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTAt < 2:1467854/238‑1 (MQ=255) tttCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTAt < 2:1855705/238‑1 (MQ=255) gtACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATaaa > 1:1321538/1‑239 (MQ=255) aCAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATTTGACTTTTATGCCGATaaaa < 2:1917873/238‑1 (MQ=255) aCAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATaaaa < 2:262417/238‑1 (MQ=255) aaaTCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGATAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTg < 2:1043612/239‑1 (MQ=255) aaTCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGt < 1:1055228/239‑1 (MQ=255) aTCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTc > 1:363686/1‑239 (MQ=255) tCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCg < 2:1345582/239‑1 (MQ=255) caccaccaGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTa < 1:801519/239‑1 (MQ=255) caccaccaGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTa > 1:910282/1‑239 (MQ=255) caccaccaGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTAATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTa < 2:372576/239‑1 (MQ=255) ccaccaGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCt < 1:1150774/200‑1 (MQ=255) gAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGTCGACTTTTGAGTCCTGCGCGACGGTCAATGGTAAGGCGCCAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATTATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTTCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCCGATGACCTTTATGCCGATAAAACTTTCTTAAAAATTgt > 2:870681/1‑238 (MQ=255) aaaaaCCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTgg > 1:609895/1‑238 (MQ=255) aaaaCCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt > 2:696652/1‑238 (MQ=255) gTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAGAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCg > 1:1608113/1‑239 (MQ=255) gTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCg > 1:1703730/1‑239 (MQ=255) gTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGt > 1:259921/1‑174 (MQ=255) gTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCg > 1:1914844/1‑239 (MQ=255) ccGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 1:1267431/239‑1 (MQ=255) ttGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 1:1817201/239‑1 (MQ=255) cGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCa > 2:1180207/1‑239 (MQ=255) cGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGCTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCa > 2:727785/1‑239 (MQ=255) ttGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCgaga < 1:417226/211‑1 (MQ=255) gATTCCTGGGCGACGTGCGATTTTAGGGCGCAGATTGCTTAACTGGTGTAACTCGCAGGGATTAAACGTAGAAAGCCTCGGCGAGGTTGAGGATGCCGCTGTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAAGCTGCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGAGAAAACTGTCGTAGAAAGTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTg < 2:596994/239‑1 (MQ=255) gggCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCg < 2:1792359/239‑1 (MQ=255) ggCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCgg > 2:445683/1‑239 (MQ=255) cGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 2:16137/238‑1 (MQ=255) cGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 2:1824832/238‑1 (MQ=255) cGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 2:1703730/238‑1 (MQ=255) cGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 1:727785/238‑1 (MQ=255) cGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 2:455805/238‑1 (MQ=255) cGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGACGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGgatgat > 2:349032/1‑239 (MQ=255) cGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAACACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGgatgat > 2:289467/1‑239 (MQ=255) cGTTCAATGTTACGGCGCAAATTGCTTAAATGGTTTCACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGAAGCACAATGCAATACTCGTTGCCCCAACGCTCTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATCGGTCGCGTCGAGATTGTGACGGAAGCGTGCAAGGTTATTTTTGCGGGGAGgatgat > 2:1382251/1‑239 (MQ=255) gTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGAtt < 1:670111/239‑1 (MQ=255) gTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCAcc < 2:910282/239‑1 (MQ=255) gggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCcggc > 2:1900227/1‑239 (MQ=255) cgcAAATTGCTTAACTGGTGTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCGTCGGCGAGTGTGATGATGCCGCTTTTATTAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCGCAACGCTTGATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGGGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCcggcgg < 2:58729/238‑1 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 2:165047/218‑1 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCCGCGGTAc > 2:497287/1‑239 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTAc > 1:520642/1‑239 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTAc > 1:1290590/1‑239 (MQ=255) aaaTTGCTTAACTGGTTTAACTGCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGGTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGGCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTAc < 1:705131/238‑1 (MQ=255) tGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGa < 1:1607969/239‑1 (MQ=255) tGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGa < 2:1892376/239‑1 (MQ=255) ttAACTCCCAGGGATTGAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACg > 1:831722/1‑239 (MQ=255) cAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattat > 1:1591465/1‑237 (MQ=255) cAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattat > 2:1301081/1‑237 (MQ=255) cAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGCCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGAACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCACGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCAATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattat > 2:1157323/1‑237 (MQ=255) aGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattat > 2:949781/1‑236 (MQ=255) aGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGattat > 2:411995/1‑236 (MQ=255) gATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTgc < 1:469517/238‑1 (MQ=255) tAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCtt > 2:899289/1‑239 (MQ=255) aaCGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCtttt > 1:1681229/1‑239 (MQ=255) tAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAg > 1:1846873/1‑238 (MQ=255) aGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGt > 1:1354372/1‑238 (MQ=255) tCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCg < 1:870681/239‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTg < 1:1142401/239‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTg < 1:411995/239‑1 (MQ=255) cGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCatat < 2:1605536/85‑1 (MQ=255) cGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGCTGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTAGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCTGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCGATTCGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGt < 2:1328157/238‑1 (MQ=255) cGAGTGTGCAGAGGCCGCTTTGATGAAGGCTTTTGGTGGTATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAGACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAAGGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGt < 2:1781457/238‑1 (MQ=255) tttGATGATGCCGATTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTAGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTAAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATc > 1:93033/1‑239 (MQ=255) tgatgCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAg < 2:390677/239‑1 (MQ=255) tgatgCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAg < 1:940345/239‑1 (MQ=255) gCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTccccc < 1:288267/239‑1 (MQ=255) cTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCGCCCCCa > 2:1908450/1‑239 (MQ=255) atgaAAGCTTTTGGTGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGtt > 1:518880/1‑239 (MQ=255) ttttGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTggg < 2:1354372/239‑1 (MQ=255) ttttGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTgg < 1:1179872/238‑1 (MQ=255) ttGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCg < 2:1330401/200‑1 (MQ=255) tGCGATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGgaga < 2:518880/238‑1 (MQ=255) gATGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGgaga < 2:163194/235‑1 (MQ=255) tGCACAGTGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGagatagat < 2:828358/238‑1 (MQ=255) tGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTGCCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGagatagat < 1:1643733/238‑1 (MQ=255) | AGGAAGGCCTGTTCTCCGTGAGAATTGGCGAATGTGGCGTGAGTTTCTGGTGTACAAATCCACCACCAGAAAAACCGTTCCCGGCTTGTCTGGAAGAACGGCGACTTTTGATTCCTGGGCGACGTTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCAGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAATACGGATTATTCTGCGCTTTTTAGTCCAGCGGTGCGTTAATCGGCAGCTCCCCCAAAGTTAAGGTGGGGGAGATAGATTAG > NC_007779/19190‑19661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |