| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 537,607 | A→T | 11.5% | T251S (ACG→TCG) | Y75_RS02615 → | putative allantoin permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 537,607 | 0 | A | T | 11.5% | 406.0 / 11.5 | 141 | T251S (ACG→TCG) | Y75_RS02615 | putative allantoin permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/102); new base T (15/2); total (36/105) | |||||||||||
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GGTTTTGGCGGTGGCAAAGTTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCA‑TCCGA‑CTTTACGCAAAAC‑GCCCACTCGTTTCGTGAGCAGGCGCTGGGGCA‑AACG‑CTGGGTTTAGTTGTGGCCTATATTCTGTTTGCGGT‑CGCCGGGGTATGTATTATTGCCGGAGCCAGTATTCACTACGGCGCTGATACCTGGAACGTGCTGGATATTGTTCAGCGTTGGGACAGCCTGTTCGCCTCGTTCTTTGCGGTACTGGTTATTCTGATGACAACTATCTCCACTAACGCGACCGGTAATA > NC_007779/537373‑537844 | ggTTTTGGCGGTGGCAAAGTTTTAAATAAATTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCA‑TCCGA‑CTTTACGCa > 1:15223/1‑239 (MQ=255) 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aaataaatTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGAGCGCA‑TCCGA‑CTTTACGCAAAAC‑GCCCACTCGTTTCGTGAGc < 1:836675/239‑1 (MQ=255) aaatTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGTGGGCGCA‑CCCGG‑CTTTATGCAAAAA‑GCCCACTCGTTTCGTGGGCAGgc > 1:495475/1‑239 (MQ=255) atTCACTGCCATTCTTAACCCGTGCATCTATATCGTTTTCGGCGGTATGGCGATTTGGGCGATTTCACTGGTCGGGATCGGTCCAATCTTTGACTACATTCCGAGCGGTATTCAGAAAGCAGAAAACGGTGGCTTCCTGTTCCTGGTGGTGATTAACGCGGTAGTTGCGGTCTGGGCGGCACCGGCGGGGGGCGCA‑TCCCACCTTTAC‑CAAAAC‑GCCCACCCGTTTCGTGAGCCGgcgc > 1:1669137/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |