| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 4,264,473 | T→C | 100% | V95V (GTT→GTC) | Y75_RS21115 → | DUF2713 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,264,473 | 0 | T | C | 100.0% | 980.5 / ‑6.7 | 255 | V95V (GTT→GTC) | Y75_RS21115 | DUF2713 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (130/124); minor base G (0/1); total (130/125) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
ATCGTGACTTTATTGCATCAGTTGTTGACCGGGCTATTTTTCATTTCGCGATTAATAGTATATGTAATCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGG > NC_007779/4264238‑4264708 | aTCGTGACTTTATTGCATCAGTTGTTGACCGGGCTATTTTTCATTTCGCGATTAATAGTATATGTAATCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTCAAt > 2:1486641/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |