Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 4,348,548 | A→T | 8.9% | N164Y (AAT→TAT) | melB → | melibiose:sodium transporter MelB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 4,348,548 | 0 | A | T | 8.9% | 471.1 / 3.8 | 153 | N164Y (AAT→TAT) | melB | melibiose:sodium transporter MelB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/109); new base T (12/3); total (40/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTC‑GGCGGTGGC‑GATC‑GGGGATTT‑GGCTTTCAGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATC‑ATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCA > NC_007779/4348312‑4348785 | tAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGTAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAAt > 1:651985/1‑239 (MQ=255) 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1:1492327/239‑1 (MQ=255) ctCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTC‑GGCGGTGGC‑GATC‑GGGGATTT‑GGCTTTCAGATGTTCAct < 1:699968/239‑1 (MQ=255) atCAGATTGGTGTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGGTATTCCCTTCTTGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATATCCGTGAGCGCGATCACCTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTC‑GGCGGTGGC‑GATC‑GGGCATTT‑GGCTCTCAGATGTTCAct < 2:565813/238‑1 (MQ=255) aTTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTTATTATGTC‑GGCGGTGGG‑GGTC‑GGGGGTTT‑TGGTTTTAGATGTTTTctcttgg > 1:1871662/1‑236 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |