Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 627,875 | T→G | 8.8% | G34G (GGT→GGG) | dhbA → | 2,3‑dihydro‑2,3‑dihydroxybenzoate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 627,875 | 0 | T | G | 8.8% | 414.1 / 3.1 | 134 | G34G (GGT→GGG) | dhbA | 2,3‑dihydro‑2,3‑dihydroxybenzoate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/105); new base G (15/2); total (27/107) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ACGGTCTGGATTCGGTGCGCATGATGGCGCTGGCGGCGCGCTGGCGCAAAGTGCATGGTGATATCGACTTTGTCATGCTGGCGAAAAACCCGACCATCGACGCCTGGTGGAAGCTACTCTCCCGCGAGGTGAAATAATGGATTTCAGCGGTAAAAATGTCTGGGTAACCGGCGCAGGTAAAGGTATCGGCTACGCCACGGCGCTGGCGTTTGTTGAGGCGGGAGCG‑AAAGTTACAGGTTTTGATCAAGCGTTCA‑CTCAGGAGCAATATCCCTTTGCGACCGAAGTGATGGATGTTGCCGACGCTGCGCAGGTCGCGCAAGTGTGTCAGC‑GACTGTTAGCTGAAACGGAGCGACTGGACGCGCTGGTCAATGCGGC‑GGGAATTTTACGCATGGGCGCGACCGATCAGCTCAGTAAAGAGGACTGGCAGCAGACTTTTGCGGTTAACGTCGGCGGTGCGTTTAACCTGTTCCAGCA > NC_007779/627638‑628111 | aCGGTCTGGATTCGGTGCGCATGATGGCGCTGGCGGCGCGCTGGCGCAAAGTGCATGGTGATATCGACTTTGTCATGCTGGCGAAAAACCCGACCATCGACGCCTGGTGGAAGCTACTCTCCCGCGAGGTGAAATAATGGATTTCAGCGGTAAAAATGTCTGGGTAACCGGCGCAGGTAAAGGTATCGGCTACGCCACGGCGCTGGCGTTTGTTGAGGCGGGAGCG‑AAAGTTACAGGtt > 1:1868564/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |