| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 658,072 | 0 | C | A | 13.4% | 348.0 / 7.4 | 121 | G97C (GGC→TGC) | crcB | fluoride efflux transporter CrcB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/40); new base A (2/16); total (65/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.69e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTAAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAGGCCCTTCTGCTGCAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAAGAATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGTTTTTTTTGGTCTTTAGT‑GTGCGGTTGAGGCCGAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCT‑G‑CCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTT‑AGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATCAATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGCTGTCAGCGTCCCCAACGGAATCGCCTGATGCAGTGGGTTAAATCGCATACTTAACAGCCATCTCG > NC_007779/657835‑658308 | ttAAAACTCTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAGGCTCTTCTGCTGCAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGAAAGAATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGTTTTTTTTGGTCTTTAGT‑GTTCGGTTGAGGCCGAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGACAACGTTCAGTAATGCCCAGCCa > 1:204726/1‑239 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |