| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 658,098 | A→C | 21.6% | V88G (GTG→GGG) | crcB ← | fluoride efflux transporter CrcB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 658,098 | 0 | A | C | 21.6% | 299.7 / 14.8 | 121 | V88G (GTG→GGG) | crcB | fluoride efflux transporter CrcB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (65/26); new base C (2/27); total (67/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |