| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 21,017 | T→C | 6.6% | N21S (AAC→AGC) | rpsT ← | 30S ribosomal protein S20 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 21,017 | 0 | T | C | 6.6% | 672.6 / 24.6 | 207 | N21S (AAC→AGC) | rpsT | 30S ribosomal protein S20 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/114); new base C (5/9); total (84/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCGGGCTTTTTCACAAAGCTTCAGCAAATTGGCGATTAAGCCAGTTTGTTGATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACAGCTTTTCCGC > NC_007779/20780‑21254 | tcgGGCTTTTTCACCAAGCTTCAGCATATTGGCGATTAAGCCCGTTTGTTGATCTGTTCAGTCAGGTTAGCCTTATGACTTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCATACCTTTAGCAGCCTGACTGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTTCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGtt < 2:261640/238‑1 (MQ=255) ttCACAAAGCTTCAGAAAATTGTCGATTAAGCCAGTTTGTTTATCTGTGCAGTCATGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGCAGTAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTTGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATTCTTTCTTGATGAAAGTACGAATCATCTAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACg < 2:388392/239‑1 (MQ=255) ttGGCGATTAAGCCAGTTTGTTGATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATg > 1:269100/1‑239 (MQ=255) cGATTAAGCCAGTTTGTTGATCTGTGCAGTCGGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGgcg < 2:816518/238‑1 (MQ=255) tttGTTGATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTg > 2:1739890/1‑239 (MQ=255) gttgATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGAtt < 2:269100/239‑1 (MQ=255) ttgATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGAttt > 1:1849783/1‑239 (MQ=255) tgATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGAttt < 1:553408/238‑1 (MQ=255) tgATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTg > 2:252283/1‑239 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 2:1046870/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 1:1692367/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 1:1109659/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 1:367922/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 2:1227890/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 1:97180/1‑238 (MQ=255) tgCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCCTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTa > 1:1816150/1‑238 (MQ=255) aGTCTGGTTGGCTTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTCGGGTTCTGACCTTTGGCGGCCTGGCGGTCCACGACCGGTTGCGTTTCGTTAAATGTGTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCGGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTGTTGGTGAAAGTACGCATCATAGAGCGTCGGCGTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTGAGCTGATTTGATATTAGcc < 2:1316851/238‑1 (MQ=255) aGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGcc < 1:252283/238‑1 (MQ=255) aGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGcc < 1:34741/238‑1 (MQ=255) catgTTAGGCTTCTGACGTGCAGTTTTGTTGTTGTGGAGCAGACCTTGTGCAGCCTGACGGTCTATGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTATGTGCAGCAGCTTTCTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTATTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGTCTTGAGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGATTCTTAGCTGATTTGATATTATCCa < 2:1177167/233‑1 (MQ=255) ttAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa > 1:502924/1‑239 (MQ=255) ttAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa > 1:194401/1‑239 (MQ=255) ttAGCCTTACGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGTAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCTAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa > 2:120704/1‑239 (MQ=255) taaccgtgtGACGTGCCGCTTTGTTTTGGTGGATCAGCCCTTTAGCATCCGGCCGGGCCACGATCGGTTGCCTTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCATCAGCTTTGTCGCCTGCGTCGATAGCTGCGTATACTTGCGTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa < 2:228332/230‑1 (MQ=255) tAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa < 1:809889/238‑1 (MQ=255) tAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa < 1:1131907/238‑1 (MQ=255) tAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCa < 1:1720939/238‑1 (MQ=255) cTTATGACGTGCAGCTTTTTTTTTGTTGATCAGACCTTTTGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTcc < 2:1031810/239‑1 (MQ=255) cTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTc > 2:883669/1‑238 (MQ=255) cTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTcc < 1:1238946/239‑1 (MQ=255) aTGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCaa < 2:539888/239‑1 (MQ=255) tGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTTGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCaaa > 2:302325/1‑239 (MQ=255) tGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGGTAGGCTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAACGTACGCAGCATAGAGCGACGGCTTGCGTTTCTCTTACGAGCCTTTTCAGCCTGAATGGAGCGCTTCTTCGCTGATTTGATATTATCCAAGGTCCAACTCCCaaa > 2:589692/1‑239 (MQ=255) tGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTc > 1:1665888/1‑228 (MQ=255) gACGTGCAGTTTTGTTTTTGTGGATCCGACCTTTATCGGCCTGACGGTTCACGATCGGTTGCATTTGGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCATCTTCGATAGCTGTGTATCATTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGTCGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAt < 2:1385634/239‑1 (MQ=255) gACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAt < 1:1095378/239‑1 (MQ=255) tcGTGCAGTTTTGTTTTTGTGGATCAGTCCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGTTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAt < 2:1063206/237‑1 (MQ=255) tGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATgtgt > 2:1946802/1‑239 (MQ=255) gCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATgtgt < 2:1326723/238‑1 (MQ=255) gCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATgtgt < 1:1295513/238‑1 (MQ=255) gCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGtt < 1:1504286/239‑1 (MQ=255) ccgCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGtt < 2:1535669/236‑1 (MQ=255) tttGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCtat < 1:1556590/238‑1 (MQ=255) ttttGTTGATCAGATTATTTGCAGCCTGACGGTCCACGATCAGTTACATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCATCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACTGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGTCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGAc < 2:1765926/239‑1 (MQ=255) ttttGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGAc < 1:211450/239‑1 (MQ=255) ttttGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAACCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGAc < 2:367922/239‑1 (MQ=255) aTCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCaa < 1:1353731/238‑1 (MQ=255) tCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAAt > 1:1756781/1‑215 (MQ=255) tAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGAGATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGaa > 1:1040530/1‑239 (MQ=255) ggcCTGCCGGTCCACGGTCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCCTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg < 2:1936217/238‑1 (MQ=255) ggcCTGACGGTCCCTGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTCGCGCCAGCTTGGATAGCTGCGTATTCTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGTGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg < 2:1099937/238‑1 (MQ=255) ccTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAg < 1:1607690/165‑1 (MQ=255) ccTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGGGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAg > 2:1607690/1‑165 (MQ=255) cTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg < 1:1817325/236‑1 (MQ=255) cTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATg < 1:1017140/236‑1 (MQ=255) cACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCaa > 2:1890468/1‑212 (MQ=255) cACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCaa < 1:1890468/212‑1 (MQ=255) gTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACt > 2:520691/1‑175 (MQ=255) gTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACt < 1:520691/175‑1 (MQ=255) gTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATACGCCCTTTTAGCCTTCTTTTg > 1:752924/1‑238 (MQ=255) tCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGAt < 1:302325/239‑1 (MQ=255) cGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTcc < 1:1201698/168‑1 (MQ=255) cGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTcc > 2:1201698/1‑168 (MQ=255) aaaTGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTtgtg < 2:97180/239‑1 (MQ=255) ttCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATaa > 2:1110739/1‑239 (MQ=255) tCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAg < 1:589692/239‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAgc > 1:611683/1‑239 (MQ=255) agcagcTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATATTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGGCGtt > 2:363054/1‑239 (MQ=255) agcagcTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTtgtg > 2:623169/1‑224 (MQ=255) ttGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAAtgtg > 1:465186/1‑238 (MQ=255) gTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCg < 1:538317/239‑1 (MQ=255) gcccgcatggATAGGTGCGGATACTTGCTTGATGAAAGTACGCAGCATAGAGCGGCGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCGTTACAGACTGAAGGGGGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTGTATGGACAATGCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGc < 2:1243396/229‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATTCTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 1:816393/238‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATCCTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 1:1705400/238‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 2:1687519/238‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 1:526292/238‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 2:465186/238‑1 (MQ=255) cAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCAc < 1:120704/238‑1 (MQ=255) aGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGACGTTAATGTGCCGGCACt > 2:1572625/1‑238 (MQ=255) ttCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCg < 2:1849783/237‑1 (MQ=255) tGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGCGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGa > 1:63302/1‑239 (MQ=255) gCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGAt > 1:1063219/1‑239 (MQ=255) cTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGAt > 1:147772/1‑238 (MQ=255) cTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTAGTTACGTAGTGATGGCGCAGGAt > 2:1371238/1‑238 (MQ=255) cTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTAAGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGCGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGAGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGAtt > 2:734823/1‑239 (MQ=255) tgatgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCATGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCATCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGCGTTGTGAAAATAACGGACGTTAATATCCCGGCACTCGTAACGTAGTCATGGCGCAGGCTTCt > 2:1405812/1‑239 (MQ=255) gatgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTa < 2:1657291/239‑1 (MQ=255) tgaAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTAcc < 1:1403124/239‑1 (MQ=255) aGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGCTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCt > 1:1373324/1‑239 (MQ=255) gCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCgg < 1:1655702/239‑1 (MQ=255) tcatAGGGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTTGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATAGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGGCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAGTAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGgt < 2:68072/239‑1 (MQ=255) tcatAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGgt < 2:866416/239‑1 (MQ=255) agagCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGa > 2:1580351/1‑239 (MQ=255) gACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGCTATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGGGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCACTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACa > 2:1723630/1‑239 (MQ=255) aCGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACa > 1:922692/1‑238 (MQ=255) cGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCaa < 1:188363/109‑1 (MQ=255) cGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCgg < 2:1670245/225‑1 (MQ=255) cGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCgg > 1:1670245/1‑225 (MQ=255) cGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACa > 1:985215/1‑237 (MQ=255) gCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACAGCTTTTcc < 2:1432858/239‑1 (MQ=255) | GCGGGCTTTTTCACAAAGCTTCAGCAAATTGGCGATTAAGCCAGTTTGTTGATCTGTGCAGTCAGGTTAGCCTTATGACGTGCAGCTTTGTTTTTGTGGATCAGACCTTTAGCAGCCTGACGGTCCACGATCGGTTGCATTTCGTTAAATGCTTTCTGTGCAGCAGCTTTGTCGCCAGCTTCGATAGCTGCGTATACTTTCTTGATGAAAGTACGCATCATAGAGCGACGGCTTGCGTTGTGCTTACGAGCCTTTTCAGACTGAATGGCGCGCTTCTTAGCTGATTTGATATTAGCCAAGGTCCAACTCCCAAATGTGTTCTATATGGACAATTCAAAGGCCGAGGAATATGCCCTTTTAGCCTTCTTTTGTCAATGGATTTGTGCAAATAAGCGCCGTTAATGTGCCGGCACTCGTTACGTAGTGATGGCGCAGGATTCTACCAGCTTGCGGGGTGTGAATACAGCTTTTCCGC > NC_007779/20780‑21254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |