| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 773,431 | A→G | 28.0% | T518A (ACT→GCT) | cydA → | cytochrome ubiquinol oxidase subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 773,431 | 0 | A | G | 28.0% | 222.4 / 95.5 | 135 | T518A (ACT→GCT) | cydA | cytochrome ubiquinol oxidase subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/39); new base G (21/17); total (79/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
GGGCTGGTTCGTGGCTGAATATGGCCGCCAACCGTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTCGACATGGGGGTGGGCATGCTCACCCGTTTCCTCGGTCGTAACGACACCGAGCGTCGAATTATGATTAACTCCATTGCACCACACTGGGACGGTAACCAGGTTTGGCTGATCACCGCGGGCG > NC_007779/773196‑773668 | gggCTGGTTCGTGGCTGAATATGGCCGCCAACCGTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGactgct < 2:1787297/238‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |