| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 821,688 | A→G | 100% | E158E (GAA→GAG) | Y75_RS04105 → | Bax inhibitor‑1/YccA family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 821,688 | 0 | A | G | 100.0% | 705.2 / NA | 194 | E158E (GAA→GAG) | Y75_RS04105 | Bax inhibitor‑1/YccA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (91/103); total (91/103) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CCATCGCGGGCGTAATATATCTGTTTTTACTCTCTTTGGTGGCGATTGTCGTTGCAAGTTTAGTTCCTGTATATGCCATTATCATCGTGTTCAGCACTGCGGGCGCGATGTTTTTAATCAGTATGCTGGCCGGTTTATTATTTAATGTTGATCCTGGTTCT‑CACCGTTTTATCATTATGATGACGTTGACA‑GGGTTGG‑CCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAACGGCCCATTTGGATAATAAGTTGCTTAATGATTGTGTTATGGTCAGGCATTATCTCGCATGGACGAAATAAGCTCCTTGAA‑TTGGCGGGGAAATGCCATAGTGAAGAGTTGTGGAGTCCGGTTCGTTGCGCTTTTACAGGTGCATTAACACTCTATTACTATTTTATCGGCTTCTTTGGGATACTTGCCGCGATAGCTATAACGCTTGTCTGGCAAAGGCATACGCGTTTTTTTC > NC_007779/821453‑821923 | ccATCGCGGGCGTAATATATCTGTTTTTACTCTCTTTGGTGGCGATTGTCGTTGCAAGTTTAGTTCCTGTATATGCCATTATCATCGTGTTCAGCACTGCGGGCGCGATGTTTTTAATCAGTATGCTGGCCGGTTTATTATTTAATGTTGATCCTGGTTCT‑CACCGTTTTATCATTATGATGACGTTGACA‑GGGTTGG‑CCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAGCg > 1:153754/1‑238 (MQ=255) cATCGCGGGCGTAATATATCTGTTTTTACTCTCTTTGGTGGCGATTGTCGTTGCAAGTTTAGTTCCTGTATATGCCATTATCATCGTGTTCAGCACTGCGGGCGCGATGTTTTTAATCAGTATGCTGGCCGGTTTATTATTTAATGTTGATCCTGGTTCT‑CACCGTTTTATCATTATGATGACGTTGACA‑GGGTTGG‑CCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAGCgg < 1:1044406/238‑1 (MQ=255) cATCGCGGGCGTAATATATCTGTTTTTACTCTCTTTGGTGGCGATTGTCGTTGCAAGTTTAGTTCCTGTATATGCCATTATCATCGTGTTCAGCACTGCGGGCGCGATGTTTTTAATCAGTATGCTGGCCGGTTTATTATTTAATGTTGATCCTGGTTCT‑CACCGTTTTATCATTATGATGACGTTGACA‑GGGTTGG‑CCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAGCgg < 1:1921823/238‑1 (MQ=255) gggCGTAATATATCTGTTTTTACTCTCTTTGGTGGCGATTGTCGTTGCAAGTTTAGTTCCTGTATATGCCATTATCATCGTGTTCAGCACTGCGGGCGCGATGTTTTTAATCAGTATGCTGGCCGGTTTATTATTTAATGTTGATCCTGGTTCT‑CACCGTTTTATCATTATGATGACGTTGACA‑GGGTTGG‑CCCTGGTAATCATCGTGAATGCGGCATTAATGAGTGAGCGGCCCAtt < 1:1006447/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |