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AGCGGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCCCAGCCCGGTAAAAGGACCCTCCAGCTTTTTTTGCTGTCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCCCCGGC > 2:1855548/1‑239 GGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGTGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCA < 1:1289162/237‑1 GGCTAAAAGTTCGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGT < 1:2143420/239‑1 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CGATTCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGAT < 2:1993286/130‑1 TCAGACAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTG < 2:857170/239‑1 CAAGCTTATTTCAACTTTTTTACATGTTAGTGTGAAATTGGGTCTCGTTTCATACGATTCGTTTATGCCAGCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACCGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGT < 2:176747/238‑1 CAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGT < 1:1873203/238‑1 CAAGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTAGTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGT < 1:1403204/238‑1 AGCTTATTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACT < 2:1338240/239‑1 TTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAA > 2:1717718/1‑73 TTACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAA < 1:1717718/73‑1 TACAACTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAAAGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGGTGATGGAGGTGATTGTTATACCGACAGTA > 2:1378765/1‑239 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CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCA > 1:1054266/1‑203 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAAAGGCAGTTGATGGGGTTGACTGGTGTACGGACAGTAGgggg > 2:1755164/1‑235 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAG > 2:1497500/1‑185 CTTTTTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGGTTTTACCACAGCAGGGGAAAAGAGAAATACAGCTTTTTTTGCTGGCTGTCGGCAAACGGGGGAGGAAGAGCAAACAACGGCTGTTGGTGGGGTGGATTGGAGGAATGGCAGGTGCGCa > 2:74036/1‑238 TTTACATTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCTACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCTTTTATGCCACAGCCGGGGTAAAGGAACTTTCATCTTTTTTTTCTGGCTTTCGTCCAACGGGAGAGGAAGAGACACCAACGGCAGGTGATGGAGTTGATTGTAGTAGCTACAGTAGCCCGGgcc > 2:1964034/1‑236 TTTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGTTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGC < 1:731970/239‑1 TTTATTGTGAAATTGGGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCC > 1:1597941/1‑239 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaaattggGTCGCGTTTCATACGATTCGGTTATGCCATCGACGCGTAAAGGTTTTTAATGGTTTCCCGTAACCAGACGATCTTCGGATTATGGCTGTT‑CCGTTTATGCCACAGCAGGGTAAAAGGAACTTCCAGCTTTTTTTGCTGGCTTTCGTCAAACGGGAGAGGAAGAGCAACCAACGGCAGTTGATGGAGTTGATTGTAGTACTGACAGTAGCGCGGCGCGGTCGCCAGTAGCAGAT > NC_007779/3744272‑3744504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |